Cel
Protein N-termini represent a wealth of biological information, such as their generation by limited proteolysis, which sculpts proteome functionality by yielding protein-sized cleavage products with novel functionality. N-terminomics is a branch of functional proteomics and enables the analysis of thousands of protein N-termini in an unbiased manner. By targeting native, proteolytically generated or acetylated protein N-termini as well as uncovering novel translation initiation sites, N-terminomics bears relevance to proteolysis and proteogenomics research. Unlike proteomic assays to study modifications such as phosphorylation, N-terminomics has remained inaccessible to non-expert laboratories due to a lack of ready-to-use kit formats or commercial services. Based on a recently published N-terminomic workflow by my laboratory, the present project aims to fill this niche by laying the foundation to represent N-terminomics (sample preparation up to mass spectrometry analysis) in a kit-like format together with online data analysis. Development steps include inclusion of multiple internal standards for improved sample-to-sample comparability, sole usage of cost-effective, disposable “small-scale” equipment in sample preparation, minimization of required input material, adaption to different input material including cryopreserved and formalin-fixed, paraffin-embedded samples, as well as web-based mass spectrometry data analysis and annotation. This endeavor is based on multiple collaborative projects of the applicant with pharmaceutical companies and backed by interest of proteomic supply companies. In a small forward-looking activity, the project will explore the application N-terminomics in molecular diagnostics of bladder cancer; based on the rationale local infiltration by solid tumors is based on differential proteolysis. This activity serves an initial step to add N-terminomics to the toolbox of molecular pathology.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
- nauki przyrodnicze informatyka nauka o danych
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne biochemia biocząsteczki białka proteomika
- medycyna i nauki o zdrowiu medycyna kliniczna onkologia rak pęcherza moczowego
- medycyna i nauki o zdrowiu medycyna kliniczna patologia
- nauki przyrodnicze nauki chemiczne chemia analityczna spektrometria mas
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Przepraszamy… podczas wykonywania operacji wystąpił nieoczekiwany błąd.
Wymagane uwierzytelnienie. Powodem może być wygaśnięcie sesji.
Dziękujemy za przesłanie opinii. Wkrótce otrzymasz wiadomość e-mail z potwierdzeniem zgłoszenia. W przypadku wybrania opcji otrzymywania powiadomień o statusie zgłoszenia, skontaktujemy się również gdy status ulegnie zmianie.
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
-
H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
GŁÓWNY PROGRAM
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
ERC-POC - Proof of Concept Grant
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
(odnośnik otworzy się w nowym oknie) ERC-2017-PoC
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszeniaInstytucja przyjmująca
Kwota netto dofinansowania ze środków Unii Europejskiej. Suma środków otrzymanych przez uczestnika, pomniejszona o kwotę unijnego dofinansowania przekazanego powiązanym podmiotom zewnętrznym. Uwzględnia podział unijnego dofinansowania pomiędzy bezpośrednich beneficjentów projektu i pozostałych uczestników, w tym podmioty zewnętrzne.
79106 Freiburg
Niemcy
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.