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'Tissue is the issue': a multi-omics approach to improve prostate cancer diagnosis

CORDIS fornisce collegamenti ai risultati finali pubblici e alle pubblicazioni dei progetti ORIZZONTE.

I link ai risultati e alle pubblicazioni dei progetti del 7° PQ, così come i link ad alcuni tipi di risultati specifici come dataset e software, sono recuperati dinamicamente da .OpenAIRE .

Pubblicazioni

Conference proceedings (3)
A0948 - Multiomics spatial mapping of lipid metabolism in prostate cancer

Autori: M.K. Andersen, S. Krossa, M. Elise, T. Viset, Ø. Størkersen, G.F. Giskeødegård, M.B. Rye, M-B. Tessem
Pubblicato in: European Urology, Numero 1, 2022
Editore: Elsevier

A0942 - DNA methylation aberrations predicts recurrence both in tumor and normal appearing prostate tissue

Autori: C. Pedersen, E. Midtbust, S. Krossa, M.K. Andersen, T. Viset, Ø. Størkersen, G.F. Giskeødegård, M.B. Rye, M-B. Tessem
Pubblicato in: European Urology, Numero 1, 2022
Editore: Elsevier

A0950 - Inflammatory chemokines upregulated in the tumor microenvironment of prostate cancer patients experiencing relapse after radical prostatectomy

Autori: S. Krossa, M.K. Andersen, E. Midtbust, T. Viset, Ø. Størkersen, G.F. Giskeødegård, M.B. Rye, M-B. Tessem,
Pubblicato in: European Urology, Numero 1, 2022
Editore: Elsivier

Peer reviewed articles (19)
A0950 - Inflammatory chemokines upregulated in the tumor microenvironment of prostate cancer patients experiencing relapse after radical prostatectomy (si apre in una nuova finestra)

Autori: S. Krossa, M.K. Andersen, E. Midtbust, T. Viset, Ø. Størkersen, G.F. Giskeødegård, M.B. Rye, M-B. Tessem,
Pubblicato in: European Urology, 2022, ISSN 0302-2838
Editore: Elsevier BV
DOI: 10.1016/s0302-2838(22)01025-9

Spatial transcriptomics reveals strong association between SFRP4 and extracellular matrix remodeling in prostate cancer (si apre in una nuova finestra)

Autori: Maria K. Andersen, Sebastian Krossa, Elise Midtbust, Christine A. Pedersen, Maximilian Wess, Therese S. Høiem, Trond Viset, Øystein Størkersen, Ingunn Nervik, Elise Sandsmark, Helena Bertilsson, Guro F. Giskeødegård, Morten B. Rye, May-Britt Tessem
Pubblicato in: Communications Biology, Numero 7, 2024, ISSN 2399-3642
Editore: Nature portfolio
DOI: 10.1038/s42003-024-07161-x

DNA methylation changes in response to neoadjuvant chemotherapy are associated with breast cancer survival (si apre in una nuova finestra)

Autori: Christine Aaserød Pedersen; Maria Dung Cao; Thomas Fleischer; Morten B. Rye; Stian Knappskog; Hans Petter Eikesdal; Per Eystein Lønning; Jörg Tost; Vessela N. Kristensen; May-Britt Tessem; Guro F. Giskeødegård; Tone F. Bathen
Pubblicato in: Breast cancer Research, Numero 1, 2022, ISSN 1465-542X
Editore: Springer NAture
DOI: 10.1186/s13058-022-01537-9

FunHoP: Enhanced Visualization and Analysis of Functionally Homologous Proteins in Complex Metabolic Networks (si apre in una nuova finestra)

Autori: Kjersti Rise, May-Britt Tessem, Finn Drabløs, Morten B. Rye
Pubblicato in: Genomics, Proteomics & Bioinformatics, Numero 19, 2024, Pagina/e 848-859, ISSN 1672-0229
Editore: Kexue Chubaneshe/Science Press
DOI: 10.1016/j.gpb.2021.03.003

The genes controlling normal function of citrate and spermine secretion are lost in aggressive prostate cancer and prostate model systems (si apre in una nuova finestra)

Autori: Morten Beck Rye, Sebastian Krossa, Martina Hall, Casper van Mourik, Tone F. Bathen, Finn Drabløs, May-Britt Tessem, Helena Bertilsson,
Pubblicato in: iScience, 2022, ISSN 2589-0042
Editore: Elsevier
DOI: 10.1016/j.isci.2022.104451

Spatial integration of multi-omics data from serial sections using the novel Multi-Omics Imaging Integration Toolset (si apre in una nuova finestra)

Autori: Maximilian Wess, Maria K Andersen, Elise Midtbust, Juan Carlos Cabellos Guillem, Trond Viset, Øystein Størkersen, Sebastian Krossa, Morten Beck Rye, May-Britt Tessem
Pubblicato in: GigaScience, Numero 14, 2025, ISSN 2047-217X
Editore: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/gigascience/giaf035

Prediction of recurrence from metabolites and expression of TOP2A and EZH2 in prostate cancer patients treated with radiotherapy (si apre in una nuova finestra)

Autori: Ailin Falkmo Hansen; Therese Stork Høiem; Kirsten Margrete Selnæs; Anna Mary Bofin; Øystein Størkersen; Helena Bertilsson; Alan J. Wright; Guro Fanneløb Giskeødegård; Tone Frost Bathen; Morten Beck Rye; May‐Britt Tessem
Pubblicato in: NMR Biomed, Numero 1, 2022, ISSN 0952-3480
Editore: John Wiley & Sons Inc.
DOI: 10.1002/nbm.4694

Spatial differentiation of metabolism in prostate cancer tissue by MALDI-TOF MSI (si apre in una nuova finestra)

Autori: Maria K. Andersen, Therese S. Høiem, Britt S. R. Claes, Benjamin Balluff, Marta Martin-Lorenzo, Elin Richardsen, Sebastian Krossa, Helena Bertilsson, Ron M. A. Heeren, Morten B. Rye, Guro F. Giskeødegård, Tone F. Bathen, May-Britt Tessem
Pubblicato in: Cancer & Metabolism, Numero 9/1, 2021, ISSN 2049-3002
Editore: BMC Springer NAture
DOI: 10.1186/s40170-021-00242-z

A simple preparation protocol for shipping and storage of tissue sections for laser ablation-inductively coupled plasma-mass spectrometry imaging (si apre in una nuova finestra)

Autori: Rebecca Buchholz, Sebastian Krossa, Maria K Andersen, Michael Holtkamp, Michael Sperling, Uwe Karst, May-Britt Tessem
Pubblicato in: Metallomics, Numero 17565901, 2022, ISSN 1756-5901
Editore: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1093/mtomcs/mfac013

A0948 - Multiomics spatial mapping of lipid metabolism in prostate cancer (si apre in una nuova finestra)

Autori: M.K. Andersen, S. Krossa, M. Elise, T. Viset, Ø. Størkersen, G.F. Giskeødegård, M.B. Rye, M-B. Tessem
Pubblicato in: European Urology, 2022, ISSN 0302-2838
Editore: Elsevier BV
DOI: 10.1016/s0302-2838(22)01023-5

FunHoP analysis reveals upregulation of mitochondrial genes in prostate cancer (si apre in una nuova finestra)

Autori: Kjersti Rise; May-Britt Tessem; Finn Drabløs; Morten Beck Rye
Pubblicato in: e0275621-?, Numero 1, 2022, ISSN 1932-6203
Editore: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pone.0275621

Single cell and spatial transcriptomics highlight the interaction of club-like cells with immunosuppressive myeloid cells in prostate cancer (si apre in una nuova finestra)

Autori: Antti Kiviaho, Sini K. Eerola, Heini M. L. Kallio, Maria K. Andersen, Miina Hoikka, Aliisa M. Tiihonen, Iida Salonen, Xander Spotbeen, Alexander Giesen, Charles T. A. Parker, Sinja Taavitsainen, Olli Hantula, Mikael Marttinen, Ismaïl Hermelo, Mazlina Ismail, Elise Midtbust, Maximilian Wess, Wout Devlies, Abhibhav Sharma, Sebastian Krossa, Tomi Häkkinen, Ebrahim Afyounian, Katy Vandereyken, Sam K
Pubblicato in: Nature Communications, Numero 15, 2024, ISSN 2041-1723
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-54364-1

Integrative metabolic and transcriptomic profiling of prostate cancer tissue containing reactive stroma (si apre in una nuova finestra)

Autori: Maria K. Andersen, Kjersti Rise, Guro F. Giskeødegård, Elin Richardsen, Helena Bertilsson, Øystein Størkersen, Tone F. Bathen, Morten Rye, May-Britt Tessem
Pubblicato in: Scientific Reports, Numero 8/1, 2018, ISSN 2045-2322
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-018-32549-1

The effect of sampling procedures and day-to-day variations in metabolomics studies of biofluids (si apre in una nuova finestra)

Autori: Guro F. Giskeødegård, Trygve Andreassen, Helena Bertilsson, May-Britt Tessem, Tone F. Bathen
Pubblicato in: Analytica Chimica Acta, Numero 1081, 2019, Pagina/e 93-102, ISSN 0003-2670
Editore: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.aca.2019.07.026

NMR-based metabolomics of biofluids in cancer (si apre in una nuova finestra)

Autori: Guro F. Giskeødegård, Torfinn S. Madssen, Leslie R. Euceda, May-Britt Tessem, Siver A. Moestue, Tone F. Bathen
Pubblicato in: NMR in Biomedicine, 2018, Pagina/e e3927, ISSN 0952-3480
Editore: John Wiley & Sons Inc.
DOI: 10.1002/nbm.3927

Simultaneous Detection of Zinc and Its Pathway Metabolites Using MALDI MS Imaging of Prostate Tissue (si apre in una nuova finestra)

Autori: Maria K. Andersen, Sebastian Krossa, Therese S. Høiem, Rebecca Buchholz, Britt S. R. Claes, Benjamin Balluff, Shane R. Ellis, Elin Richardsen, Helena Bertilsson, Ron M. A. Heeren, Tone F. Bathen, Uwe Karst, Guro F. Giskeødegård, May-Britt Tessem
Pubblicato in: Analytical Chemistry, Numero 92/4, 2020, Pagina/e 3171-3179, ISSN 0003-2700
Editore: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.analchem.9b04903

Metabolic alterations in tissues and biofluids of patients with prostate cancer (si apre in una nuova finestra)

Autori: Maria K. Andersen, Guro F. Giskeødegård, May-Britt Tessem
Pubblicato in: Current Opinion in Endocrine and Metabolic Research, Numero 10, 2020, Pagina/e 23-28, ISSN 2451-9650
Editore: Elsevier
DOI: 10.1016/j.coemr.2020.02.003

An optimized MALDI MSI protocol for spatial detection of tryptic peptides in fresh frozen prostate tissue (si apre in una nuova finestra)

Autori: Therese S. Høiem; Maria K. Andersen; Marta Martin‐Lorenzo; Rémi Longuespée; Britt S.R. Claes; Anna Nordborg; Frédéric Dewez; Benjamin Balluff; Marco Giampà; Animesh Sharma; Lars Hagen; Ron M.A. Heeren; Tone F. Bathen; Guro F. Giskeødegård; Sebastian Krossa; May‐Britt Tessem
Pubblicato in: VOLUME=22;ISSUE=10;ISSN=1615-9853;TITLE=Proteomics, Numero 1, 2022, ISSN 1615-9853
Editore: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/pmic.202100223

A0942 - DNA methylation aberrations predicts recurrence both in tumor and normal appearing prostate tissue (si apre in una nuova finestra)

Autori: C. Pedersen, E. Midtbust, S. Krossa, M.K. Andersen, T. Viset, Ø. Størkersen, G.F. Giskeødegård, M.B. Rye, M-B. Tessem
Pubblicato in: European Urology, 2022, ISSN 0302-2838
Editore: Elsevier BV
DOI: 10.1016/s0302-2838(22)01017-x

Book chapters (3)
Sample Preparation for Metabolite Detection in Mass Spectrometry Imaging (si apre in una nuova finestra)

Autori: Maria K. Andersen, Marco Giampà, Elise Midtbust, Therese S. Høiem, Sebastian Krossa, May-Britt Tessem
Pubblicato in: Methods in Molecular Biology, Imaging Mass Spectrometry, 2023, Pagina/e 135-146
Editore: Springer US
DOI: 10.1007/978-1-0716-3319-9_12

Biomarker Discovery Using NMR-Based Metabolomics of Tissue (si apre in una nuova finestra)

Autori: Maria T. Grinde, Guro F. Giskeødegård, Trygve Andreassen, May-Britt Tessem, Tone F. Bathen, Siver A. Moestue
Pubblicato in: NMR-Based Metabolomics - Methods and Protocols, Numero 2037, 2019, Pagina/e 243-262, ISBN 978-1-4939-9689-6
Editore: Springer New York
DOI: 10.1007/978-1-4939-9690-2_15

NMR-Based Prostate Cancer Metabolomics (si apre in una nuova finestra)

Autori: Leslie R. Euceda, Maria K. Andersen, May-Britt Tessem, Siver A. Moestue, Maria T. Grinde, Tone F. Bathen
Pubblicato in: Prostate Cancer, Numero 1786, 2018, Pagina/e 237-257, ISBN 978-1-4939-7843-4
Editore: Springer New York
DOI: 10.1007/978-1-4939-7845-8_14

Other (4)
Additional file 1 of DNA methylation changes in response to neoadjuvant chemotherapy are associated with breast cancer survival (si apre in una nuova finestra)

Autori: Pedersen, Christine Aaserød; Cao, Maria Dung; Fleischer, Thomas; Rye, Morten B.; Knappskog, Stian; Eikesdal, Hans Petter; Lønning, Per Eystein; Tost, Jörg; Kristensen, Vessela N.; Tessem, May-Britt; Giskeødegård, Guro F.; Bathen, Tone F.
Pubblicato in: Breast Cancer Research, Numero 2, 2022, ISSN 1465-542X
Editore: Springe Nature
DOI: 10.6084/m9.figshare.20155587

Spatial Integration of Multi-Omics Data using the novel Multi-Omics Imaging Integration Toolset (si apre in una nuova finestra)

Autori: Maximillian Wess, Maria K. Andersen, Elise Midtbust, Juan Carlos Cabellos Guillem, Trond Viset, Øystein Størkersen, Sebastian Krossa, Morten Beck Rye, May-Britt Tessem
Pubblicato in: Bioarchive-the preprint of biology, 2024
Editore: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2024.06.11.598306

Additional file 1 of Spatial differentiation of metabolism in prostate cancer tissue by MALDI-TOF MSI (si apre in una nuova finestra)

Autori: Andersen, Maria K.; Høiem, Therese S.; Claes, Britt S. R.; Balluff, Benjamin; Martin-Lorenzo, Marta; Richardsen, Elin; Krossa, Sebastian; Bertilsson, Helena; Heeren, Ron M. A.; Rye, Morten B.; Giskeødegård, Guro F.; Bathen, Tone F.; May-Britt Tessem
Pubblicato in: CAncer and metabolism, Numero 1, 2021, ISSN 2049-3002
Editore: Springer NAture
DOI: 10.6084/m9.figshare.13668033.v1

Deep phenotyping of the prostate tumor microenvironment reveals molecular stratifiers of relapse linked to inflammatory chemokine expression and aberrant metabolism (si apre in una nuova finestra)

Autori: Sebastian Krossa, Maria K. Andersen, Elise Midtbust, Maximilian Wess, Antti Kiviaho, Abhibhav Sharma, Trond Viset, Øystein Størkersen, Guro F. Giskeødegård, Matti Nykter, Alfonso Urbanucci, Morten B. Rye, May-Britt Tessem
Pubblicato in: Bioarchives-the preprent server for biology, 2024
Editore: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2024.05.13.593822

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Ultimo aggiornamento: 30 Aprile 2025

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European Union, 2025

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