Ziel
The posttranslational modification of proteins with polyubiquitin regulates virtually all aspects of cell biology. This versatility arises from eight distinct linkage types between individual ubiquitin moieties in polyubiquitin, which co-exist in cells, are independently regulated, and eventually determine the fate of the modified protein. However, ubiquitin chain architecture can be highly complex, and the extent of ‘chain branching’ is unknown. Moreover, ubiquitin also undergoes phosphorylation and acetylation, which can dramatically alter its function.
A true appreciation of the complexity in the ubiquitin code can only be achieved when all above aspects are considered, and only then will it be possible to assign cellular readouts to distinct ubiquitination events and differentiate between ubiquitin signals in cells.
While the complexity of ubiquitination is daunting, work from many laboratories including my own has exemplified how basic biochemistry, a detailed understanding of mechanism and quantitative mass-spectrometry allows us to study, and eventually understand, the ubiquitin code.
In this proposal, new methods and approaches are outlined that will allow a detailed monitoring of polyubiquitin chain architectures from cellular samples (AIM 1), and also lead to an in depth understanding of additional posttranslational modifications, such as ubiquitin phosphorylation and acetylation in cells (AIM 2). Moreover, new research tools for unstudied K6- and K33-linked polyubiquitin will give insights into cellular roles for these linkage types (AIM 3). Our studies will focus on ubiquitination events on mitochondria leading to mitophagy, where unstudied K6-linked chains as well as phospho-ubiquitin are part of complex chain architectures, and mechanisms of signalling are still unclear. Our work will reveal fundamental principles in ubiquitination, and are of high medical relevance due to the links to Parkinson’s disease, infectious disease, and cancer.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
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Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
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Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
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Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
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ERC-COG - Consolidator Grant
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Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
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