Mapping the retrotransposon-mediated layer of neuronal gene regulation in the human genome

Información del proyecto

PRIMATE-TE-IMPACT

Identificador del acuerdo de subvención: 716035

DOI

10.3030/716035

Proyecto cerrado

Fecha de la firma de la CE 14 Julio 2017

Fecha de inicio 1 Agosto 2017

Fecha de finalización 31 Enero 2023

Financiado con arreglo a

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coste total

€ 1 500 000,00

Aportación de la UE

€ 1 500 000,00

Coordinado por

UNIVERSITEIT VAN AMSTERDAM
Netherlands

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Publicaciones

Peer reviewed articles (6)

ZNF91 deletion in human embryonic stem cells leads to ectopic activation of SVA retrotransposons and up-regulation of KRAB zinc finger gene clusters

Autores: Nina Haring, Judith Roels, Frank M J Jacobs
Publicado en: Genome REsearch, Edición 2021 Apr; 31(4): 551–563, 2021, Página(s) 551–563, ISSN 1088-9051
Editor: Cold Spring Harbor Laboratory Press
DOI: 10.1101/gr.265348.120

Long Non-Coding RNAs in Neuronal Aging

Autores: Diana Pereira Fernandes, Mainá Bitar, Frank Jacobs, Guy Barry
Publicado en: Non-Coding RNA, Edición 4/2, 2018, Página(s) 12, ISSN 2311-553X
Editor: MDPI
DOI: 10.3390/ncrna4020012

Human-Specific NOTCH2NL Genes Affect Notch Signaling and Cortical Neurogenesis

Autores: Ian T. Fiddes, Gerrald A. Lodewijk, Meghan Mooring, Colleen M. Bosworth, Adam D. Ewing, Gary L. Mantalas, Adam M. Novak, Anouk van den Bout, Alex Bishara, Jimi L. Rosenkrantz, Ryan Lorig-Roach, Andrew R. Field, Maximilian Haeussler, Lotte Russo, Aparna Bhaduri, Tomasz J. Nowakowski, Alex A. Pollen, Max L. Dougherty, Xander Nuttle, Marie-Claude Addor, Simon Zwolinski, Sol Katzman, Arnold Kriegstein
Publicado en: Cell, Edición 173/6, 2018, Página(s) 1356-1369.e22, ISSN 0092-8674
Editor: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2018.03.051

Widespread correlation of KRAB zinc finger protein binding with brain-developmental gene expression patterns

Autores: Grace Farmiloe, Gerrald A. Lodewijk, Stijn F. Robben, Elisabeth J. van Bree, Frank M. J. Jacobs
Publicado en: Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences, Edición 375/1795, 2020, Página(s) 20190333, ISSN 0962-8436
Editor: Royal Society of London
DOI: 10.1098/rstb.2019.0333

Evolution of Human Brain Size-Associated NOTCH2NL Genes Proceeds toward Reduced Protein Levels.

Autores: Gerrald A Lodewijk; Diana Pereira Fernandes; Iraklis Vretzakis; Jeanne E. Savage; Frank M. J. Jacobs
Publicado en: Molecular Biology and evolution, 37(9). Oxford University Press, Edición 1, 2020, Página(s) 2531–2548, ISSN 1537-1719
Editor: Oxford University Press
DOI: 10.1093/molbev/msaa104

A hidden layer of structural variation in transposable elements reveals potential genetic modifiers in human disease-risk loci

Autores: "Elisabeth J van Bree # 1, Rita L F P Guimarães # 1 2 3, Mischa Lundberg 4, Elena R Blujdea 1, Jimi L Rosenkrantz 1, Fred T G White 1, Josse Poppinga 1, Paula Ferrer-Raventós 1, Anne-Fleur E Schneider 1, Isabella Clayton 1, David Haussler 5, Marcel J T Reinders 6, Henne Holstege 2 3 6 7, Adam D Ewing 4, Colette Moses 1, Frank M J Jacobs 1 7"
Publicado en: Genome Research, Edición Apr;32(4):656-670, 2021, Página(s) 656-670, ISSN 1088-9051
Editor: Cold Spring Harbor Laboratory Press
DOI: 10.1101/gr.275515.121