The transcription-related DNA damage response

Informacje na temat projektu

TRANSDAM

Identyfikator umowy o grant: 693327

DOI 10.3030/693327

Projekt został zamknięty

Data podpisania przez KE 27 Czerwca 2016

Data rozpoczęcia 1 Września 2016

Data zakończenia 28 Lutego 2022

Finansowanie w ramach

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Koszt całkowity € 2 499 988,00

Wkład UE € 2 499 988,00

Koordynowany przez

KOBENHAVNS UNIVERSITET
Denmark

Publikacje

Peer reviewed articles (17)

Evidence That STK19 Is Not an NRAS-dependent Melanoma Driver

Autorzy: Marta Rodríguez-Martínez, Thierry Boissiére, Melvin Noe Gonzalez, Kevin Litchfield, Richard Mitter, Jane Walker, Svend Kjœr, Mohamed Ismail, Julian Downward, Charles Swanton, Jesper Q. Svejstrup
Opublikowane w: Cell, Numer 181/6, 2020, Strona(/y) 1395-1405.e11, ISSN 0092-8674
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2020.04.014

The ASC-1 Complex Disassembles Collided Ribosomes

Autorzy: Szymon Juszkiewicz, Shaun H. Speldewinde, Li Wan, Jesper Q. Svejstrup, Ramanujan S. Hegde
Opublikowane w: Molecular Cell, Numer 79/4, 2020, Strona(/y) 603-614.e8, ISSN 1097-2765
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2020.06.006

Translation stress and collided ribosomes are co-activators of cGAS

Autorzy: Li Wan; Szymon Juszkiewicz; Daniel Blears; Prashanth Kumar Bajpe; Zhong Han; Zhong Han; Peter Faull; Richard Mitter; Aengus Stewart; Ambrosius P. Snijders; Ramanujan S. Hegde; Jesper Q. Svejstrup; Jesper Q. Svejstrup
Opublikowane w: Molecular Cell, Numer 2, 2021, ISSN 1097-4164
Wydawca: Elsevier
DOI: 10.1016/j.molcel.2021.05.018

Regulation of the RNAPII Pool Is Integral to the DNA Damage Response

Autorzy: Ana Tufegdžić Vidaković, Richard Mitter, Gavin P. Kelly, Michelle Neumann, Michelle Harreman, Marta Rodríguez-Martínez, Anna Herlihy, Juston C. Weems, Stefan Boeing, Vesela Encheva, Liam Gaul, Laura Milligan, David Tollervey, Ronald C. Conaway, Joan W. Conaway, Ambrosius P. Snijders, Aengus Stewart, Jesper Q. Svejstrup
Opublikowane w: Cell, Numer 180/6, 2020, Strona(/y) 1245-1261.e21, ISSN 0092-8674
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2020.02.009

Multiplex Cell Fate Tracking by Flow Cytometry

Autorzy: Marta Rodríguez-Martínez, Stephanie A. Hills, John F. X. Diffley, Jesper Q. Svejstrup
Opublikowane w: Methods and Protocols, Numer 3/3, 2020, Strona(/y) 50, ISSN 2409-9279
Wydawca: MDPI
DOI: 10.3390/mps3030050

Transcription-coupled repair and the transcriptional response to UV-Irradiation.

Autorzy: Liam Gaul; Jesper Q. Svejstrup
Opublikowane w: DNA Repair, Numer 4, 2021, ISSN 1568-7864
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.dnarep.2021.103208

Annotation matters: validating the discovery of cancer drivers

Autorzy: Marta Rodríguez-Martínez, Jesper Q. Svejstrup
Opublikowane w: Molecular & Cellular Oncology, Numer 7/6, 2020, Strona(/y) 1806679, ISSN 2372-3556
Wydawca: Taylor and Francis
DOI: 10.1080/23723556.2020.1806679

CDK13 cooperates with CDK12 to control global RNA polymerase II processivity

Autorzy: Zheng Fan, Jennifer R. Devlin, Simon J. Hogg, Maria A. Doyle, Paul F. Harrison, Izabela Todorovski, Leonie A. Cluse, Deborah A. Knight, Jarrod J. Sandow, Gareth Gregory, Andrew Fox, Traude H. Beilharz, Nicholas Kwiatkowski, Nichollas E. Scott, Ana Tufegdzic Vidakovic, Gavin P. Kelly, Jesper Q. Svejstrup, Matthias Geyer, Nathanael S. Gray, Stephin J. Vervoort, Ricky W. Johnstone
Opublikowane w: Science Advances, Numer 6/18, 2020, Strona(/y) eaaz5041, ISSN 2375-2548
Wydawca: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/sciadv.aaz5041

Cockayne syndrome B protein regulates recruitment of the Elongin A ubiquitin ligase to sites of DNA damage

Autorzy: Juston C. Weems, Brian D. Slaughter, Jay R. Unruh, Stefan Boeing, Shawn M. Hall, Merry B. McLaird, Takashi Yasukawa, Teijiro Aso, Jesper Q. Svejstrup, Joan W. Conaway, Ronald C. Conaway
Opublikowane w: Journal of Biological Chemistry, Numer 292/16, 2017, Strona(/y) 6431-6437, ISSN 0021-9258
Wydawca: American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI: 10.1074/jbc.C117.777946

UV Irradiation Induces a Non-coding RNA that Functionally Opposes the Protein Encoded by the Same Gene

Autorzy: Laura Williamson, Marco Saponaro, Stefan Boeing, Philip East, Richard Mitter, Theodoros Kantidakis, Gavin P. Kelly, Anna Lobley, Jane Walker, Bradley Spencer-Dene, Michael Howell, Aengus Stewart, Jesper Q. Svejstrup
Opublikowane w: Cell, Numer 168/5, 2017, Strona(/y) 843-855.e13, ISSN 0092-8674
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2017.01.019

The Cellular Response to Transcription-Blocking DNA Damage

Autorzy: Lea H. Gregersen, Jesper Q. Svejstrup
Opublikowane w: Trends in Biochemical Sciences, Numer 43/5, 2018, Strona(/y) 327-341, ISSN 0968-0004
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.tibs.2018.02.010

A Ubiquitin-Binding Domain that Binds a Structural Fold Distinct from that of Ubiquitin

Autorzy: Michael Lim, Joseph A. Newman, Hannah L. Williams, Laura Masino, Hazel Aitkenhead, Angeline E. Gravard, Opher Gileadi, Jesper Q. Svejstrup
Opublikowane w: Structure, Numer 27/8, 2019, Strona(/y) 1316-1325.e6, ISSN 2352-0124
Wydawca: Elsevier Limited

Genome-wide reconstitution of chromatin transactions reveals that RSC preferentially disrupts H2AZ-containing nucleosomes

Autorzy: Aylin Cakiroglu, Cedric R. Clapier, Andreas H. Ehrensberger, Elodie Darbo, Bradley R. Cairns, Nicholas M. Luscombe, Jesper Q. Svejstrup
Opublikowane w: Genome Research, Numer 29/6, 2019, Strona(/y) 988-998, ISSN 1088-9051
Wydawca: Cold Spring Harbor Laboratory Press
DOI: 10.1101/gr.243139.118

SCAF4 and SCAF8, mRNA Anti-Terminator Proteins

Autorzy: Lea H. Gregersen, Richard Mitter, Alejandro P. Ugalde, Takayuki Nojima, Nicholas J. Proudfoot, Reuven Agami, Aengus Stewart, Jesper Q. Svejstrup
Opublikowane w: Cell, Numer 177/7, 2019, Strona(/y) 1797-1813.e18, ISSN 0092-8674
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2019.04.038

Elongation Factor TFIIS Prevents Transcription Stress and R-Loop Accumulation to Maintain Genome Stability

Autorzy: Diana Zatreanu, Zhong Han, Richard Mitter, Emanuela Tumini, Hannah Williams, Lea Gregersen, A. Barbara Dirac-Svejstrup, Stefania Roma, Aengus Stewart, Andres Aguilera, Jesper Q. Svejstrup
Opublikowane w: Molecular Cell, Numer 76/1, 2019, Strona(/y) 57-69.e9, ISSN 1097-2765
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2019.07.037

Analysis of RNA polymerase II ubiquitylation and proteasomal degradation

Autorzy: Ana Tufegdzic Vidakovic, Michelle Harreman, A. Barbara Dirac-Svejstrup, Stefan Boeing, Anindya Roy, Vesela Encheva, Michelle Neumann, Marcus Wilson, Ambrosius P. Snijders, Jesper Q. Svejstrup
Opublikowane w: Methods, Numer 159-160, 2019, Strona(/y) 146-156, ISSN 1046-2023
Wydawca: Academic Press
DOI: 10.1016/j.ymeth.2019.02.005

DDI2 Is a Ubiquitin-Directed Endoprotease Responsible for Cleavage of Transcription Factor NRF1

Autorzy: A. Barbara Dirac-Svejstrup, Jane Walker, Peter Faull, Vesela Encheva, Vyacheslav Akimov, Michele Puglia, David Perkins, Sandra Kümper, Suchete S. Hunjan, Blagoy Blagoev, Ambrosius P. Snijders, David J. Powell, Jesper Q. Svejstrup
Opublikowane w: Molecular Cell, Numer 79/2, 2020, Strona(/y) 332-341.e7, ISSN 1097-2765
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2020.05.035