Pan-cancer functional evaluation of non-coding DNA mutations

Informations projet

PCFENCM

N° de convention de subvention: 703543

DOI

10.3030/703543

Projet clôturé le 31 Mai 2019

Date de signature de la CE 31 Mars 2016

Date de début 1 Janvier 2017

Date de fin 31 Decembre 2019

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions

Coût total

€ 251 857,80

Contribution de l’UE

€ 251 857,80

Coordonné par

THE CHANCELLOR MASTERS AND SCHOLARS OF THE UNIVERSITY OF CAMBRIDGE
United Kingdom

CORDIS fournit des liens vers les livrables publics et les publications des projets HORIZON.

Les liens vers les livrables et les publications des projets du 7e PC, ainsi que les liens vers certains types de résultats spécifiques tels que les jeux de données et les logiciels, sont récupérés dynamiquement sur OpenAIRE .

Publications

Peer reviewed articles (4)

Elucidating Compound Mechanism of Action and Predicting Cytotoxicity Using Machine Learning Approaches, Taking Prediction Confidence into Account

Auteurs: Georgios Drakakis, Isidro Cortés‐Ciriano, Ben Alexander‐Dann, Andreas Bender
Publié dans: Current Protocols in Chemical Biology, Numéro 11/3, 2019, ISSN 2160-4762
Éditeur: John Wiley and Sons Ltd
DOI: 10.1002/cpch.73

Accurate detection of mosaic variants in sequencing data without matched controls

Auteurs: Yanmei Dou, Minseok Kwon, Rachel E. Rodin, Isidro Cortés-Ciriano, Ryan Doan, Lovelace J. Luquette, Alon Galor, Craig Bohrson, Christopher A. Walsh, Peter J. Park
Publié dans: Nature Biotechnology, Numéro 38/3, 2020, Page(s) 314-319, ISSN 1087-0156
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41587-019-0368-8

Reliable Prediction Errors for Deep Neural Networks Using Test-Time Dropout

Auteurs: Isidro Cortés-Ciriano, Andreas Bender
Publié dans: Journal of Chemical Information and Modeling, Numéro 59/7, 2019, Page(s) 3330-3339, ISSN 1549-9596
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jcim.9b00297

Deep Confidence: A Computationally Efficient Framework for Calculating Reliable Prediction Errors for Deep Neural Networks

Auteurs: Isidro Cortés-Ciriano, Andreas Bender
Publié dans: Journal of Chemical Information and Modeling, Numéro 59/3, 2018, Page(s) 1269-1281, ISSN 1549-9596
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jcim.8b00542

Other (2)

KekuleScope: improved prediction of cancer cell line sensitivity using convolutional neural networks trained on compound images

Auteurs: Isidro Cortes Ciriano and Andreas Bender
Publié dans: 2018
Éditeur: bioArxiv

Comprehensive analysis of chromothripsis in 2,658 human cancers using whole-genome sequencing

Auteurs: Isidro Cortes-Ciriano, June-Koo Lee, Ruibin Xi, Dhawal Jain, Youngsook L Jung, Lixing Yang, Dmitry Gordenin, Leszek J Klimczak, Cheng-Zhong Zhang, David S Pellman, Peter J Park, PCAWG Structural Variation Working Group, ICGC/TCGA Pan-Cancer Analysis of Whole Genomes Network
Publié dans: 2018
Éditeur: bioRxiv
DOI: 10.1101/333617

Book chapters (1)

Chapter 5. Concepts and Applications of Conformal Prediction in Computational Drug Discovery

Auteurs: Isidro Cortés-Ciriano, Andreas Bender
Publié dans: Artificial Intelligence in Drug Discovery, 2020, Page(s) 63-101, ISBN 978-1-78801-547-9
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/9781788016841-00063