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'Tissue is the issue': a multi-omics approach to improve prostate cancer diagnosis

CORDIS fournit des liens vers les livrables publics et les publications des projets HORIZON.

Les liens vers les livrables et les publications des projets du 7e PC, ainsi que les liens vers certains types de résultats spécifiques tels que les jeux de données et les logiciels, sont récupérés dynamiquement sur OpenAIRE .

Publications

Conference proceedings (3)
A0948 - Multiomics spatial mapping of lipid metabolism in prostate cancer

Auteurs: M.K. Andersen, S. Krossa, M. Elise, T. Viset, Ø. Størkersen, G.F. Giskeødegård, M.B. Rye, M-B. Tessem
Publié dans: European Urology, Numéro 1, 2022
Éditeur: Elsevier

A0942 - DNA methylation aberrations predicts recurrence both in tumor and normal appearing prostate tissue

Auteurs: C. Pedersen, E. Midtbust, S. Krossa, M.K. Andersen, T. Viset, Ø. Størkersen, G.F. Giskeødegård, M.B. Rye, M-B. Tessem
Publié dans: European Urology, Numéro 1, 2022
Éditeur: Elsevier

A0950 - Inflammatory chemokines upregulated in the tumor microenvironment of prostate cancer patients experiencing relapse after radical prostatectomy

Auteurs: S. Krossa, M.K. Andersen, E. Midtbust, T. Viset, Ø. Størkersen, G.F. Giskeødegård, M.B. Rye, M-B. Tessem,
Publié dans: European Urology, Numéro 1, 2022
Éditeur: Elsivier

Peer reviewed articles (19)
A0950 - Inflammatory chemokines upregulated in the tumor microenvironment of prostate cancer patients experiencing relapse after radical prostatectomy (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: S. Krossa, M.K. Andersen, E. Midtbust, T. Viset, Ø. Størkersen, G.F. Giskeødegård, M.B. Rye, M-B. Tessem,
Publié dans: European Urology, 2022, ISSN 0302-2838
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/s0302-2838(22)01025-9

Spatial transcriptomics reveals strong association between SFRP4 and extracellular matrix remodeling in prostate cancer (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Maria K. Andersen, Sebastian Krossa, Elise Midtbust, Christine A. Pedersen, Maximilian Wess, Therese S. Høiem, Trond Viset, Øystein Størkersen, Ingunn Nervik, Elise Sandsmark, Helena Bertilsson, Guro F. Giskeødegård, Morten B. Rye, May-Britt Tessem
Publié dans: Communications Biology, Numéro 7, 2024, ISSN 2399-3642
Éditeur: Nature portfolio
DOI: 10.1038/s42003-024-07161-x

DNA methylation changes in response to neoadjuvant chemotherapy are associated with breast cancer survival (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Christine Aaserød Pedersen; Maria Dung Cao; Thomas Fleischer; Morten B. Rye; Stian Knappskog; Hans Petter Eikesdal; Per Eystein Lønning; Jörg Tost; Vessela N. Kristensen; May-Britt Tessem; Guro F. Giskeødegård; Tone F. Bathen
Publié dans: Breast cancer Research, Numéro 1, 2022, ISSN 1465-542X
Éditeur: Springer NAture
DOI: 10.1186/s13058-022-01537-9

FunHoP: Enhanced Visualization and Analysis of Functionally Homologous Proteins in Complex Metabolic Networks (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Kjersti Rise, May-Britt Tessem, Finn Drabløs, Morten B. Rye
Publié dans: Genomics, Proteomics & Bioinformatics, Numéro 19, 2024, Page(s) 848-859, ISSN 1672-0229
Éditeur: Kexue Chubaneshe/Science Press
DOI: 10.1016/j.gpb.2021.03.003

The genes controlling normal function of citrate and spermine secretion are lost in aggressive prostate cancer and prostate model systems (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Morten Beck Rye, Sebastian Krossa, Martina Hall, Casper van Mourik, Tone F. Bathen, Finn Drabløs, May-Britt Tessem, Helena Bertilsson,
Publié dans: iScience, 2022, ISSN 2589-0042
Éditeur: Elsevier
DOI: 10.1016/j.isci.2022.104451

Spatial integration of multi-omics data from serial sections using the novel Multi-Omics Imaging Integration Toolset (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Maximilian Wess, Maria K Andersen, Elise Midtbust, Juan Carlos Cabellos Guillem, Trond Viset, Øystein Størkersen, Sebastian Krossa, Morten Beck Rye, May-Britt Tessem
Publié dans: GigaScience, Numéro 14, 2025, ISSN 2047-217X
Éditeur: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/gigascience/giaf035

Prediction of recurrence from metabolites and expression of TOP2A and EZH2 in prostate cancer patients treated with radiotherapy (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Ailin Falkmo Hansen; Therese Stork Høiem; Kirsten Margrete Selnæs; Anna Mary Bofin; Øystein Størkersen; Helena Bertilsson; Alan J. Wright; Guro Fanneløb Giskeødegård; Tone Frost Bathen; Morten Beck Rye; May‐Britt Tessem
Publié dans: NMR Biomed, Numéro 1, 2022, ISSN 0952-3480
Éditeur: John Wiley & Sons Inc.
DOI: 10.1002/nbm.4694

Spatial differentiation of metabolism in prostate cancer tissue by MALDI-TOF MSI (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Maria K. Andersen, Therese S. Høiem, Britt S. R. Claes, Benjamin Balluff, Marta Martin-Lorenzo, Elin Richardsen, Sebastian Krossa, Helena Bertilsson, Ron M. A. Heeren, Morten B. Rye, Guro F. Giskeødegård, Tone F. Bathen, May-Britt Tessem
Publié dans: Cancer & Metabolism, Numéro 9/1, 2021, ISSN 2049-3002
Éditeur: BMC Springer NAture
DOI: 10.1186/s40170-021-00242-z

A simple preparation protocol for shipping and storage of tissue sections for laser ablation-inductively coupled plasma-mass spectrometry imaging (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Rebecca Buchholz, Sebastian Krossa, Maria K Andersen, Michael Holtkamp, Michael Sperling, Uwe Karst, May-Britt Tessem
Publié dans: Metallomics, Numéro 17565901, 2022, ISSN 1756-5901
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1093/mtomcs/mfac013

A0948 - Multiomics spatial mapping of lipid metabolism in prostate cancer (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: M.K. Andersen, S. Krossa, M. Elise, T. Viset, Ø. Størkersen, G.F. Giskeødegård, M.B. Rye, M-B. Tessem
Publié dans: European Urology, 2022, ISSN 0302-2838
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/s0302-2838(22)01023-5

FunHoP analysis reveals upregulation of mitochondrial genes in prostate cancer (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Kjersti Rise; May-Britt Tessem; Finn Drabløs; Morten Beck Rye
Publié dans: e0275621-?, Numéro 1, 2022, ISSN 1932-6203
Éditeur: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pone.0275621

Single cell and spatial transcriptomics highlight the interaction of club-like cells with immunosuppressive myeloid cells in prostate cancer (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Antti Kiviaho, Sini K. Eerola, Heini M. L. Kallio, Maria K. Andersen, Miina Hoikka, Aliisa M. Tiihonen, Iida Salonen, Xander Spotbeen, Alexander Giesen, Charles T. A. Parker, Sinja Taavitsainen, Olli Hantula, Mikael Marttinen, Ismaïl Hermelo, Mazlina Ismail, Elise Midtbust, Maximilian Wess, Wout Devlies, Abhibhav Sharma, Sebastian Krossa, Tomi Häkkinen, Ebrahim Afyounian, Katy Vandereyken, Sam K
Publié dans: Nature Communications, Numéro 15, 2024, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-54364-1

Integrative metabolic and transcriptomic profiling of prostate cancer tissue containing reactive stroma (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Maria K. Andersen, Kjersti Rise, Guro F. Giskeødegård, Elin Richardsen, Helena Bertilsson, Øystein Størkersen, Tone F. Bathen, Morten Rye, May-Britt Tessem
Publié dans: Scientific Reports, Numéro 8/1, 2018, ISSN 2045-2322
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-018-32549-1

The effect of sampling procedures and day-to-day variations in metabolomics studies of biofluids (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Guro F. Giskeødegård, Trygve Andreassen, Helena Bertilsson, May-Britt Tessem, Tone F. Bathen
Publié dans: Analytica Chimica Acta, Numéro 1081, 2019, Page(s) 93-102, ISSN 0003-2670
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.aca.2019.07.026

NMR-based metabolomics of biofluids in cancer (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Guro F. Giskeødegård, Torfinn S. Madssen, Leslie R. Euceda, May-Britt Tessem, Siver A. Moestue, Tone F. Bathen
Publié dans: NMR in Biomedicine, 2018, Page(s) e3927, ISSN 0952-3480
Éditeur: John Wiley & Sons Inc.
DOI: 10.1002/nbm.3927

Simultaneous Detection of Zinc and Its Pathway Metabolites Using MALDI MS Imaging of Prostate Tissue (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Maria K. Andersen, Sebastian Krossa, Therese S. Høiem, Rebecca Buchholz, Britt S. R. Claes, Benjamin Balluff, Shane R. Ellis, Elin Richardsen, Helena Bertilsson, Ron M. A. Heeren, Tone F. Bathen, Uwe Karst, Guro F. Giskeødegård, May-Britt Tessem
Publié dans: Analytical Chemistry, Numéro 92/4, 2020, Page(s) 3171-3179, ISSN 0003-2700
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.analchem.9b04903

Metabolic alterations in tissues and biofluids of patients with prostate cancer (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Maria K. Andersen, Guro F. Giskeødegård, May-Britt Tessem
Publié dans: Current Opinion in Endocrine and Metabolic Research, Numéro 10, 2020, Page(s) 23-28, ISSN 2451-9650
Éditeur: Elsevier
DOI: 10.1016/j.coemr.2020.02.003

An optimized MALDI MSI protocol for spatial detection of tryptic peptides in fresh frozen prostate tissue (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Therese S. Høiem; Maria K. Andersen; Marta Martin‐Lorenzo; Rémi Longuespée; Britt S.R. Claes; Anna Nordborg; Frédéric Dewez; Benjamin Balluff; Marco Giampà; Animesh Sharma; Lars Hagen; Ron M.A. Heeren; Tone F. Bathen; Guro F. Giskeødegård; Sebastian Krossa; May‐Britt Tessem
Publié dans: VOLUME=22;ISSUE=10;ISSN=1615-9853;TITLE=Proteomics, Numéro 1, 2022, ISSN 1615-9853
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/pmic.202100223

A0942 - DNA methylation aberrations predicts recurrence both in tumor and normal appearing prostate tissue (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: C. Pedersen, E. Midtbust, S. Krossa, M.K. Andersen, T. Viset, Ø. Størkersen, G.F. Giskeødegård, M.B. Rye, M-B. Tessem
Publié dans: European Urology, 2022, ISSN 0302-2838
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/s0302-2838(22)01017-x

Book chapters (3)
Sample Preparation for Metabolite Detection in Mass Spectrometry Imaging (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Maria K. Andersen, Marco Giampà, Elise Midtbust, Therese S. Høiem, Sebastian Krossa, May-Britt Tessem
Publié dans: Methods in Molecular Biology, Imaging Mass Spectrometry, 2023, Page(s) 135-146
Éditeur: Springer US
DOI: 10.1007/978-1-0716-3319-9_12

Biomarker Discovery Using NMR-Based Metabolomics of Tissue (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Maria T. Grinde, Guro F. Giskeødegård, Trygve Andreassen, May-Britt Tessem, Tone F. Bathen, Siver A. Moestue
Publié dans: NMR-Based Metabolomics - Methods and Protocols, Numéro 2037, 2019, Page(s) 243-262, ISBN 978-1-4939-9689-6
Éditeur: Springer New York
DOI: 10.1007/978-1-4939-9690-2_15

NMR-Based Prostate Cancer Metabolomics (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Leslie R. Euceda, Maria K. Andersen, May-Britt Tessem, Siver A. Moestue, Maria T. Grinde, Tone F. Bathen
Publié dans: Prostate Cancer, Numéro 1786, 2018, Page(s) 237-257, ISBN 978-1-4939-7843-4
Éditeur: Springer New York
DOI: 10.1007/978-1-4939-7845-8_14

Other (4)
Additional file 1 of DNA methylation changes in response to neoadjuvant chemotherapy are associated with breast cancer survival (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Pedersen, Christine Aaserød; Cao, Maria Dung; Fleischer, Thomas; Rye, Morten B.; Knappskog, Stian; Eikesdal, Hans Petter; Lønning, Per Eystein; Tost, Jörg; Kristensen, Vessela N.; Tessem, May-Britt; Giskeødegård, Guro F.; Bathen, Tone F.
Publié dans: Breast Cancer Research, Numéro 2, 2022, ISSN 1465-542X
Éditeur: Springe Nature
DOI: 10.6084/m9.figshare.20155587

Spatial Integration of Multi-Omics Data using the novel Multi-Omics Imaging Integration Toolset (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Maximillian Wess, Maria K. Andersen, Elise Midtbust, Juan Carlos Cabellos Guillem, Trond Viset, Øystein Størkersen, Sebastian Krossa, Morten Beck Rye, May-Britt Tessem
Publié dans: Bioarchive-the preprint of biology, 2024
Éditeur: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2024.06.11.598306

Additional file 1 of Spatial differentiation of metabolism in prostate cancer tissue by MALDI-TOF MSI (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Andersen, Maria K.; Høiem, Therese S.; Claes, Britt S. R.; Balluff, Benjamin; Martin-Lorenzo, Marta; Richardsen, Elin; Krossa, Sebastian; Bertilsson, Helena; Heeren, Ron M. A.; Rye, Morten B.; Giskeødegård, Guro F.; Bathen, Tone F.; May-Britt Tessem
Publié dans: CAncer and metabolism, Numéro 1, 2021, ISSN 2049-3002
Éditeur: Springer NAture
DOI: 10.6084/m9.figshare.13668033.v1

Deep phenotyping of the prostate tumor microenvironment reveals molecular stratifiers of relapse linked to inflammatory chemokine expression and aberrant metabolism (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Sebastian Krossa, Maria K. Andersen, Elise Midtbust, Maximilian Wess, Antti Kiviaho, Abhibhav Sharma, Trond Viset, Øystein Størkersen, Guro F. Giskeødegård, Matti Nykter, Alfonso Urbanucci, Morten B. Rye, May-Britt Tessem
Publié dans: Bioarchives-the preprent server for biology, 2024
Éditeur: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2024.05.13.593822

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Dernière mise à jour: 30 Avril 2025

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