Cohesin-mediated chromosomal looping: From linear paths to 3D effects

Informazioni relative al progetto

CohesinLooping

ID dell’accordo di sovvenzione: 772471

DOI

10.3030/772471

Progetto chiuso

Data della firma CE 6 Febbraio 2018

Data di avvio 1 Aprile 2018

Data di completamento 31 Marzo 2023

Finanziato da

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Costo totale

€ 1 998 375,00

Contributo UE

€ 1 998 375,00

Coordinato da

STICHTING HET NEDERLANDS KANKER INSTITUUT-ANTONI VAN LEEUWENHOEK ZIEKENHUIS
Netherlands

CORDIS fornisce collegamenti ai risultati finali pubblici e alle pubblicazioni dei progetti ORIZZONTE.

I link ai risultati e alle pubblicazioni dei progetti del 7° PQ, così come i link ad alcuni tipi di risultati specifici come dataset e software, sono recuperati dinamicamente da .OpenAIRE .

Risultati finali

Open Research Data Pilot (1)

Data management plan

A data managemnet plan will be written as part of the pilot on open research data

Pubblicazioni

Peer reviewed articles (6)

The cohesin acetylation cycle controls chromatin loop length through a PDS5A brake mechanism

Autori: Marjon S. van Ruiten, Démi van Gent, Ángela Sedeño Cacciatore, Astrid Fauster, Laureen Willems, Maarten L. Hekkelman, Liesbeth Hoekman, Maarten Altelaar, Judith H. I. Haarhuis, Thijn R. Brummelkamp, Elzo de Wit & Benjamin D. Rowland
Pubblicato in: Nature Structural & Molecular Biology, Numero 29, 2022, Pagina/e 586–591, ISSN 1545-9985
Editore: Springer - Nature
DOI: 10.1038/s41594-022-00773-z

3D genomics across the tree of life reveals condensin II as a determinant of architecture type

Autori: Claire Hoencamp, Olga Dudchenko, Ahmed M. O. Elbatsh, Sumitabha Brahmachari, Jonne A. Raaijmakers, Tom van Schaik, Ángela Sedeño Cacciatore, Vinícius G. Contessoto, Roy G. H. P. van Heesbeen, Bram van den Broek, Aditya N. Mhaskar, Hans Teunissen, Brian Glenn St Hilaire, David Weisz, Arina D. Omer, Melanie Pham, Zane Colaric, Zhenzhen Yang, Suhas S. P. Rao, Namita Mitra, Christopher Lui, Weijie
Pubblicato in: Science, Numero 372/6545, 2021, Pagina/e 984-989, ISSN 0036-8075
Editore: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.abe2218

Structural basis of centromeric cohesion protection

Autori: Alberto García-Nieto, Amrita Patel, Yan Li, Roel Oldenkamp, Leonardo Feletto, Joshua J. Graham, Laureen Willems, Kyle W. Muir, Daniel Panne, Benjamin D. Rowland
Pubblicato in: Nature Structural & Molecular Biology, Numero 853-859, 2023, Pagina/e 853-859, ISSN 1545-9993
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41594-023-00968-y

A Mediator-cohesin axis controls heterochromatin domain formation

Autori: Judith H. I. Haarhuis, Robin H. van der Weide, Vincent A. Blomen, Koen D. Flach, Hans Teunissen, Laureen Willems, Thijn R. Brummelkamp, Benjamin D. Rowland & Elzo de Wit
Pubblicato in: Nature Communications, Numero 13/754, 2022, ISSN 2041-1723
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-022-28377-7

The structural basis for cohesin–CTCF-anchored loops

Autori: Yan Li, Judith H. I. Haarhuis, Ángela Sedeño Cacciatore, Roel Oldenkamp, Marjon S. van Ruiten, Laureen Willems, Hans Teunissen, Kyle W. Muir, Elzo de Wit, Benjamin D. Rowland, Daniel Panne
Pubblicato in: Nature, Numero 578/7795, 2020, Pagina/e 472-476, ISSN 0028-0836
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-019-1910-z

Hi-C analyses with GENOVA: a case study with cohesin variants

Autori: Robin H van der Weide, Teun van den Brand, Judith H I Haarhuis, Hans Teunissen, Benjamin D Rowland, Elzo de Wit
Pubblicato in: NAR Genomics and Bioinformatics, Numero 3/2, 2021, ISSN 2631-9268
Editore: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nargab/lqab040