Pan-cancer functional evaluation of non-coding DNA mutations

Informacje na temat projektu

PCFENCM

Identyfikator umowy o grant: 703543

DOI

10.3030/703543

Realizacja projektu zakończyła się 31 Maja 2019

Data podpisania przez KE 31 Marca 2016

Data rozpoczęcia 1 Stycznia 2017

Data zakończenia 31 Grudnia 2019

Finansowanie w ramach

• EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions

Koszt całkowity

€ 251 857,80

Wkład UE

€ 251 857,80

Koordynowany przez

THE CHANCELLOR MASTERS AND SCHOLARS OF THE UNIVERSITY OF CAMBRIDGE
United Kingdom

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Publikacje

Peer reviewed articles (4)

Elucidating Compound Mechanism of Action and Predicting Cytotoxicity Using Machine Learning Approaches, Taking Prediction Confidence into Account

Autorzy: Georgios Drakakis, Isidro Cortés‐Ciriano, Ben Alexander‐Dann, Andreas Bender
Opublikowane w: Current Protocols in Chemical Biology, Numer 11/3, 2019, ISSN 2160-4762
Wydawca: John Wiley and Sons Ltd
DOI: 10.1002/cpch.73

Accurate detection of mosaic variants in sequencing data without matched controls

Autorzy: Yanmei Dou, Minseok Kwon, Rachel E. Rodin, Isidro Cortés-Ciriano, Ryan Doan, Lovelace J. Luquette, Alon Galor, Craig Bohrson, Christopher A. Walsh, Peter J. Park
Opublikowane w: Nature Biotechnology, Numer 38/3, 2020, Strona(/y) 314-319, ISSN 1087-0156
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41587-019-0368-8

Reliable Prediction Errors for Deep Neural Networks Using Test-Time Dropout

Autorzy: Isidro Cortés-Ciriano, Andreas Bender
Opublikowane w: Journal of Chemical Information and Modeling, Numer 59/7, 2019, Strona(/y) 3330-3339, ISSN 1549-9596
Wydawca: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jcim.9b00297

Deep Confidence: A Computationally Efficient Framework for Calculating Reliable Prediction Errors for Deep Neural Networks

Autorzy: Isidro Cortés-Ciriano, Andreas Bender
Opublikowane w: Journal of Chemical Information and Modeling, Numer 59/3, 2018, Strona(/y) 1269-1281, ISSN 1549-9596
Wydawca: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jcim.8b00542

Other (2)

KekuleScope: improved prediction of cancer cell line sensitivity using convolutional neural networks trained on compound images

Autorzy: Isidro Cortes Ciriano and Andreas Bender
Opublikowane w: 2018
Wydawca: bioArxiv

Comprehensive analysis of chromothripsis in 2,658 human cancers using whole-genome sequencing

Autorzy: Isidro Cortes-Ciriano, June-Koo Lee, Ruibin Xi, Dhawal Jain, Youngsook L Jung, Lixing Yang, Dmitry Gordenin, Leszek J Klimczak, Cheng-Zhong Zhang, David S Pellman, Peter J Park, PCAWG Structural Variation Working Group, ICGC/TCGA Pan-Cancer Analysis of Whole Genomes Network
Opublikowane w: 2018
Wydawca: bioRxiv
DOI: 10.1101/333617

Book chapters (1)

Chapter 5. Concepts and Applications of Conformal Prediction in Computational Drug Discovery

Autorzy: Isidro Cortés-Ciriano, Andreas Bender
Opublikowane w: Artificial Intelligence in Drug Discovery, 2020, Strona(/y) 63-101, ISBN 978-1-78801-547-9
Wydawca: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/9781788016841-00063