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CORDIS - Risultati della ricerca dell’UE
CORDIS

Research empowerment on solute carriers (ReSOLUTE)

CORDIS fornisce collegamenti ai risultati finali pubblici e alle pubblicazioni dei progetti ORIZZONTE.

I link ai risultati e alle pubblicazioni dei progetti del 7° PQ, così come i link ad alcuni tipi di risultati specifici come dataset e software, sono recuperati dinamicamente da .OpenAIRE .

Risultati finali

Assays for SLCs based on fluorescent ligands, fluorescence-labelling of SLCs or fluorogenic probes (si apre in una nuova finestra)

A report summarizing results from fluorescence-based assays.

Constructs and protocols for priority SLCs (si apre in una nuova finestra)

Set of expression vectors and protein purification protocols for SLCs on the priority list.

Transcriptome and metabolome for priority SLCs (si apre in una nuova finestra)

Quantitative differential transcriptome, metabolome data within a cell line that naturally expresses each SLC in the priority list in both basal and stimuli challenged states.

Data Management Plan 2 (si apre in una nuova finestra)

Initial version of DMP after 6 months, an updated version latest mid-term and a final version

Vector generation (si apre in una nuova finestra)

Collection of lentiviral and Flp-In compatible vectors carrying CRISPR-based Cas9 and sgRNAs targeting all SLCs, together with vectors carrying tagged and untagged cDNAs for >80% of the SLC family

ReSOLUTE knowledgebase (si apre in una nuova finestra)

Concept for database of integrated publicly available knowledge and ReSOLUTE web portal.

Data Mining (si apre in una nuova finestra)

Data mining support for priority ranking of SLC family members for target selection in WP4.

Informatic anylysis of metabolomic data (si apre in una nuova finestra)

Development and deployment of workflows for QSAR analysis of the ability of particular overexpressed SLCs to take up different substrates, and judicious variation of those substrates.

SLC overexpression in HEK293 (si apre in una nuova finestra)

Collection of >300 HEK293 isogenic cell lines, each overexpressing a SLC gene, quality-controlled and characterized with a multi-parameter approach

DEP implemented (stepwise, up to M60) (si apre in una nuova finestra)
Subcellular localization of target SLCs (si apre in una nuova finestra)

Based on optical imaging experiments with tagged SLCs.

SLC overexpressing cell lines (si apre in una nuova finestra)

Collection of 600 cell lines each overexpressing a specific SLC in untagged and tagged versions qualitycontrolled and characterized with a multiparameter approach

SLC interactome (si apre in una nuova finestra)

Physical measurement (by proteomics) of coexpression/copurification of SLCs with partners.

Signature metabolic profiles using targeted metabolomics (si apre in una nuova finestra)

Robust identification and quantification using LCGCMS for some 180 central metabolites

SLC Interactome for priority SLCs (si apre in una nuova finestra)

Condition dependent protein interaction network data in response to on-target and orthogonal pathway stimuli modulating SLC function.

Profile of plasma metabolite changes for each SLC cell line (si apre in una nuova finestra)

Use of methods of Task 2.2 to assess the largest changes between cells lines upregulated/knocked out for particular SLCs

Assays for SLCs based on SSM-electrophysiology (si apre in una nuova finestra)

A report summarizing results and protocols obtained with the SURFE2R approach.

Production of validated SLC antibodies (si apre in una nuova finestra)

Large set of validated antibodies targeting SLCs, together with tissue localization data.

Assays for SLCs based on fluorescent sensor proteins (si apre in una nuova finestra)

A report summarizing results and protocols on measuring SLC-dependent metabolic states through fluorescent sensor proteins.

Production of antigens and high-affinity binders (si apre in una nuova finestra)

Antigens for animal immunization for priority SLCs, together with DARPins or monobodies for priority SLCS and a panel of relevant SLCs.

SLC k.o. cell lines (si apre in una nuova finestra)

Collection of 600 cell lines each carrying frameshift mutations in one SLC gene qualitycontrolled and characterized with a multiparameter approach

Assays for SLCs based on cell lines that couple growth to SLC function (si apre in una nuova finestra)

A report summarizing results and protocols on assay based on genetic engineering of cell lines dependent on specific SLCs for survival.

Assays for SLCs based on mass spectrometry, thermal shift, radiolabelled or fluorescent compounds (si apre in una nuova finestra)

A report summarizing results from classical transport assays.

Assays for (electrogenic) transporters (si apre in una nuova finestra)

A report summarizing results and protocols obtained using fluorescent sensitive dyes and impedance measurements.

Physiological and physical network map for priority SLCs (si apre in una nuova finestra)

Condition-dependent regulatory models integrating transcriptomics, metabolomics and proteomics data for priority SLCs.

Data Management Plan 3 (si apre in una nuova finestra)

Initial version of DMP after 6 months, an updated version latest mid-term and a final version

Methodology for general detection of plasma metabolites and drug/dietary components (si apre in una nuova finestra)

LC/GC-MS coupled to novel deconvolution routines for determining the approximately 3,000 molecules typically observable in serum

Protein expression screen (si apre in una nuova finestra)

A family-wide assessment of protein expression yields in recombinant expression systems.

Determination of SLCs using ions as (co-)substrates (si apre in una nuova finestra)

The recognition that many substrates are symporters or antiporters means that one can detect this by assessing the movement of co-ions when transport substrates are added to suitable cell lines.

SLC genetic interaction map (si apre in una nuova finestra)

Production of ‘synthetic phenotypes’, based on the principle that knocking out both variants of a transporter with redundant function (e.g. loss of ability to transport X) thereby causes a phenotype from which one can infer function.

SLC k.o. in HEK293 (si apre in una nuova finestra)

Collection of 300 HEK293 isogenic cell lines each carrying frameshift mutations in a SLC gene qualitycontrolled and characterized with a multiparameter approach

Reconstitution of SLCs in proteoliposomes and nanodiscs (si apre in una nuova finestra)

Nanodisc- and liposome-reconstituted SLCs for in vitro assays of successfully purified SLCs of the priority list.

Data Management Plan 1 (si apre in una nuova finestra)

Initial version of DMP after 6 months, an updated version latest mid-term and a final version.

Protein production for the SLCs in the priority list (si apre in una nuova finestra)

Production of milligram quantities of highly pure (>90%) and stable protein samples for >30% of the priority SLCs.

ReSOLUTE web portal (si apre in una nuova finestra)

Data sharing and approval process, and prototype of interface for data access at public web portal up and running

ReSOLUTE database (si apre in una nuova finestra)

Infrastructure and data warehouse for sharing annotated raw data files and analysis results; prototype ready after first year and annual releases of new versions.

Pubblicazioni

Immunofluorescence for protein binder validation (si apre in una nuova finestra)

Autori: Gelová, Zuzana; Ingles-Prieto, Alvaro
Pubblicato in: 2022
Editore: n/a
DOI: 10.5281/zenodo.7462234

Data Management Plan 2 (si apre in una nuova finestra)

Autori: Ulrich Goldmann, Gerhard Ecker, Vitaly Sedlyarov, Lia Scarabottolo, Vania Manolova, Claire Colas
Pubblicato in: 2020
Editore: Zenodo
DOI: 10.5281/zenodo.5179816

Assays for (electrogenic) transporters (si apre in una nuova finestra)

Autori: Lia Scarabottolo; Juergen Reinhardt; Huub Sijben
Pubblicato in: 2020
Editore: Zenodo
DOI: 10.5281/zenodo.5179859

ReSOLUTE knowledgebase (si apre in una nuova finestra)

Autori: Ulrich Goldmann; Vitaly Sedlyarov; Daniela Digles; Barbara Füzi
Pubblicato in: 2018
Editore: Zenodo
DOI: 10.5281/zenodo.5179834

RESOLUTE: Data Management Plan (si apre in una nuova finestra)

Autori: Goldmann, Ulrich; Ecker, Gerhard; Sedlyarov, Vitaly; Scarabottolo, Lia; Manolova, Vania; Colas, Claire
Pubblicato in: Numero 1, 2019
Editore: n/a
DOI: 10.5281/zenodo.4309586

SLC k.o. cell lines (si apre in una nuova finestra)

Autori: Gernot Wolf; Klaus Seuwen; Barbara Barbosa; Eirini Christodoulaki; Alvaro Ingles-Prieto; Ulrich Goldmann; Christoph Klimek; Svenja Onstein; Vitaly Sedlyarov; Tabea Wiedmer; Diana Santacruz; Coralie Viollet; Florence Massey; Veeranagouda Yaligara
Pubblicato in: 2021
Editore: Zenodo
DOI: 10.5281/zenodo.10419148

RNA-Seq Transcriptomic Profiling (si apre in una nuova finestra)

Autori: Viollet, Coralie; Santacruz, Diana; Knebel, Dagmar; Rust, Werner; Acker, Susanne; Dick, Alec
Pubblicato in: 2022
Editore: n/a
DOI: 10.5281/zenodo.7462292

General protocol for SLC protein purification (si apre in una nuova finestra)

Autori: David B. Sauer; Huanyu Li; Sagar Raturi; Andreea Scacioc; Tina Bohstedt; Abilasha Balakrishnan
Pubblicato in: 2022
Editore: n/a
DOI: 10.5281/zenodo.7462714

Western Blotting of WT-OE cell lines (si apre in una nuova finestra)

Autori: Svenja Onstein; Eva Liñeiro; Christoph Klimek; Barbara Barbosa; Gernot Wolf
Pubblicato in: 2022
Editore: Zenodo
DOI: 10.5281/zenodo.7457377

Antibody Characterization Report for Reduced folate transporter SLC19A1 (FOLT) (si apre in una nuova finestra)

Autori: Ayoubi, Riham; McPherson, Peter S.; Laflamme, Carl
Pubblicato in: 2021
Editore: Zenodo
DOI: 10.5281/zenodo.4733107

Ligation Independent Cloning of transporter gene into BacMam vector (si apre in una nuova finestra)

Autori: Sauer, David B.; Huanyu Li; Raturi, Sagar; Scacioc, Andreea; Bohstedt, Tina; Abilasha Balakrishnan
Pubblicato in: 2022
Editore: Zenodo
DOI: 10.5281/zenodo.7462743

Data mining (si apre in una nuova finestra)

Autori: Daniela Digles; Jiani Li; Ulrich Goldmann
Pubblicato in: 2018
Editore: Zenodo
DOI: 10.5281/zenodo.5179841

High-throughput immunofluorescence to validate high-affinity binders (si apre in una nuova finestra)

Autori: Alvaro Ingles-Prieto; Felix Kartnig
Pubblicato in: 2022
Editore: n/a
DOI: 10.5281/zenodo.7457392

Mitochondrial enrichment followed by Affinity Purification couple to Mass Spectrometry (AP-MS) (si apre in una nuova finestra)

Autori: Eva Liñeiro; Alvaro Ingles-Prieto; Fabian Frommelt; André C. Mueller
Pubblicato in: 2022
Editore: n/a
DOI: 10.5281/zenodo.7462207

SLC overexpression in HEK293 (si apre in una nuova finestra)

Autori: Wolf, Gernot; Seuwen, Klaus
Pubblicato in: 2021
Editore: n/a
DOI: 10.5281/zenodo.5566804

Large Scale Transduction of Expi293F Cells with BacMam Virus (si apre in una nuova finestra)

Autori: Sauer, David B.; Huanyu Li; Raturi, Sagar; Scacioc, Andreea; Bohstedt, Tina; Abilasha Balakrishnan
Pubblicato in: 2022
Editore: n/a
DOI: 10.5281/zenodo.7462911

Expression analysis and co-localization imaging of Jump In T-REx HEK293 WT-OE cell pools (si apre in una nuova finestra)

Autori: Pfeifer, Martin; Kohlbrenner, Mariah; Chang, Lena; Lambrigger, Pascal; Ingles-Prieto, Alvaro; Reinhardt, Jürgen
Pubblicato in: 2022
Editore: n/a
DOI: 10.5281/zenodo.7457345

Generation of Jump-In T-REx HEK293 wild type-overexpression cell lines (si apre in una nuova finestra)

Autori: Klimek, Christoph; Onstein, Svenja; Barbosa, Barbara; Ingles-Prieto, Alvaro; Skucha, Anna; Ibig, Yvonne; Seuwen, Klaus; Wolf, Gernot
Pubblicato in: 2022
Editore: Zenodo
DOI: 10.5281/zenodo.7457220

Construction of a Bacmid (BacMam) vector containing the SLC gene (si apre in una nuova finestra)

Autori: David B. Sauer; Huanyu Li; Sagar Raturi; Andreea Scacioc; Tina Bohstedt; Abilasha Balakrishnan
Pubblicato in: 2022
Editore: n/a
DOI: 10.5281/zenodo.7462780

Antibody Characterization Report for Equilibrative nucleoside transporter 1 SLC29A1 (ENT1) (si apre in una nuova finestra)

Autori: Alshafie, Walaa; Ayoubi, Riham; McPherson, Peter S.; Laflamme, Carl
Pubblicato in: 2021
Editore: Zenodo
DOI: 10.5281/zenodo.4733134

Transfection to Generate BacMam Virus containing SLC transporter and small scale expression testing (si apre in una nuova finestra)

Autori: David B. Sauer; Huanyu Li; Sagar Raturi; Andreea Scacioc; Tina Bohstedt; Abilasha Balakrishnan
Pubblicato in: 2022
Editore: n/a
DOI: 10.5281/zenodo.7462876

Vector generation (si apre in una nuova finestra)

Autori: Gernot Wolf; Alvaro Ingles-Prieto; Enrico Girardi; Vitaly Sedlyarov; Svenja Onstein; Christoph Klimek; Barbara Barbosa
Pubblicato in: 2019
Editore: Zenodo
DOI: 10.5281/zenodo.5179824

Assays for SLCs based on fluorescent sensor proteins (si apre in una nuova finestra)

Autori: Philipp Leippe; Lia Scarabottolo
Pubblicato in: 2020
Editore: Zenodo
DOI: 10.5281/zenodo.5179857

Antibody Characterization Report for Very long-chain acyl-CoA synthetase SLC27A2 (VLCS) (si apre in una nuova finestra)

Autori: Ayoubi, Riham; McPherson, Peter S.; Laflamme, Carl
Pubblicato in: 2021
Editore: Zenodo
DOI: 10.5281/zenodo.4733132

RNA extraction and purification (si apre in una nuova finestra)

Autori: Klimek, Christoph; Onstein, Svenja; Barbosa, Barbara; Wolf, Gernot
Pubblicato in: 2022
Editore: n/a
DOI: 10.5281/zenodo.7462188

SLC overexpressing cell lines (si apre in una nuova finestra)

Autori: Gernot Wolf; Klaus Seuwen; Barbara Barbosa; Eirini Christodoulaki; Alvaro Ingles-Prieto; Ulrich Goldmann; Christoph Klimek; Svenja Onstein; Vitaly Sedlyarov; Tabea Wiedmer; Diana Santacruz; Coralie Viollet
Pubblicato in: 2021
Editore: Zenodo
DOI: 10.5281/zenodo.10419229

Targeted Metabolomics Sample Preparation (si apre in una nuova finestra)

Autori: Tabea Wiedmer; Abigail Jarret; Sabrina Lindinger
Pubblicato in: 2022
Editore: n/a
DOI: 10.5281/zenodo.7462174

Antibody Characterization Report for Solute carrier family 2, facilitated glucose transporter member 6 SLC2A6 (GLUT-6) (si apre in una nuova finestra)

Autori: Ayoubi, Riham; McPherson, Peter S.; Laflamme, Carl
Pubblicato in: 2021
Editore: Zenodo
DOI: 10.5281/zenodo.4733123

Generation of Single Cell Knockout Clones (si apre in una nuova finestra)

Autori: Svenja Onstein; Christoph Klimek; Barbara Barbosa; Anna Skucha; Gernot Wolf
Pubblicato in: 2022
Editore: Zenodo
DOI: 10.5281/zenodo.7457297

Affinity Purification couple to Mass Spectrometry (AP-MS) (si apre in una nuova finestra)

Autori: Alvaro Ingles-Prieto; Eva Liñeiro; Ariel Bensimon; Fabian Frommelt; André C. Mueller
Pubblicato in: 2022
Editore: n/a
DOI: 10.5281/zenodo.7457416

Proteomics characterization of RESOLUTE parental cell lines (si apre in una nuova finestra)

Autori: Eva Liñeiro; André C. Mueller
Pubblicato in: 2022
Editore: Zenodo
DOI: 10.5281/zenodo.7462271

Methodology for general detection of plasma metabolites and drug/dietary components (si apre in una nuova finestra)

Autori: Claire Steppan; Marina Wright Muelas; Douglas Kell; Tabea Wiedmer; Mary Piotrowski
Pubblicato in: 2019
Editore: Zenodo
DOI: 10.5281/zenodo.5179870

Purification of SPNS2 from Expi293FTM Cells (si apre in una nuova finestra)

Autori: David B. Sauer; Huanyu Li; Sagar Raturi; Andreea Scacioc; Tina Bohstedt; Abilasha Balakrishnan
Pubblicato in: 2022
Editore: Zenodo
DOI: 10.5281/zenodo.7468558

ReSOLUTE web portal (si apre in una nuova finestra)

Autori: Ulrich Goldmann; Vitaly Sedlyarov
Pubblicato in: 2019
Editore: Zenodo
DOI: 10.5281/zenodo.5179880

Antibody Characterization Report for Excitatory amino acid transporter 1 SLC1A3 (EAAT1) (si apre in una nuova finestra)

Autori: Ayoubi, Riham; McPherson, Peter S.; Laflamme, Carl
Pubblicato in: 2021
Editore: Zenodo
DOI: 10.5281/zenodo.4733103

Spatial proteomics couple to Mass Spectrometry (BioID-MS) (si apre in una nuova finestra)

Autori: Ingles-Prieto, Alvaro; Liñeiro, Eva; Frommelt, Fabian
Pubblicato in: 2022
Editore: Zenodo
DOI: 10.5281/zenodo.7457436

ReSOLUTE database (si apre in una nuova finestra)

Autori: Ulrich Goldmann; Vitaly Sedlyarov
Pubblicato in: 2019
Editore: Zenodo
DOI: 10.5281/zenodo.5179889

Signature metabolic profiles using targeted metabolomics (si apre in una nuova finestra)

Autori: Tabea Wiedmer, Eirini Christodoulaki, Sabrina Lindinger, Iciar Serrano, Christoph Bueschl, Thomas Hannich
Pubblicato in: 2022
Editore: Zenodo
DOI: 10.5281/zenodo.10419241

SLC k.o. in HEK293 (si apre in una nuova finestra)

Autori: Gernot Wolf; Klaus Seuwen; Barbara Barbosa; Eirini Christodoulaki; Alvaro Ingles-Prieto; Ulrich Goldmann; Christoph Klimek; Svenja Onstein; Vitaly Sedlyarov; Tabea Wiedmer; Diana Santacruz; Coralie Viollet; Florence Massey; Veeranagouda Yaligara
Pubblicato in: 2021
Editore: Zenodo
DOI: 10.5281/zenodo.10419196

Mass Spectrometry analysis (data acquisition) (si apre in una nuova finestra)

Autori: Mueller, André C.; Liñeiro, Eva
Pubblicato in: 2022
Editore: n/a
DOI: 10.5281/zenodo.7462252

SLC4A4 antibody characterization report (si apre in una nuova finestra)

Autori: Garcia, Julio; Gelova, Zuzana
Pubblicato in: 2023
Editore: n/a
DOI: 10.5281/zenodo.10033541

Protein production of SLC63A2 (si apre in una nuova finestra)

Autori: Vera Pütter; Yung-Ning Chang
Pubblicato in: 2022
Editore: Zenodo
DOI: 10.5281/zenodo.7468532

Generation of Knockout-Overexpression Cell Lines (si apre in una nuova finestra)

Autori: Christoph Klimek; Svenja Onstein; Barbara Barbosa; Alvaro Ingles-Prieto; Anna Skucha; Gernot Wolf
Pubblicato in: 2022
Editore: n/a
DOI: 10.5281/zenodo.7457295

Antibody Characterization Report for Glucose-6-phosphate exchanger SLC37A4 (G6PT) (si apre in una nuova finestra)

Autori: Ayoubi, Riham; McPherson, Peter S.; Laflamme, Carl
Pubblicato in: 2021
Editore: Zenodo
DOI: 10.5281/zenodo.4733121

Automation of high-throughput mRNA-seq library preparation: a robust, hands-free and time efficient methodology (si apre in una nuova finestra)

Autori: Diana Santacruz, Francis O Enane, Katrin Fundel-Clemens, Martin Giner, Gernot Wolf, Svenja Onstein, Christoph Klimek, Zachary Smith, Bhagya Wijayawardena, Coralie Viollet
Pubblicato in: SLAS Discovery, 2022, ISSN 2472-5552
Editore: Elsevier
DOI: 10.1016/j.slasd.2022.01.002

The macrocycle inhibitor landscape of SLC-transporter (si apre in una nuova finestra)

Autori: Granulo N, Sosnin S, Digles D, Ecker G.
Pubblicato in: Molecular Informatics, 2024, ISSN 1868-1743
Editore: Wiley - VCH Verlag GmbH & CO. KGaA
DOI: 10.1002/minf.202300287

MPP+-Induced Changes in Cellular Impedance as a Measure for Organic Cation Transporter (SLC22A1-3) Activity and Inhibition (si apre in una nuova finestra)

Autori: Mocking TAM, Sijben HJ, Vermeulen YW, IJzerman AP, Heitman LH
Pubblicato in: International Journal of Molecular Sciences, 2022, ISSN 1422-0067
Editore: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/ijms23031203

Development of a live cell assay for the zinc transporter ZnT8. (si apre in una nuova finestra)

Autori: Azzollini L, Prete DD, Wolf G, Klimek C, Saggioro M, Ricci F, Christodoulaki E, Wiedmer T, Ingles-Prieto A, Superti-Furga G, Scarabottolo L.
Pubblicato in: SLAS Discovery, 2024, ISSN 2472-5560
Editore: Elsevier Inc.
DOI: 10.1016/j.slasd.2024.100166

Experimental and Computational Analysis of Newly Identified Pathogenic Mutations in the Creatine Transporter SLC6A8 (si apre in una nuova finestra)

Autori: Evandro Ferrada, Tabea Wiedmer, Wen-An Wang, Fabian Frommelt, Barbara Steurer, Christoph Klimek, Sabrina Lindinger, Tanja Osthushenrich, Andrea Garofoli, Silvia Brocchetti, Samuel Bradberry, Jiahui Huang, Aidan MacNamara, Lia Scarabottolo, Gerhard F. Ecker, Anders Malarstig, Giulio Superti-Furga
Pubblicato in: Journal of Molecular Biology, 2024, ISSN 0022-2836
Editore: Academic Press
DOI: 10.1016/j.jmb.2023.168383

Functional characterization of SLC39 family members ZIP5 and ZIP10 in overexpressing HEK293 cells reveals selective copper transport activity (si apre in una nuova finestra)

Autori: Polesel M, Ingles-Prieto A, Christodoulaki E, Ferrada E, Doucerain C, Altermatt P, Knecht M, Kuhn M, Steck AL, Wilhelm M, Manolova V.
Pubblicato in: Biometals, 2023, ISSN 0966-0844
Editore: Kluwer Academic Publishers
DOI: 10.1007/s10534-022-00474-6

High-throughput expression and purification of human solute carriers for structural and biochemical studies (si apre in una nuova finestra)

Autori: Raturi S, Li H, Chang YN, Scacioc A, Bohstedt T, Fernandez-Cid A, Evans A, Abrusci P, Balakrishnan A, Pascoa TC, He D, Chi G, Kaur Singh N, Ye M, Li A, Shrestha L, Wang D, Williams EP, Burgess-Brown NA, Dürr KL, Puetter V, Ingles-Prieto A, Sauer DB.
Pubblicato in: Journal of Visualized Experiments, 2023, ISSN 1940-087X
Editore: MYJoVE Corporation
DOI: 10.3791/65878

An Overview of Cell-Based Assay Platforms for the Solute Carrier Family of Transporters (si apre in una nuova finestra)

Autori: Vojtech Dvorak, Tabea Wiedmer, Alvaro Ingles-Prieto, Patrick Altermatt, Helena Batoulis, Felix Bärenz, Eckhard Bender, Daniela Digles, Franz Dürrenberger, Laura H. Heitman, Adriaan P. IJzerman, Douglas B. Kell, Stefanie Kickinger, Daniel Körzö, Philipp Leippe, Thomas Licher, Vania Manolova, Riccardo Rizzetto, Francesca Sassone, Lia Scarabottolo, Avner Schlessinger, Vanessa Schneider, Hubert J.
Pubblicato in: Frontiers in Pharmacology, Numero 12, 2021, ISSN 1663-9812
Editore: Frontiers Media S.A.
DOI: 10.3389/fphar.2021.722889

Structural and functional annotation of solute carrier transporters: implication for drug discovery (si apre in una nuova finestra)

Autori: Vojtech Dvorak & Giulio Superti-Furga
Pubblicato in: Expert Opinion on Drug Discovery, 2023, ISSN 1746-0441
Editore: Informa Healthcare
DOI: 10.1080/17460441.2023.2244760

A substrate‐based ontology for human solute carriers (si apre in una nuova finestra)

Autori: Eva Meixner, Ulrich Goldmann, Vitaly Sedlyarov, Stefania Scorzoni, Manuele Rebsamen, Enrico Girardi, Giulio Superti‐Furga
Pubblicato in: Molecular Systems Biology, Numero 16/7, 2020, ISSN 1744-4292
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.15252/msb.20209652

Label-free high-throughput screening assay for the identification of norepinephrine transporter (NET/SLC6A2) inhibitors (si apre in una nuova finestra)

Autori: Hubert J. Sijben, Wieke M. van Oostveen, Peter B. R. Hartog, Laura Stucchi, Andrea Rossignoli, Giovanna Maresca, Lia Scarabottolo, Adriaan P. IJzerman, Laura H. Heitman
Pubblicato in: Scientific Reports, Numero 11/1, 2021, ISSN 2045-2322
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-021-91700-7

Targeting solute carriers to modulate receptor–ligand interactions (si apre in una nuova finestra)

Autori: Hubert J. Sijben, Giulio Superti-Furga, Adriaan P. IJzerman, Laura H. Heitman
Pubblicato in: Trends in Pharmacological Sciences, 2022, ISSN 0165-6147
Editore: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.tips.2022.02.004

Accelerating SLC Transporter Research: Streamlining Knowledge and Validated Tools (si apre in una nuova finestra)

Autori: Tabea Wiedmer, Alvaro Ingles-Prieto, Ulrich Goldmann, Claire M. Steppan, Giulio Superti-Furga, the RESOLUTE, REsolution consortia
Pubblicato in: Clinical Pharmacology & Therapeutics, Numero 00099236, 2022, ISSN 0009-9236
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1002/cpt.2639

Image-based quantification of mitochondrial iron uptake via Mitoferrin-2 (si apre in una nuova finestra)

Autori: Polesel M, Wildschut MHE, Doucerain C, Kuhn M, Flace A, Steck AL, Wilhelm M, Ingles-Prieto A, Wiedmer T, Superti-Furga G, Manolova V, Dürrenberger F.
Pubblicato in: Mitochondrion, 2024, ISSN 1567-7249
Editore: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.mito.2024.101889

Solid-supported membrane (SSM)-based electrophysiology assays using surface electrogenic event reader technology (SURFE²R) in early drug discovery (si apre in una nuova finestra)

Autori: Pommereau, A., Licher, T., & Bärenz, F.
Pubblicato in: Current Protocols, 2023, ISSN 2691-1299
Editore: Wiley
DOI: 10.1002/cpz1.650

Label-free detection of prostaglandin transporter (SLCO2A1) function and inhibition: insights by wound healing and TRACT assays (si apre in una nuova finestra)

Autori: Mocking TAM, van Oostveen W, Van Veldhoven JP, Minnee H, Fehres C, Whitehurst C, IJzerman AP, Heitman LH.
Pubblicato in: Front. Pharmacol., 2024, ISSN 1663-9812
Editore: Frontiers Media S.A.
DOI: 10.3389/fphar.2024.1372109

Proteochemometric Modeling Identifies Chemically Diverse Norepinephrine Transporter Inhibitors (si apre in una nuova finestra)

Autori: Brandon J. Bongers, Huub J. Sijben, Peter B. R. Hartog, Andrey Tarnovskiy, Adriaan P. IJzerman, Laura H. Heitman, and Gerard J. P. van Westen
Pubblicato in: Journal of Chemical Information and Modeling, 2023, ISSN 1549-9596
Editore: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jcim.2c01645

Studies of structural determinants of substrate binding in the Creatine Transporter (CreaT, SLC6A8) using molecular models (si apre in una nuova finestra)

Autori: Claire Colas, Giulia Banci, Riccardo Martini, Gerhard F. Ecker
Pubblicato in: Scientific Reports, Numero 10/1, 2020, ISSN 2045-2322
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-020-63189-z

Toward a Systematic Structural and Functional Annotation of Solute Carriers Transporters-Example of the SLC6 and SLC7 Families. (si apre in una nuova finestra)

Autori: Claire Colas
Pubblicato in: Frontiers in Pharmacology, 2020, ISSN 1663-9812
Editore: Frontiers Media S.A.
DOI: 10.3389/fphar.2020.01229

Impedance-Based Phenotypic Readout of Transporter Function: A Case for Glutamate Transporters (si apre in una nuova finestra)

Autori: Sijben HJ, Dall’ Acqua L, Liu R, Jarret A, Christodoulaki E, Onstein S, Wolf G, Verburgt SJ, Le Dévédec SE, Wiedmer T, Superti-Furga G, IJzerman AP and Heitman LH
Pubblicato in: Frontiers in Pharmacology, 2022, ISSN 1663-9812
Editore: Frontiers Media S.A.
DOI: 10.3389/fphar.2022.872335

A study of the dopamine transporter using the TRACT assay, a novel in vitro tool for solute carrier drug discovery (si apre in una nuova finestra)

Autori: Hubert J. Sijben, Julie J. E. van den Berg, Jeremy D. Broekhuis, Adriaan P. IJzerman, Laura H. Heitman
Pubblicato in: Scientific Reports, Numero 11/1, 2021, ISSN 2045-2322
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-020-79218-w

Gain-of-function genetic screens in human cells identify SLC transporters overcoming environmental nutrient restrictions (si apre in una nuova finestra)

Autori: Manuele Rebsamen, Enrico Girardi, Vitaly Sedlyarov, Stefania Scorzoni, Konstantinos Papakostas, Manuela Vollert, Justyna Konecka, Bettina Guertl, Kristaps Klavins, Tabea Wiedmer, Giulio Superti-Furga
Pubblicato in: Life Science Alliance, Numero 25751077, 2022, ISSN 2575-1077
Editore: Life Science Alliance, LLC
DOI: 10.26508/lsa.202201404

Still in Search for an EAAT Activator: GT949 Does Not Activate EAAT2, nor EAAT3 in Impedance and Radioligand Uptake Assays (si apre in una nuova finestra)

Autori: Lieve van Veggel, Tamara A.M. Mocking, Hubert J. Sijben, Rongfang Liu, Marina Gorostiola González, Majlen A. Dilweg, Jeroen Royakkers, Anna Li, Vijay Kumar, Yin Yao Dong, Alex Bullock, David B. Sauer, Hanne Diliën, Gerard J.P. van Westen, Rudy Schreiber, Laura H. Heitman, and Tim Vanmierlo
Pubblicato in: ACS Chemical Neuroscience, 2024, ISSN 1948-7193
Editore: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acschemneuro.3c00731

The RESOLUTE consortium: unlocking SLC transporters for drug discovery (si apre in una nuova finestra)

Autori: Giulio Superti-Furga, Daniel Lackner, Tabea Wiedmer, Alvaro Ingles-Prieto, Barbara Barbosa, Enrico Girardi, Ulrich Goldmann, Bettina Gürtl, Kristaps Klavins, Christoph Klimek, Sabrina Lindinger, Eva Liñeiro-Retes, André C. Müller, Svenja Onstein, Gregor Redinger, Daniela Reil, Vitaly Sedlyarov, Gernot Wolf, Matthew Crawford, Robert Everley, David Hepworth, Shenping Liu, Stephen Noell, Mary Pio
Pubblicato in: Nature Reviews Drug Discovery, Numero 19/7, 2020, Pagina/e 429-430, ISSN 1474-1776
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/d41573-020-00056-6

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