Cohesin-mediated chromosomal looping: From linear paths to 3D effects

Informations projet

CohesinLooping

N° de convention de subvention: 772471

DOI

10.3030/772471

Projet clôturé

Date de signature de la CE 6 Février 2018

Date de début 1 Avril 2018

Date de fin 31 Mars 2023

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 1 998 375,00

Contribution de l’UE

€ 1 998 375,00

Coordonné par

STICHTING HET NEDERLANDS KANKER INSTITUUT-ANTONI VAN LEEUWENHOEK ZIEKENHUIS
Netherlands

CORDIS fournit des liens vers les livrables publics et les publications des projets HORIZON.

Les liens vers les livrables et les publications des projets du 7e PC, ainsi que les liens vers certains types de résultats spécifiques tels que les jeux de données et les logiciels, sont récupérés dynamiquement sur OpenAIRE .

Livrables

Open Research Data Pilot (1)

Data management plan

A data managemnet plan will be written as part of the pilot on open research data

Publications

Peer reviewed articles (6)

The cohesin acetylation cycle controls chromatin loop length through a PDS5A brake mechanism

Auteurs: Marjon S. van Ruiten, Démi van Gent, Ángela Sedeño Cacciatore, Astrid Fauster, Laureen Willems, Maarten L. Hekkelman, Liesbeth Hoekman, Maarten Altelaar, Judith H. I. Haarhuis, Thijn R. Brummelkamp, Elzo de Wit & Benjamin D. Rowland
Publié dans: Nature Structural & Molecular Biology, Numéro 29, 2022, Page(s) 586–591, ISSN 1545-9985
Éditeur: Springer - Nature
DOI: 10.1038/s41594-022-00773-z

3D genomics across the tree of life reveals condensin II as a determinant of architecture type

Auteurs: Claire Hoencamp, Olga Dudchenko, Ahmed M. O. Elbatsh, Sumitabha Brahmachari, Jonne A. Raaijmakers, Tom van Schaik, Ángela Sedeño Cacciatore, Vinícius G. Contessoto, Roy G. H. P. van Heesbeen, Bram van den Broek, Aditya N. Mhaskar, Hans Teunissen, Brian Glenn St Hilaire, David Weisz, Arina D. Omer, Melanie Pham, Zane Colaric, Zhenzhen Yang, Suhas S. P. Rao, Namita Mitra, Christopher Lui, Weijie
Publié dans: Science, Numéro 372/6545, 2021, Page(s) 984-989, ISSN 0036-8075
Éditeur: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.abe2218

Structural basis of centromeric cohesion protection

Auteurs: Alberto García-Nieto, Amrita Patel, Yan Li, Roel Oldenkamp, Leonardo Feletto, Joshua J. Graham, Laureen Willems, Kyle W. Muir, Daniel Panne, Benjamin D. Rowland
Publié dans: Nature Structural & Molecular Biology, Numéro 853-859, 2023, Page(s) 853-859, ISSN 1545-9993
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41594-023-00968-y

A Mediator-cohesin axis controls heterochromatin domain formation

Auteurs: Judith H. I. Haarhuis, Robin H. van der Weide, Vincent A. Blomen, Koen D. Flach, Hans Teunissen, Laureen Willems, Thijn R. Brummelkamp, Benjamin D. Rowland & Elzo de Wit
Publié dans: Nature Communications, Numéro 13/754, 2022, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-022-28377-7

The structural basis for cohesin–CTCF-anchored loops

Auteurs: Yan Li, Judith H. I. Haarhuis, Ángela Sedeño Cacciatore, Roel Oldenkamp, Marjon S. van Ruiten, Laureen Willems, Hans Teunissen, Kyle W. Muir, Elzo de Wit, Benjamin D. Rowland, Daniel Panne
Publié dans: Nature, Numéro 578/7795, 2020, Page(s) 472-476, ISSN 0028-0836
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-019-1910-z

Hi-C analyses with GENOVA: a case study with cohesin variants

Auteurs: Robin H van der Weide, Teun van den Brand, Judith H I Haarhuis, Hans Teunissen, Benjamin D Rowland, Elzo de Wit
Publié dans: NAR Genomics and Bioinformatics, Numéro 3/2, 2021, ISSN 2631-9268
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nargab/lqab040