Pan-cancer functional evaluation of non-coding DNA mutations

Projektinformationen

PCFENCM

ID Finanzhilfevereinbarung: 703543

DOI

10.3030/703543

Das Projekt endete am 31 Mai 2019

EK-Unterschriftsdatum 31 März 2016

Startdatum 1 Januar 2017

Enddatum 31 Dezember 2019

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions

Gesamtkosten

€ 251 857,80

EU-Beitrag

€ 251 857,80

Koordiniert durch

THE CHANCELLOR MASTERS AND SCHOLARS OF THE UNIVERSITY OF CAMBRIDGE
United Kingdom

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Links zu Ergebnissen und Veröffentlichungen von RP7-Projekten sowie Links zu einigen Typen spezifischer Ergebnisse wie Datensätzen und Software werden dynamisch von OpenAIRE abgerufen.

Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (4)

Elucidating Compound Mechanism of Action and Predicting Cytotoxicity Using Machine Learning Approaches, Taking Prediction Confidence into Account

Autoren: Georgios Drakakis, Isidro Cortés‐Ciriano, Ben Alexander‐Dann, Andreas Bender
Veröffentlicht in: Current Protocols in Chemical Biology, Ausgabe 11/3, 2019, ISSN 2160-4762
Herausgeber: John Wiley and Sons Ltd
DOI: 10.1002/cpch.73

Accurate detection of mosaic variants in sequencing data without matched controls

Autoren: Yanmei Dou, Minseok Kwon, Rachel E. Rodin, Isidro Cortés-Ciriano, Ryan Doan, Lovelace J. Luquette, Alon Galor, Craig Bohrson, Christopher A. Walsh, Peter J. Park
Veröffentlicht in: Nature Biotechnology, Ausgabe 38/3, 2020, Seite(n) 314-319, ISSN 1087-0156
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41587-019-0368-8

Reliable Prediction Errors for Deep Neural Networks Using Test-Time Dropout

Autoren: Isidro Cortés-Ciriano, Andreas Bender
Veröffentlicht in: Journal of Chemical Information and Modeling, Ausgabe 59/7, 2019, Seite(n) 3330-3339, ISSN 1549-9596
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jcim.9b00297

Deep Confidence: A Computationally Efficient Framework for Calculating Reliable Prediction Errors for Deep Neural Networks

Autoren: Isidro Cortés-Ciriano, Andreas Bender
Veröffentlicht in: Journal of Chemical Information and Modeling, Ausgabe 59/3, 2018, Seite(n) 1269-1281, ISSN 1549-9596
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jcim.8b00542

Other (2)

KekuleScope: improved prediction of cancer cell line sensitivity using convolutional neural networks trained on compound images

Autoren: Isidro Cortes Ciriano and Andreas Bender
Veröffentlicht in: 2018
Herausgeber: bioArxiv

Comprehensive analysis of chromothripsis in 2,658 human cancers using whole-genome sequencing

Autoren: Isidro Cortes-Ciriano, June-Koo Lee, Ruibin Xi, Dhawal Jain, Youngsook L Jung, Lixing Yang, Dmitry Gordenin, Leszek J Klimczak, Cheng-Zhong Zhang, David S Pellman, Peter J Park, PCAWG Structural Variation Working Group, ICGC/TCGA Pan-Cancer Analysis of Whole Genomes Network
Veröffentlicht in: 2018
Herausgeber: bioRxiv
DOI: 10.1101/333617

Book chapters (1)

Chapter 5. Concepts and Applications of Conformal Prediction in Computational Drug Discovery

Autoren: Isidro Cortés-Ciriano, Andreas Bender
Veröffentlicht in: Artificial Intelligence in Drug Discovery, 2020, Seite(n) 63-101, ISBN 978-1-78801-547-9
Herausgeber: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/9781788016841-00063