Cohesin-mediated chromosomal looping: From linear paths to 3D effects

Informacje na temat projektu

CohesinLooping

Identyfikator umowy o grant: 772471

DOI

10.3030/772471

Projekt został zamknięty

Data podpisania przez KE 6 Lutego 2018

Data rozpoczęcia 1 Kwietnia 2018

Data zakończenia 31 Marca 2023

Finansowanie w ramach

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Koszt całkowity

€ 1 998 375,00

Wkład UE

€ 1 998 375,00

Koordynowany przez

STICHTING HET NEDERLANDS KANKER INSTITUUT-ANTONI VAN LEEUWENHOEK ZIEKENHUIS
Netherlands

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Rezultaty

Open Research Data Pilot (1)

Data management plan

A data managemnet plan will be written as part of the pilot on open research data

Publikacje

Peer reviewed articles (6)

The cohesin acetylation cycle controls chromatin loop length through a PDS5A brake mechanism

Autorzy: Marjon S. van Ruiten, Démi van Gent, Ángela Sedeño Cacciatore, Astrid Fauster, Laureen Willems, Maarten L. Hekkelman, Liesbeth Hoekman, Maarten Altelaar, Judith H. I. Haarhuis, Thijn R. Brummelkamp, Elzo de Wit & Benjamin D. Rowland
Opublikowane w: Nature Structural & Molecular Biology, Numer 29, 2022, Strona(/y) 586–591, ISSN 1545-9985
Wydawca: Springer - Nature
DOI: 10.1038/s41594-022-00773-z

3D genomics across the tree of life reveals condensin II as a determinant of architecture type

Autorzy: Claire Hoencamp, Olga Dudchenko, Ahmed M. O. Elbatsh, Sumitabha Brahmachari, Jonne A. Raaijmakers, Tom van Schaik, Ángela Sedeño Cacciatore, Vinícius G. Contessoto, Roy G. H. P. van Heesbeen, Bram van den Broek, Aditya N. Mhaskar, Hans Teunissen, Brian Glenn St Hilaire, David Weisz, Arina D. Omer, Melanie Pham, Zane Colaric, Zhenzhen Yang, Suhas S. P. Rao, Namita Mitra, Christopher Lui, Weijie
Opublikowane w: Science, Numer 372/6545, 2021, Strona(/y) 984-989, ISSN 0036-8075
Wydawca: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.abe2218

Structural basis of centromeric cohesion protection

Autorzy: Alberto García-Nieto, Amrita Patel, Yan Li, Roel Oldenkamp, Leonardo Feletto, Joshua J. Graham, Laureen Willems, Kyle W. Muir, Daniel Panne, Benjamin D. Rowland
Opublikowane w: Nature Structural & Molecular Biology, Numer 853-859, 2023, Strona(/y) 853-859, ISSN 1545-9993
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41594-023-00968-y

A Mediator-cohesin axis controls heterochromatin domain formation

Autorzy: Judith H. I. Haarhuis, Robin H. van der Weide, Vincent A. Blomen, Koen D. Flach, Hans Teunissen, Laureen Willems, Thijn R. Brummelkamp, Benjamin D. Rowland & Elzo de Wit
Opublikowane w: Nature Communications, Numer 13/754, 2022, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-022-28377-7

The structural basis for cohesin–CTCF-anchored loops

Autorzy: Yan Li, Judith H. I. Haarhuis, Ángela Sedeño Cacciatore, Roel Oldenkamp, Marjon S. van Ruiten, Laureen Willems, Hans Teunissen, Kyle W. Muir, Elzo de Wit, Benjamin D. Rowland, Daniel Panne
Opublikowane w: Nature, Numer 578/7795, 2020, Strona(/y) 472-476, ISSN 0028-0836
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-019-1910-z

Hi-C analyses with GENOVA: a case study with cohesin variants

Autorzy: Robin H van der Weide, Teun van den Brand, Judith H I Haarhuis, Hans Teunissen, Benjamin D Rowland, Elzo de Wit
Opublikowane w: NAR Genomics and Bioinformatics, Numer 3/2, 2021, ISSN 2631-9268
Wydawca: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nargab/lqab040