The transcription-related DNA damage response

Informazioni relative al progetto

TRANSDAM

ID dell’accordo di sovvenzione: 693327

DOI

10.3030/693327

Progetto chiuso

Data della firma CE 27 Giugno 2016

Data di avvio 1 Settembre 2016

Data di completamento 28 Febbraio 2022

Finanziato da

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Costo totale

€ 2 499 988,00

Contributo UE

€ 2 499 988,00

Coordinato da

KOBENHAVNS UNIVERSITET
Denmark

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Pubblicazioni

Peer reviewed articles (17)

Evidence That STK19 Is Not an NRAS-dependent Melanoma Driver

Autori: Marta Rodríguez-Martínez, Thierry Boissiére, Melvin Noe Gonzalez, Kevin Litchfield, Richard Mitter, Jane Walker, Svend Kjœr, Mohamed Ismail, Julian Downward, Charles Swanton, Jesper Q. Svejstrup
Pubblicato in: Cell, Numero 181/6, 2020, Pagina/e 1395-1405.e11, ISSN 0092-8674
Editore: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2020.04.014

The ASC-1 Complex Disassembles Collided Ribosomes

Autori: Szymon Juszkiewicz, Shaun H. Speldewinde, Li Wan, Jesper Q. Svejstrup, Ramanujan S. Hegde
Pubblicato in: Molecular Cell, Numero 79/4, 2020, Pagina/e 603-614.e8, ISSN 1097-2765
Editore: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2020.06.006

Translation stress and collided ribosomes are co-activators of cGAS

Autori: Li Wan; Szymon Juszkiewicz; Daniel Blears; Prashanth Kumar Bajpe; Zhong Han; Zhong Han; Peter Faull; Richard Mitter; Aengus Stewart; Ambrosius P. Snijders; Ramanujan S. Hegde; Jesper Q. Svejstrup; Jesper Q. Svejstrup
Pubblicato in: Molecular Cell, Numero 2, 2021, ISSN 1097-4164
Editore: Elsevier
DOI: 10.1016/j.molcel.2021.05.018

Regulation of the RNAPII Pool Is Integral to the DNA Damage Response

Autori: Ana Tufegdžić Vidaković, Richard Mitter, Gavin P. Kelly, Michelle Neumann, Michelle Harreman, Marta Rodríguez-Martínez, Anna Herlihy, Juston C. Weems, Stefan Boeing, Vesela Encheva, Liam Gaul, Laura Milligan, David Tollervey, Ronald C. Conaway, Joan W. Conaway, Ambrosius P. Snijders, Aengus Stewart, Jesper Q. Svejstrup
Pubblicato in: Cell, Numero 180/6, 2020, Pagina/e 1245-1261.e21, ISSN 0092-8674
Editore: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2020.02.009

Multiplex Cell Fate Tracking by Flow Cytometry

Autori: Marta Rodríguez-Martínez, Stephanie A. Hills, John F. X. Diffley, Jesper Q. Svejstrup
Pubblicato in: Methods and Protocols, Numero 3/3, 2020, Pagina/e 50, ISSN 2409-9279
Editore: MDPI
DOI: 10.3390/mps3030050

Transcription-coupled repair and the transcriptional response to UV-Irradiation.

Autori: Liam Gaul; Jesper Q. Svejstrup
Pubblicato in: DNA Repair, Numero 4, 2021, ISSN 1568-7864
Editore: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.dnarep.2021.103208

Annotation matters: validating the discovery of cancer drivers

Autori: Marta Rodríguez-Martínez, Jesper Q. Svejstrup
Pubblicato in: Molecular & Cellular Oncology, Numero 7/6, 2020, Pagina/e 1806679, ISSN 2372-3556
Editore: Taylor and Francis
DOI: 10.1080/23723556.2020.1806679

CDK13 cooperates with CDK12 to control global RNA polymerase II processivity

Autori: Zheng Fan, Jennifer R. Devlin, Simon J. Hogg, Maria A. Doyle, Paul F. Harrison, Izabela Todorovski, Leonie A. Cluse, Deborah A. Knight, Jarrod J. Sandow, Gareth Gregory, Andrew Fox, Traude H. Beilharz, Nicholas Kwiatkowski, Nichollas E. Scott, Ana Tufegdzic Vidakovic, Gavin P. Kelly, Jesper Q. Svejstrup, Matthias Geyer, Nathanael S. Gray, Stephin J. Vervoort, Ricky W. Johnstone
Pubblicato in: Science Advances, Numero 6/18, 2020, Pagina/e eaaz5041, ISSN 2375-2548
Editore: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/sciadv.aaz5041

Cockayne syndrome B protein regulates recruitment of the Elongin A ubiquitin ligase to sites of DNA damage

Autori: Juston C. Weems, Brian D. Slaughter, Jay R. Unruh, Stefan Boeing, Shawn M. Hall, Merry B. McLaird, Takashi Yasukawa, Teijiro Aso, Jesper Q. Svejstrup, Joan W. Conaway, Ronald C. Conaway
Pubblicato in: Journal of Biological Chemistry, Numero 292/16, 2017, Pagina/e 6431-6437, ISSN 0021-9258
Editore: American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI: 10.1074/jbc.C117.777946

UV Irradiation Induces a Non-coding RNA that Functionally Opposes the Protein Encoded by the Same Gene

Autori: Laura Williamson, Marco Saponaro, Stefan Boeing, Philip East, Richard Mitter, Theodoros Kantidakis, Gavin P. Kelly, Anna Lobley, Jane Walker, Bradley Spencer-Dene, Michael Howell, Aengus Stewart, Jesper Q. Svejstrup
Pubblicato in: Cell, Numero 168/5, 2017, Pagina/e 843-855.e13, ISSN 0092-8674
Editore: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2017.01.019

The Cellular Response to Transcription-Blocking DNA Damage

Autori: Lea H. Gregersen, Jesper Q. Svejstrup
Pubblicato in: Trends in Biochemical Sciences, Numero 43/5, 2018, Pagina/e 327-341, ISSN 0968-0004
Editore: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.tibs.2018.02.010

A Ubiquitin-Binding Domain that Binds a Structural Fold Distinct from that of Ubiquitin

Autori: Michael Lim, Joseph A. Newman, Hannah L. Williams, Laura Masino, Hazel Aitkenhead, Angeline E. Gravard, Opher Gileadi, Jesper Q. Svejstrup
Pubblicato in: Structure, Numero 27/8, 2019, Pagina/e 1316-1325.e6, ISSN 2352-0124
Editore: Elsevier Limited

Genome-wide reconstitution of chromatin transactions reveals that RSC preferentially disrupts H2AZ-containing nucleosomes

Autori: Aylin Cakiroglu, Cedric R. Clapier, Andreas H. Ehrensberger, Elodie Darbo, Bradley R. Cairns, Nicholas M. Luscombe, Jesper Q. Svejstrup
Pubblicato in: Genome Research, Numero 29/6, 2019, Pagina/e 988-998, ISSN 1088-9051
Editore: Cold Spring Harbor Laboratory Press
DOI: 10.1101/gr.243139.118

SCAF4 and SCAF8, mRNA Anti-Terminator Proteins

Autori: Lea H. Gregersen, Richard Mitter, Alejandro P. Ugalde, Takayuki Nojima, Nicholas J. Proudfoot, Reuven Agami, Aengus Stewart, Jesper Q. Svejstrup
Pubblicato in: Cell, Numero 177/7, 2019, Pagina/e 1797-1813.e18, ISSN 0092-8674
Editore: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2019.04.038

Elongation Factor TFIIS Prevents Transcription Stress and R-Loop Accumulation to Maintain Genome Stability

Autori: Diana Zatreanu, Zhong Han, Richard Mitter, Emanuela Tumini, Hannah Williams, Lea Gregersen, A. Barbara Dirac-Svejstrup, Stefania Roma, Aengus Stewart, Andres Aguilera, Jesper Q. Svejstrup
Pubblicato in: Molecular Cell, Numero 76/1, 2019, Pagina/e 57-69.e9, ISSN 1097-2765
Editore: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2019.07.037

Analysis of RNA polymerase II ubiquitylation and proteasomal degradation

Autori: Ana Tufegdzic Vidakovic, Michelle Harreman, A. Barbara Dirac-Svejstrup, Stefan Boeing, Anindya Roy, Vesela Encheva, Michelle Neumann, Marcus Wilson, Ambrosius P. Snijders, Jesper Q. Svejstrup
Pubblicato in: Methods, Numero 159-160, 2019, Pagina/e 146-156, ISSN 1046-2023
Editore: Academic Press
DOI: 10.1016/j.ymeth.2019.02.005

DDI2 Is a Ubiquitin-Directed Endoprotease Responsible for Cleavage of Transcription Factor NRF1

Autori: A. Barbara Dirac-Svejstrup, Jane Walker, Peter Faull, Vesela Encheva, Vyacheslav Akimov, Michele Puglia, David Perkins, Sandra Kümper, Suchete S. Hunjan, Blagoy Blagoev, Ambrosius P. Snijders, David J. Powell, Jesper Q. Svejstrup
Pubblicato in: Molecular Cell, Numero 79/2, 2020, Pagina/e 332-341.e7, ISSN 1097-2765
Editore: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2020.05.035