Transgenerational epigenetic inheritance of chromatin states : the role of Polycomb and 3D chromosome architecture

Projektinformationen

3DEpi

ID Finanzhilfevereinbarung: 788972

DOI

10.3030/788972

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 5 Juni 2018

Startdatum 1 November 2018

Enddatum 31 Oktober 2024

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten

€ 2 500 000,00

EU-Beitrag

€ 2 500 000,00

Koordiniert durch

CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE CNRS
France

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Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (14)

Higher-Order Chromosomal Structures Mediate Genome Function

Autoren: Ivana Jerković, Quentin Szabo, Frédéric Bantignies, Giacomo Cavalli
Veröffentlicht in: Journal of Molecular Biology, Ausgabe 432/3, 2020, Seite(n) 676-681, ISSN 0022-2836
Herausgeber: Academic Press
DOI: 10.1016/j.jmb.2019.10.014

Sustained inactivation of the Polycomb PRC1 complex induces DNA repair defects and genomic instability in epigenetic tumors

Autoren: Chetan C. Rawal, Vincent Loubiere, Nadejda L. Butova, Juliette Gracia, Victoria Parreno, Chiara Merigliano, Anne-Marie Martinez, Giacomo Cavalli, Irene Chiolo
Veröffentlicht in: Histochemistry and Cell Biology, Ausgabe 162, 2024, Seite(n) 133-147, ISSN 0948-6143
Herausgeber: Springer Verlag
DOI: 10.1007/s00418-024-02302-z

Principles of genome folding into topologically associating domains

Autoren: Quentin Szabo, Frédéric Bantignies, Giacomo Cavalli
Veröffentlicht in: Science Advances, Ausgabe 5/4, 2019, Seite(n) eaaw1668, ISSN 2375-2548
Herausgeber: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/sciadv.aaw1668

Repression and 3D-restructuring resolves regulatory conflicts in evolutionarily rearranged genomes

Autoren: Alessa R. Ringel, Quentin Szabo, Andrea M. Chiariello, Konrad Chudzik, Robert Schöpflin, Patricia Rothe, Alexandra L. Mattei, Tobias Zehnder, Dermot Harnett, Verena Laupert, Simona Bianco, Sara Hetzel, Juliane Glaser, Mai H.Q. Phan, Magdalena Schindler, Daniel M. Ibrahim, Christina Paliou, Andrea Esposito, Cesar A. Prada-Medina, Stefan A. Haas, Peter Giere, Martin Vingron, Lars Wittler, Alexander
Veröffentlicht in: Cell, Ausgabe 185, 2022, Seite(n) 3689-3704.e21, ISSN 0092-8674
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2022.09.006

Transient loss of Polycomb components induces an epigenetic cancer fate

Autoren: V. Parreno, V. Loubiere, B. Schuettengruber, L. Fritsch, C. C. Rawal, M. Erokhin, B. Győrffy, D. Normanno, M. Di Stefano, J. Moreaux, N. L. Butova, I. Chiolo, D. Chetverina, A.-M. Martinez, G. Cavalli
Veröffentlicht in: Nature, Ausgabe 629, 2024, Seite(n) 688-696, ISSN 0028-0836
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-024-07328-w

HiCmapTools: a tool to access HiC contact maps

Autoren: Jia-Ming Chang, Yi-Fu Weng, Wei-Ting Chang, Fu-An Lin, Giacomo Cavalli
Veröffentlicht in: BMC Bioinformatics, Ausgabe 23, 2022, ISSN 1471-2105
Herausgeber: BioMed Central
DOI: 10.1186/s12859-022-04589-y

Interchromosomal contacts between regulatory regions trigger stable transgenerational epigenetic inheritance in Drosophila

Autoren: Maximilian H. Fitz-James, Gonzalo Sabarís, Peter Sarkies, Frédéric Bantignies, Giacomo Cavalli
Veröffentlicht in: Molecular Cell, Ausgabe 85, 2025, Seite(n) 677-691.e6, ISSN 1097-2765
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2024.11.021

A mechanistic basis for genetic assimilation in natural fly populations

Autoren: Gonzalo Sabarís, Bernd Schuettengruber, Giorgio L. Papadopoulos, Marta Coronado-Zamora, Maximilian H. Fitz-James, Josefa González, Giacomo Cavalli
Veröffentlicht in: Proceedings of the National Academy of Sciences, Ausgabe 122, 2025, ISSN 0027-8424
Herausgeber: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.2415982122

Widespread activation of developmental gene expression characterized by PRC1-dependent chromatin looping

Autoren: V. Loubiere, G. L. Papadopoulos, Q. Szabo, A-M. Martinez, G. Cavalli
Veröffentlicht in: Science Advances, Ausgabe 6/2, 2020, Seite(n) eaax4001, ISSN 2375-2548
Herausgeber: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/sciadv.aax4001

Advances in epigenetics link genetics to the environment and disease

Autoren: Giacomo Cavalli, Edith Heard
Veröffentlicht in: Nature, Ausgabe 571/7766, 2019, Seite(n) 489-499, ISSN 0028-0836
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-019-1411-0

4D Genome Rewiring during Oncogene-Induced and Replicative Senescence

Autoren: Satish Sati, Boyan Bonev, Quentin Szabo, Daniel Jost, Paul Bensadoun, Francois Serra, Vincent Loubiere, Giorgio Lucio Papadopoulos, Juan-Carlos Rivera-Mulia, Lauriane Fritsch, Pauline Bouret, David Castillo, Josep Ll. Gelpi, Modesto Orozco, Cedric Vaillant, Franck Pellestor, Frederic Bantignies, Marc A. Marti-Renom, David M. Gilbert, Jean-Marc Lemaitre, Giacomo Cavalli
Veröffentlicht in: Molecular Cell, Ausgabe 78/3, 2020, Seite(n) 522-538.e9, ISSN 1097-2765
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2020.03.007

Regulation of single-cell genome organization into TADs and chromatin nanodomains

Autoren: Quentin Szabo, Axelle Donjon, Ivana Jerković, Giorgio L. Papadopoulos, Thierry Cheutin, Boyan Bonev, Elphège P. Nora, Benoit G. Bruneau, Frédéric Bantignies, Giacomo Cavalli
Veröffentlicht in: Nature Genetics, Ausgabe 52/11, 2020, Seite(n) 1151-1157, ISSN 1061-4036
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41588-020-00716-8

Understanding 3D genome organization by multidisciplinary methods

Autoren: Ivana Jerkovic´, Giacomo Cavalli
Veröffentlicht in: Nature Reviews Molecular Cell Biology, 2021, ISSN 1471-0072
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41580-021-00362-w

Mechanisms of Polycomb group protein function in cancer

Autoren: Victoria Parreno, Anne-Marie Martinez, Giacomo Cavalli
Veröffentlicht in: Cell Research, Ausgabe 32, 2022, Seite(n) 231-253, ISSN 1001-0602
Herausgeber: Kexue Chubaneshe/Science Press
DOI: 10.1038/s41422-021-00606-6