Pan-cancer functional evaluation of non-coding DNA mutations

Informazioni relative al progetto

PCFENCM

ID dell’accordo di sovvenzione: 703543

DOI

10.3030/703543

Progetto concluso il 31 Maggio 2019

Data della firma CE 31 Marzo 2016

Data di avvio 1 Gennaio 2017

Data di completamento 31 Dicembre 2019

Finanziato da

• EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions

Costo totale

€ 251 857,80

Contributo UE

€ 251 857,80

Coordinato da

THE CHANCELLOR MASTERS AND SCHOLARS OF THE UNIVERSITY OF CAMBRIDGE
United Kingdom

CORDIS fornisce collegamenti ai risultati finali pubblici e alle pubblicazioni dei progetti ORIZZONTE.

I link ai risultati e alle pubblicazioni dei progetti del 7° PQ, così come i link ad alcuni tipi di risultati specifici come dataset e software, sono recuperati dinamicamente da .OpenAIRE .

Pubblicazioni

Peer reviewed articles (4)

Elucidating Compound Mechanism of Action and Predicting Cytotoxicity Using Machine Learning Approaches, Taking Prediction Confidence into Account

Autori: Georgios Drakakis, Isidro Cortés‐Ciriano, Ben Alexander‐Dann, Andreas Bender
Pubblicato in: Current Protocols in Chemical Biology, Numero 11/3, 2019, ISSN 2160-4762
Editore: John Wiley and Sons Ltd
DOI: 10.1002/cpch.73

Accurate detection of mosaic variants in sequencing data without matched controls

Autori: Yanmei Dou, Minseok Kwon, Rachel E. Rodin, Isidro Cortés-Ciriano, Ryan Doan, Lovelace J. Luquette, Alon Galor, Craig Bohrson, Christopher A. Walsh, Peter J. Park
Pubblicato in: Nature Biotechnology, Numero 38/3, 2020, Pagina/e 314-319, ISSN 1087-0156
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41587-019-0368-8

Reliable Prediction Errors for Deep Neural Networks Using Test-Time Dropout

Autori: Isidro Cortés-Ciriano, Andreas Bender
Pubblicato in: Journal of Chemical Information and Modeling, Numero 59/7, 2019, Pagina/e 3330-3339, ISSN 1549-9596
Editore: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jcim.9b00297

Deep Confidence: A Computationally Efficient Framework for Calculating Reliable Prediction Errors for Deep Neural Networks

Autori: Isidro Cortés-Ciriano, Andreas Bender
Pubblicato in: Journal of Chemical Information and Modeling, Numero 59/3, 2018, Pagina/e 1269-1281, ISSN 1549-9596
Editore: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jcim.8b00542

Other (2)

KekuleScope: improved prediction of cancer cell line sensitivity using convolutional neural networks trained on compound images

Autori: Isidro Cortes Ciriano and Andreas Bender
Pubblicato in: 2018
Editore: bioArxiv

Comprehensive analysis of chromothripsis in 2,658 human cancers using whole-genome sequencing

Autori: Isidro Cortes-Ciriano, June-Koo Lee, Ruibin Xi, Dhawal Jain, Youngsook L Jung, Lixing Yang, Dmitry Gordenin, Leszek J Klimczak, Cheng-Zhong Zhang, David S Pellman, Peter J Park, PCAWG Structural Variation Working Group, ICGC/TCGA Pan-Cancer Analysis of Whole Genomes Network
Pubblicato in: 2018
Editore: bioRxiv
DOI: 10.1101/333617

Book chapters (1)

Chapter 5. Concepts and Applications of Conformal Prediction in Computational Drug Discovery

Autori: Isidro Cortés-Ciriano, Andreas Bender
Pubblicato in: Artificial Intelligence in Drug Discovery, 2020, Pagina/e 63-101, ISBN 978-1-78801-547-9
Editore: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/9781788016841-00063