Cohesin-mediated chromosomal looping: From linear paths to 3D effects

Projektinformationen

CohesinLooping

ID Finanzhilfevereinbarung: 772471

DOI

10.3030/772471

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 6 Februar 2018

Startdatum 1 April 2018

Enddatum 31 März 2023

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten

€ 1 998 375,00

EU-Beitrag

€ 1 998 375,00

Koordiniert durch

STICHTING HET NEDERLANDS KANKER INSTITUUT-ANTONI VAN LEEUWENHOEK ZIEKENHUIS
Netherlands

CORDIS bietet Links zu öffentlichen Ergebnissen und Veröffentlichungen von HORIZONT-Projekten.

Links zu Ergebnissen und Veröffentlichungen von RP7-Projekten sowie Links zu einigen Typen spezifischer Ergebnisse wie Datensätzen und Software werden dynamisch von OpenAIRE abgerufen.

Leistungen

Open Research Data Pilot (1)

Data management plan

A data managemnet plan will be written as part of the pilot on open research data

Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (6)

The cohesin acetylation cycle controls chromatin loop length through a PDS5A brake mechanism

Autoren: Marjon S. van Ruiten, Démi van Gent, Ángela Sedeño Cacciatore, Astrid Fauster, Laureen Willems, Maarten L. Hekkelman, Liesbeth Hoekman, Maarten Altelaar, Judith H. I. Haarhuis, Thijn R. Brummelkamp, Elzo de Wit & Benjamin D. Rowland
Veröffentlicht in: Nature Structural & Molecular Biology, Ausgabe 29, 2022, Seite(n) 586–591, ISSN 1545-9985
Herausgeber: Springer - Nature
DOI: 10.1038/s41594-022-00773-z

3D genomics across the tree of life reveals condensin II as a determinant of architecture type

Autoren: Claire Hoencamp, Olga Dudchenko, Ahmed M. O. Elbatsh, Sumitabha Brahmachari, Jonne A. Raaijmakers, Tom van Schaik, Ángela Sedeño Cacciatore, Vinícius G. Contessoto, Roy G. H. P. van Heesbeen, Bram van den Broek, Aditya N. Mhaskar, Hans Teunissen, Brian Glenn St Hilaire, David Weisz, Arina D. Omer, Melanie Pham, Zane Colaric, Zhenzhen Yang, Suhas S. P. Rao, Namita Mitra, Christopher Lui, Weijie
Veröffentlicht in: Science, Ausgabe 372/6545, 2021, Seite(n) 984-989, ISSN 0036-8075
Herausgeber: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.abe2218

Structural basis of centromeric cohesion protection

Autoren: Alberto García-Nieto, Amrita Patel, Yan Li, Roel Oldenkamp, Leonardo Feletto, Joshua J. Graham, Laureen Willems, Kyle W. Muir, Daniel Panne, Benjamin D. Rowland
Veröffentlicht in: Nature Structural & Molecular Biology, Ausgabe 853-859, 2023, Seite(n) 853-859, ISSN 1545-9993
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41594-023-00968-y

A Mediator-cohesin axis controls heterochromatin domain formation

Autoren: Judith H. I. Haarhuis, Robin H. van der Weide, Vincent A. Blomen, Koen D. Flach, Hans Teunissen, Laureen Willems, Thijn R. Brummelkamp, Benjamin D. Rowland & Elzo de Wit
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 13/754, 2022, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-022-28377-7

The structural basis for cohesin–CTCF-anchored loops

Autoren: Yan Li, Judith H. I. Haarhuis, Ángela Sedeño Cacciatore, Roel Oldenkamp, Marjon S. van Ruiten, Laureen Willems, Hans Teunissen, Kyle W. Muir, Elzo de Wit, Benjamin D. Rowland, Daniel Panne
Veröffentlicht in: Nature, Ausgabe 578/7795, 2020, Seite(n) 472-476, ISSN 0028-0836
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-019-1910-z

Hi-C analyses with GENOVA: a case study with cohesin variants

Autoren: Robin H van der Weide, Teun van den Brand, Judith H I Haarhuis, Hans Teunissen, Benjamin D Rowland, Elzo de Wit
Veröffentlicht in: NAR Genomics and Bioinformatics, Ausgabe 3/2, 2021, ISSN 2631-9268
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nargab/lqab040