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Preservation of microorganisms by understanding the protective mechanisms of oligosaccharides

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Livrables

Documents, reports (3)
Protocol of samples handling (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Protocol of samples handling (rehydration, media composition, freezing, storage…)

Physical properties of LAB media (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Report on the glass transitions, viscosity and ice nucleation temperatures of LAB media

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Publications

Peer reviewed articles (29)
Use of Legume Wastewater Extracts on the Storage Stability of Freeze-Dried Lactiplantibacillus plantarum WCFS1 (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Gonçalo Nuno Martins, María Guerrero Sánchez, Angela Daniela Carboni, Stéphanie Cenard, Fernanda Fonseca, Andrea Gómez-Zavaglia, Paula Cristina Castilho
Publié dans: Food and Bioprocess Technology, 2024, ISSN 1935-5130
Éditeur: Springer Pub. Co.,
DOI: 10.1007/s11947-024-03554-2

A critical transfer temperature from slow cooling to cryogenic storage for optimal recovery across a range of cryopreserved mammalian cells (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Julie Meneghel, Peter Kilbride, Fernanda Fonseca, John Morris
Publié dans: Cryobiology, Numéro 109, 2023, Page(s) 28, ISSN 0011-2240
Éditeur: Academic Press
DOI: 10.1016/j.cryobiol.2022.11.088

Insights into the mechanisms of L. salivarius CECT5713 resistance to freeze-dried storage (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Maria Guerrero Sanchez, Stéphanie Passot, Sarrah Ghorbal, Sonia Campoy, Monica Olivares, Fernanda Fonseca
Publié dans: Cryobiology, 2023, ISSN 0011-2240
Éditeur: Academic Press
DOI: 10.1016/j.cryobiol.2023.104556

Dynamic Modeling of Carnobacterium maltaromaticum CNCM I-3298 Growth and Metabolite Production and Model-Based Process Optimization (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Cristian Puentes, Amélie Girardeau, Stephanie Passot, Fernanda Fonseca, Ioan-Cristian Trelea
Publié dans: Foods, Numéro 10/8, 2021, Page(s) 1922, ISSN 2304-8158
Éditeur: MDPI
DOI: 10.3390/foods10081922

Dataset on the Life Cycle Assessment of fructo- and galacto-oligosaccharides (FOS and GOS) produced by synthesis or hydrolysis. (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Esteban Gerbino, Camille Quentier, Caroline Pénicaud
Publié dans: Data in Brief, 2022, ISSN 2352-3409
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.dib.2022.108478

Fructose derived oligosaccharides prevent lipid membrane destabilization and DNA conformational alterations during vacuum-drying of Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Nelson Romano, Monica Marro, Maria Marsal, Pablo Loza-Álvarez, Andrea Gomez-Zavaglia
Publié dans: Food Research International, Numéro 143, 2021, Page(s) 110235, ISSN 0963-9969
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.foodres.2021.110235

Effect of protective agents on the storage stability of freeze-dried Ligilactobacillus salivarius CECT5713 (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Guerrero Sanchez, M., Passot, S., Campoy, S., Ollivares, M., Fonseca, F.
Publié dans: Applied Microbiology and Biotechnology, Numéro 01757598, 2022, ISSN 0175-7598
Éditeur: Springer Verlag
DOI: 10.1007/s00253-022-12201-9

Recent advances in β-galactosidase and fructosyltransferase immobilization technology (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Maria Micaela Ureta, Gonçalo Nuno Martins, Onofre Figueira, Pedro Filipe Pires, Paula Cristina Castilho, Andrea Gomez-Zavaglia
Publié dans: Critical Reviews in Food Science and Nutrition, 2020, Page(s) 1-32, ISSN 1040-8398
Éditeur: Taylor & Francis
DOI: 10.1080/10408398.2020.1783639

Molecular Simulation: a remarkable tool to study mechanisms of cell membrane preservation in probiotic bacteria (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: T. H. Ferreira, P. Maximiano, M. Ureta, A. Gomez-Zavaglia, and P. N. Simões
Publié dans: Current Opinion in Food Science, Numéro 50, 2023, Page(s) 100985, ISSN 2214-7993
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.cofs.2022.100985

The transfer temperature from slow cooling to cryogenic storage is critical for optimal recovery of cryopreserved mammalian cells (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Peter Kilbride, Julie Meneghel, Fernanda Fonseca, John Morris
Publié dans: PLOS ONE, Numéro 16/11, 2021, Page(s) e0259571, ISSN 1932-6203
Éditeur: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pone.0259571

Lactic Acid Bacteria in the Production of Traditional Fermented Foods and Beverages of Latin America (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Angela D. Carboni, Gonçalo N. Martins, Andrea Gómez-Zavaglia, Paula C. Castilho
Publié dans: Fermentation, Numéro 9, 2023, Page(s) 315, ISSN 2311-5637
Éditeur: MDPI
DOI: 10.3390/fermentation9040315

Membrane lipid composition of Carnobacterium maltaromaticum CNCM I-3298, a highly cryoresistant lactic bacterium (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: HP. Ta, C. Clarisse, E. Maes, N. Yamakawa, Y. Guérardel, F. Krzewinski, W. Zarzycka, D. Touboul, A. Girardeau, F. Fonseca, A. Kermarrec, M. Viau, A. Riaublanc, MH. Ropers
Publié dans: Chemistry and Physics of Lipids, 2023, ISSN 0009-3084
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.chemphyslip.2023.105326

Chickpeas’ cooking wastewater as an alternative source of galacto-oligosaccharides for improving the freeze-dried resistance of lactic acid bacteria (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Passot S., Cenard S., Lieben P., Ghorbal S., Martins G.N., Castilho P.C., Fonseca F.
Publié dans: ACS Food Science & Technology, 2024, ISSN 2692-1944
Éditeur: American Chemical Society Publications
DOI: 10.1021/acsfoodscitech.4c00120

Dataset on the life cycle assessment of the production of stabilized lactic acid bacteria (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Maite Gagneten, Camille Quentier, Stéphanie Passot, Stéphanie Cenard, Fernanda Fonseca, Caroline Pénicaud
Publié dans: Data in Brief, Numéro 60, 2025, Page(s) 111541, ISSN 2352-3409
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.dib.2025.111541

Infrared spectroscopy as an alternative methodology to evaluate the effect of structural features on the physical-chemical properties of inulins (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Nelson Romano, Cuauhtémoc Araujo-Andrade, Javier Lecot, Pablo Mobili, Andrea Gómez-Zavaglia
Publié dans: Food Research International, Numéro 109, 2018, Page(s) 223-231, ISSN 0963-9969
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.foodres.2018.04.032

Development and characterization of iron-pectin beads as a novel system for iron delivery to intestinal cells (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: F. Ghibaudo, E. Gerbino, A.A. Hugo, M.G. Simões, P. Alves, B.F.O. Costa, V. Campo Dallˊ Orto, A. Gómez-Zavaglia, P.N. Simões
Publié dans: Colloids and Surfaces B: Biointerfaces, Numéro 170, 2018, Page(s) 538-543, ISSN 0927-7765
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.colsurfb.2018.06.052

Physical events occurring during the cryopreservation of immortalized human T cells (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Julie Meneghel, Peter Kilbride, John G. Morris, Fernanda Fonseca
Publié dans: PLOS ONE, Numéro 14/5, 2019, Page(s) e0217304, ISSN 1932-6203
Éditeur: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pone.0217304

Long term stability and interaction with epithelial cells of freeze-dried pH-responsive liposomes functionalized with cholesterol-poly(acrylic acid) (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: M.G. Simões, A. Hugo, P. Alves, P.F. Pérez, A. Gómez-Zavaglia, P.N. Simões
Publié dans: Colloids and Surfaces B: Biointerfaces, Numéro 164, 2018, Page(s) 50-57, ISSN 0927-7765
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.colsurfb.2018.01.018

Technological Aspects of the Production of Fructo and Galacto-Oligosaccharides. Enzymatic Synthesis and Hydrolysis (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Gonçalo N. Martins, Maria Micaela Ureta, E. Elizabeth Tymczyszyn, Paula C. Castilho, Andrea Gomez-Zavaglia
Publié dans: Frontiers in Nutrition, Numéro 6, 2019, ISSN 2296-861X
Éditeur: Frontiers
DOI: 10.3389/fnut.2019.00078

Factors influencing the membrane fluidity and the impact on production of lactic acid bacteria starters (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Fernanda Fonseca, Caroline Pénicaud, E. Elizabeth Tymczyszyn, Andrea Gómez-Zavaglia, Stéphanie Passot
Publié dans: Applied Microbiology and Biotechnology, 2019, ISSN 0175-7598
Éditeur: Springer Verlag
DOI: 10.1007/s00253-019-10002-1

Influence of culture conditions on the technological properties of Carnobacterium maltaromaticum CNCM I‐3298 starters (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: A. Girardeau, C. Puentes, S. Keravec, P. Peteuil, I.C. Trelea, F. Fonseca
Publié dans: Journal of Applied Microbiology, Numéro 126/5, 2019, Page(s) 1468-1479, ISSN 1364-5072
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/jam.14223

Nutritional and technological properties of a quinoa (Chenopodium quinoa Willd.) spray-dried powdered extract (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Nelson Romano, María Micaela Ureta, María Guerrero-Sánchez, Andrea Gómez-Zavaglia
Publié dans: Food Research International, Numéro 129, 2020, Page(s) 108884, ISSN 0963-9969
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.foodres.2019.108884

Mechanistic study of the differences in lactic acid bacteria resistance to freeze- or spray-drying and storage (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Gagneten M., Passot S., Cenard S., Lieben P., Ghorbal S., Schebor C., Fonseca F.
Publié dans: Applied Microbiology and Biotechnology, 2024, ISSN 1432-0614
Éditeur: Springer
DOI: 10.1007/s00253-024-13186-3

Chickpeas’ and lentils' soaking and cooking wastewaters repurposed for growing lactic acid bacteria. (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Martins GN, Carboni AD, Hugo AA, Castilho PC, Gómez-Zavaglia A.
Publié dans: Foods, 2023, ISSN 2304-8158
Éditeur: MDPI
DOI: 10.3390/foods12122324

Multi-objective optimization of frozen and freeze-dried Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus CFL1 production via the modification of fermentation conditions (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Maria de L TovillaCoutiño; Stéphanie Passot; Ioan-Cristian Trelea; Marie-Hélène Ropers; Yann Gohon; Fernanda Fonseca
Publié dans: Journal of Applied Microbiology, Numéro 3, 2023, ISSN 0021-8847
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/jambio/lxad003

Joining environmental impacts and product quality in Life Cycle Assessment: The case of the production and storage of lactic acid bacteria concentrates (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Maite Gagneten, Camille Quentier, Stéphanie Passot, Stéphanie Cenard, Fernanda Fonseca, Caroline Pénicaud
Publié dans: Cleaner Environmental Systems, Numéro 15, 2024, Page(s) 100245, ISSN 2666-7894
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.cesys.2024.100245

Ligilactobacillus salivarius functionalities, applications, and manufacturing challenges (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: M. Guerrero Sanchez; S. Passot; S. Campoy; M. Olivares; F. Fonseca
Publié dans: Applied Microbiology and Biotechnology, Numéro 6, 2021, ISSN 0175-7598
Éditeur: Springer Verlag
DOI: 10.1007/s00253-021-11694-0

Insights into lactic acid bacteria cryoresistance using FTIR microspectroscopy (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Amélie Girardeau; Stéphanie Passot; Julie Meneghel; Stéphanie Cenard; Pascale Lieben; Ioan-Cristian Trelea; Fernanda Fonseca
Publié dans: Analytical and Bioanalytical Chemistry, Numéro 5, 2022, Page(s) 1425-1443, ISSN 1618-2642
Éditeur: Springer Verlag
DOI: 10.1007/s00216-021-03774-x

Influence of Thermal Treatment and Granulometry on Physicochemical, Techno-Functional and Nutritional Properties of Lentil Flours (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Angela Daniela Carboni, Gonçalo Nuno Martins, Paula Cristina Castilho, María Cecilia Puppo, Cristina Ferrero
Publié dans: Foods, Numéro 13, 2024, Page(s) 2744, ISSN 2304-8158
Éditeur: MDPI
DOI: 10.3390/foods13172744

Conference proceedings (10)
Methodological approach towards environmentally friendly processes for preserving lactic acid bacteria.Oral presentation

Auteurs: Caroline Pénicaud, Bruno Perret, Stéphanie Passot, Camille Quentier, Fernanda Fonseca.
Publié dans: CBL 2019 - 22. Colloque du Club des Bactéries Lactiques-12-14 June, 2019
Éditeur: Université de Caen

The Critical Thermal Range For Controlled Rate Cooling For Mammalian Cell Cryopreservation (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Julie Meneghel, Peter Kilbride, Fernanda Fonseca, John Morris
Publié dans: Cryobiology, Numéro 91, 2019, Page(s) 175, ISSN 0011-2240
Éditeur: Academic Press
DOI: 10.1016/j.cryobiol.2019.10.118

Preserving bacteria with oligosaccharides and eco-friendly processes (Premium) (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Andrea Gomez-Zavaglia, Stéphanie Passot, Caroline Pénicaud, Paula Castilho, Pedro Nuno Simões, Marie Hélène Ropers, Bruno Perret, Alberto Garach Domech, Pablo Loza-Alvarez, John Morris, Peter Kilbride, Sophie Keravec, Fernanda Fonseca
Publié dans: Cryobiology, Numéro 85, 2018, Page(s) 172-173, ISSN 0011-2240
Éditeur: Academic Press
DOI: 10.1016/j.cryobiol.2018.10.203

Physical events during cryopreservation: consequences on cells’ post-thaw performance and on cryobiological protocols optimisation. Invited lecture

Auteurs: Fernanda Fonseca, Julie Meneghel, Peter Kilbride, Stéphanie Passot, G. John Morris
Publié dans: 9. International Symposium on Lyophilization of Pharmaceuticals ISLFD, Numéro 15, 2019
Éditeur: Université Paris-Saclay

Avancées récentes sur la production et la stabilisation de bactéries lactiques à haute fonctionnalité

Auteurs: Stéphanie Passot; Catherine Beal; Fernanda Fonseca
Publié dans: CBL 2019 - 22. Colloque du Club des Bactéries Lactiques, Jun 2019, Caen, France, Numéro 6, 2019
Éditeur: CBL proceedings

Physical events during cryopreservation: consequences on cells’ post-thaw performance and on cryobiological protocols optimisation

Auteurs: Fernanda Fonseca; Julie Meneghel; Peter Kilbride; Stéphanie Passot; John Morris, G.
Publié dans: HAL, Numéro 1, 2019
Éditeur: Université Paris-Saclay

Complementary Analytical Approaches Improving Knowledge On Lactic Acid Bacteria Cryoresistance (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Amelie Girardeau, Julie Meneghel, Ioan-Cristian Trelea, Stephanie Passot, Fernanda Fonseca
Publié dans: Cryobiology, Numéro 91, 2019, Page(s) 166-167, ISSN 0011-2240
Éditeur: Academic Press
DOI: 10.1016/j.cryobiol.2019.10.086

Development Of A Simplified Lipid Model Of Bacterial Membrane To Investigate Specific Interactions With Oligosaccharides (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Fernanda Fonseca, Michele Da Silva Pinto, Julie Meneghel, Pascale Lieben, Stephanie Passot, Yann Gohon, Marie Helene Ropers
Publié dans: Cryobiology, Numéro 91, 2019, Page(s) 173, ISSN 0011-2240
Éditeur: Academic Press
DOI: 10.1016/j.cryobiol.2019.10.109

Differential scanning calorimetry applied to the preservation of bacteria and mammalian cells

Auteurs: Fonseca, Fernanda; Passot, Stéphanie
Publié dans: https://hal.science/hal-04395225, Numéro 19, 2023
Éditeur: Université Paris-Saclay

Physical events during cryopreservation: consequences on cells’ post-thaw performance and on cryobiological protocols optimisation. Invited lecture

Auteurs: Fernanda Fonseca, Julie Meneghel, Peter Kilbride, Stéphanie Passot, G. John Morris
Publié dans: . 9. International Symposium on Lyophilization of Pharmaceuticals ISLFD, 2019
Éditeur: Ghent University

Other (3)
Website

Auteurs: PREMIUM
Publié dans: 2018
Éditeur: INRAE

Flyer

Auteurs: PREMIUM
Publié dans: 2020
Éditeur: INRAE

Promotional video

Auteurs: PREMIUM
Publié dans: 2020
Éditeur: INRAE

Thesis and dissertations (4)
Improving the cryo-resistance of a lactic acid bacterium by modulating fermentation and stabilization conditions: consequences on the properties of the lipid membrane

Auteurs: Tovilla Coutino, Maria de Lourdes
Publié dans: https://pastel.hal.science/tel-03942745, Numéro 11, 2022
Éditeur: HAL

Study of C. maltaromaticum CNCM I-3298 cellular characteristics to improve performance of biological time-temperature integrators and gain more insight into lactic acid bacteria cryoresistance

Auteurs: Amélie Girardeau
Publié dans: 2021
Éditeur: Université Paris-Saclay, INRAE, AgroParisTech, UMR SayFood

Improvements of Ligilatobacillus salivarius CECT5713 resistance to freeze-drying and storage modifying the production conditions and studying the mechanisms involved

Auteurs: Maria Guerrero Sanchez
Publié dans: 2022
Éditeur: Universidad de Granada

Improving the cryo-resistance of a lactic acid bacterium by modulating fermentation and stabilization conditions: consequences on the properties of the lipid membrane

Auteurs: Maria de Lourdes Tovilla-Coutiño
Publié dans: 2022
Éditeur: Université Paris-Saclay, INRAE, AgroParisTech, UMR SayFood

Book chapters (3)
Freeze-Drying of Lactic Acid Bacteria: A Stepwise Approach for Developing a Freeze-Drying Protocol Based on Physical Properties (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Fernanda Fonseca, Amélie Girardeau, Stéphanie Passot
Publié dans: Cryopreservation and Freeze-Drying Protocols, Numéro 2180, 2021, Page(s) 703-719, ISBN 978-1-0716-0782-4
Éditeur: Springer US
DOI: 10.1007/978-1-0716-0783-1_38

Scale-Up of Layer-by-Layer Microencapsulation and Freeze-Drying of Probiotic Bacteria (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Nelson Romano, Gina Tavares, Stéphanie Passot, Fernanda Fonseca, Sonia Campoy, Maria Guerrero, Patrícia Alves, Patrícia Coimbra, Andrea Gomez-Zavaglia, Pedro Nuno Simões
Publié dans: Methods and Protocols in Food Science, Basic Protocols in Encapsulation of Food Ingredients, 2024, Page(s) 57-67
Éditeur: Springer US
DOI: 10.1007/978-1-0716-4148-4_7

Application of Lactic Acid Bacteria in Time-Temperature Integrators (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Amélie Girardeau, Vanessa Biscola, Sophie Keravec, Georges Corrieu, Fernanda Fonseca
Publié dans: Lactic Acid Bacteria - A Functional Approach, 2020, Page(s) 241-260, ISBN 9780-429422591
Éditeur: CRC Press
DOI: 10.1201/9780429422591-14

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Dernière mise à jour: 8 Decembre 2023

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