Transgenerational epigenetic inheritance of chromatin states : the role of Polycomb and 3D chromosome architecture

Información del proyecto

3DEpi

Identificador del acuerdo de subvención: 788972

DOI

10.3030/788972

Proyecto cerrado

Fecha de la firma de la CE 5 Junio 2018

Fecha de inicio 1 Noviembre 2018

Fecha de finalización 31 Octubre 2024

Financiado con arreglo a

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coste total

€ 2 500 000,00

Aportación de la UE

€ 2 500 000,00

Coordinado por

CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE CNRS
France

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Publicaciones

Peer reviewed articles (14)

Higher-Order Chromosomal Structures Mediate Genome Function

Autores: Ivana Jerković, Quentin Szabo, Frédéric Bantignies, Giacomo Cavalli
Publicado en: Journal of Molecular Biology, Edición 432/3, 2020, Página(s) 676-681, ISSN 0022-2836
Editor: Academic Press
DOI: 10.1016/j.jmb.2019.10.014

Sustained inactivation of the Polycomb PRC1 complex induces DNA repair defects and genomic instability in epigenetic tumors

Autores: Chetan C. Rawal, Vincent Loubiere, Nadejda L. Butova, Juliette Gracia, Victoria Parreno, Chiara Merigliano, Anne-Marie Martinez, Giacomo Cavalli, Irene Chiolo
Publicado en: Histochemistry and Cell Biology, Edición 162, 2024, Página(s) 133-147, ISSN 0948-6143
Editor: Springer Verlag
DOI: 10.1007/s00418-024-02302-z

Principles of genome folding into topologically associating domains

Autores: Quentin Szabo, Frédéric Bantignies, Giacomo Cavalli
Publicado en: Science Advances, Edición 5/4, 2019, Página(s) eaaw1668, ISSN 2375-2548
Editor: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/sciadv.aaw1668

Repression and 3D-restructuring resolves regulatory conflicts in evolutionarily rearranged genomes

Autores: Alessa R. Ringel, Quentin Szabo, Andrea M. Chiariello, Konrad Chudzik, Robert Schöpflin, Patricia Rothe, Alexandra L. Mattei, Tobias Zehnder, Dermot Harnett, Verena Laupert, Simona Bianco, Sara Hetzel, Juliane Glaser, Mai H.Q. Phan, Magdalena Schindler, Daniel M. Ibrahim, Christina Paliou, Andrea Esposito, Cesar A. Prada-Medina, Stefan A. Haas, Peter Giere, Martin Vingron, Lars Wittler, Alexander
Publicado en: Cell, Edición 185, 2022, Página(s) 3689-3704.e21, ISSN 0092-8674
Editor: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2022.09.006

Transient loss of Polycomb components induces an epigenetic cancer fate

Autores: V. Parreno, V. Loubiere, B. Schuettengruber, L. Fritsch, C. C. Rawal, M. Erokhin, B. Győrffy, D. Normanno, M. Di Stefano, J. Moreaux, N. L. Butova, I. Chiolo, D. Chetverina, A.-M. Martinez, G. Cavalli
Publicado en: Nature, Edición 629, 2024, Página(s) 688-696, ISSN 0028-0836
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-024-07328-w

HiCmapTools: a tool to access HiC contact maps

Autores: Jia-Ming Chang, Yi-Fu Weng, Wei-Ting Chang, Fu-An Lin, Giacomo Cavalli
Publicado en: BMC Bioinformatics, Edición 23, 2022, ISSN 1471-2105
Editor: BioMed Central
DOI: 10.1186/s12859-022-04589-y

Interchromosomal contacts between regulatory regions trigger stable transgenerational epigenetic inheritance in Drosophila

Autores: Maximilian H. Fitz-James, Gonzalo Sabarís, Peter Sarkies, Frédéric Bantignies, Giacomo Cavalli
Publicado en: Molecular Cell, Edición 85, 2025, Página(s) 677-691.e6, ISSN 1097-2765
Editor: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2024.11.021

A mechanistic basis for genetic assimilation in natural fly populations

Autores: Gonzalo Sabarís, Bernd Schuettengruber, Giorgio L. Papadopoulos, Marta Coronado-Zamora, Maximilian H. Fitz-James, Josefa González, Giacomo Cavalli
Publicado en: Proceedings of the National Academy of Sciences, Edición 122, 2025, ISSN 0027-8424
Editor: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.2415982122

Widespread activation of developmental gene expression characterized by PRC1-dependent chromatin looping

Autores: V. Loubiere, G. L. Papadopoulos, Q. Szabo, A-M. Martinez, G. Cavalli
Publicado en: Science Advances, Edición 6/2, 2020, Página(s) eaax4001, ISSN 2375-2548
Editor: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/sciadv.aax4001

Advances in epigenetics link genetics to the environment and disease

Autores: Giacomo Cavalli, Edith Heard
Publicado en: Nature, Edición 571/7766, 2019, Página(s) 489-499, ISSN 0028-0836
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-019-1411-0

4D Genome Rewiring during Oncogene-Induced and Replicative Senescence

Autores: Satish Sati, Boyan Bonev, Quentin Szabo, Daniel Jost, Paul Bensadoun, Francois Serra, Vincent Loubiere, Giorgio Lucio Papadopoulos, Juan-Carlos Rivera-Mulia, Lauriane Fritsch, Pauline Bouret, David Castillo, Josep Ll. Gelpi, Modesto Orozco, Cedric Vaillant, Franck Pellestor, Frederic Bantignies, Marc A. Marti-Renom, David M. Gilbert, Jean-Marc Lemaitre, Giacomo Cavalli
Publicado en: Molecular Cell, Edición 78/3, 2020, Página(s) 522-538.e9, ISSN 1097-2765
Editor: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2020.03.007

Regulation of single-cell genome organization into TADs and chromatin nanodomains

Autores: Quentin Szabo, Axelle Donjon, Ivana Jerković, Giorgio L. Papadopoulos, Thierry Cheutin, Boyan Bonev, Elphège P. Nora, Benoit G. Bruneau, Frédéric Bantignies, Giacomo Cavalli
Publicado en: Nature Genetics, Edición 52/11, 2020, Página(s) 1151-1157, ISSN 1061-4036
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41588-020-00716-8

Understanding 3D genome organization by multidisciplinary methods

Autores: Ivana Jerkovic´, Giacomo Cavalli
Publicado en: Nature Reviews Molecular Cell Biology, 2021, ISSN 1471-0072
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41580-021-00362-w

Mechanisms of Polycomb group protein function in cancer

Autores: Victoria Parreno, Anne-Marie Martinez, Giacomo Cavalli
Publicado en: Cell Research, Edición 32, 2022, Página(s) 231-253, ISSN 1001-0602
Editor: Kexue Chubaneshe/Science Press
DOI: 10.1038/s41422-021-00606-6