Transgenerational epigenetic inheritance of chromatin states : the role of Polycomb and 3D chromosome architecture

Informazioni relative al progetto

3DEpi

ID dell’accordo di sovvenzione: 788972

DOI

10.3030/788972

Progetto chiuso

Data della firma CE 5 Giugno 2018

Data di avvio 1 Novembre 2018

Data di completamento 31 Ottobre 2024

Finanziato da

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Costo totale

€ 2 500 000,00

Contributo UE

€ 2 500 000,00

Coordinato da

CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE CNRS
France

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Pubblicazioni

Peer reviewed articles (14)

Higher-Order Chromosomal Structures Mediate Genome Function

Autori: Ivana Jerković, Quentin Szabo, Frédéric Bantignies, Giacomo Cavalli
Pubblicato in: Journal of Molecular Biology, Numero 432/3, 2020, Pagina/e 676-681, ISSN 0022-2836
Editore: Academic Press
DOI: 10.1016/j.jmb.2019.10.014

Sustained inactivation of the Polycomb PRC1 complex induces DNA repair defects and genomic instability in epigenetic tumors

Autori: Chetan C. Rawal, Vincent Loubiere, Nadejda L. Butova, Juliette Gracia, Victoria Parreno, Chiara Merigliano, Anne-Marie Martinez, Giacomo Cavalli, Irene Chiolo
Pubblicato in: Histochemistry and Cell Biology, Numero 162, 2024, Pagina/e 133-147, ISSN 0948-6143
Editore: Springer Verlag
DOI: 10.1007/s00418-024-02302-z

Principles of genome folding into topologically associating domains

Autori: Quentin Szabo, Frédéric Bantignies, Giacomo Cavalli
Pubblicato in: Science Advances, Numero 5/4, 2019, Pagina/e eaaw1668, ISSN 2375-2548
Editore: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/sciadv.aaw1668

Repression and 3D-restructuring resolves regulatory conflicts in evolutionarily rearranged genomes

Autori: Alessa R. Ringel, Quentin Szabo, Andrea M. Chiariello, Konrad Chudzik, Robert Schöpflin, Patricia Rothe, Alexandra L. Mattei, Tobias Zehnder, Dermot Harnett, Verena Laupert, Simona Bianco, Sara Hetzel, Juliane Glaser, Mai H.Q. Phan, Magdalena Schindler, Daniel M. Ibrahim, Christina Paliou, Andrea Esposito, Cesar A. Prada-Medina, Stefan A. Haas, Peter Giere, Martin Vingron, Lars Wittler, Alexander
Pubblicato in: Cell, Numero 185, 2022, Pagina/e 3689-3704.e21, ISSN 0092-8674
Editore: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2022.09.006

Transient loss of Polycomb components induces an epigenetic cancer fate

Autori: V. Parreno, V. Loubiere, B. Schuettengruber, L. Fritsch, C. C. Rawal, M. Erokhin, B. Győrffy, D. Normanno, M. Di Stefano, J. Moreaux, N. L. Butova, I. Chiolo, D. Chetverina, A.-M. Martinez, G. Cavalli
Pubblicato in: Nature, Numero 629, 2024, Pagina/e 688-696, ISSN 0028-0836
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-024-07328-w

HiCmapTools: a tool to access HiC contact maps

Autori: Jia-Ming Chang, Yi-Fu Weng, Wei-Ting Chang, Fu-An Lin, Giacomo Cavalli
Pubblicato in: BMC Bioinformatics, Numero 23, 2022, ISSN 1471-2105
Editore: BioMed Central
DOI: 10.1186/s12859-022-04589-y

Interchromosomal contacts between regulatory regions trigger stable transgenerational epigenetic inheritance in Drosophila

Autori: Maximilian H. Fitz-James, Gonzalo Sabarís, Peter Sarkies, Frédéric Bantignies, Giacomo Cavalli
Pubblicato in: Molecular Cell, Numero 85, 2025, Pagina/e 677-691.e6, ISSN 1097-2765
Editore: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2024.11.021

A mechanistic basis for genetic assimilation in natural fly populations

Autori: Gonzalo Sabarís, Bernd Schuettengruber, Giorgio L. Papadopoulos, Marta Coronado-Zamora, Maximilian H. Fitz-James, Josefa González, Giacomo Cavalli
Pubblicato in: Proceedings of the National Academy of Sciences, Numero 122, 2025, ISSN 0027-8424
Editore: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.2415982122

Widespread activation of developmental gene expression characterized by PRC1-dependent chromatin looping

Autori: V. Loubiere, G. L. Papadopoulos, Q. Szabo, A-M. Martinez, G. Cavalli
Pubblicato in: Science Advances, Numero 6/2, 2020, Pagina/e eaax4001, ISSN 2375-2548
Editore: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/sciadv.aax4001

Advances in epigenetics link genetics to the environment and disease

Autori: Giacomo Cavalli, Edith Heard
Pubblicato in: Nature, Numero 571/7766, 2019, Pagina/e 489-499, ISSN 0028-0836
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-019-1411-0

4D Genome Rewiring during Oncogene-Induced and Replicative Senescence

Autori: Satish Sati, Boyan Bonev, Quentin Szabo, Daniel Jost, Paul Bensadoun, Francois Serra, Vincent Loubiere, Giorgio Lucio Papadopoulos, Juan-Carlos Rivera-Mulia, Lauriane Fritsch, Pauline Bouret, David Castillo, Josep Ll. Gelpi, Modesto Orozco, Cedric Vaillant, Franck Pellestor, Frederic Bantignies, Marc A. Marti-Renom, David M. Gilbert, Jean-Marc Lemaitre, Giacomo Cavalli
Pubblicato in: Molecular Cell, Numero 78/3, 2020, Pagina/e 522-538.e9, ISSN 1097-2765
Editore: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2020.03.007

Regulation of single-cell genome organization into TADs and chromatin nanodomains

Autori: Quentin Szabo, Axelle Donjon, Ivana Jerković, Giorgio L. Papadopoulos, Thierry Cheutin, Boyan Bonev, Elphège P. Nora, Benoit G. Bruneau, Frédéric Bantignies, Giacomo Cavalli
Pubblicato in: Nature Genetics, Numero 52/11, 2020, Pagina/e 1151-1157, ISSN 1061-4036
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41588-020-00716-8

Understanding 3D genome organization by multidisciplinary methods

Autori: Ivana Jerkovic´, Giacomo Cavalli
Pubblicato in: Nature Reviews Molecular Cell Biology, 2021, ISSN 1471-0072
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41580-021-00362-w

Mechanisms of Polycomb group protein function in cancer

Autori: Victoria Parreno, Anne-Marie Martinez, Giacomo Cavalli
Pubblicato in: Cell Research, Numero 32, 2022, Pagina/e 231-253, ISSN 1001-0602
Editore: Kexue Chubaneshe/Science Press
DOI: 10.1038/s41422-021-00606-6