Transgenerational epigenetic inheritance of chromatin states : the role of Polycomb and 3D chromosome architecture

Informacje na temat projektu

3DEpi

Identyfikator umowy o grant: 788972

DOI

10.3030/788972

Projekt został zamknięty

Data podpisania przez KE 5 Czerwca 2018

Data rozpoczęcia 1 Listopada 2018

Data zakończenia 31 Października 2024

Finansowanie w ramach

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Koszt całkowity

€ 2 500 000,00

Wkład UE

€ 2 500 000,00

Koordynowany przez

CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE CNRS
France

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Publikacje

Peer reviewed articles (14)

Higher-Order Chromosomal Structures Mediate Genome Function

Autorzy: Ivana Jerković, Quentin Szabo, Frédéric Bantignies, Giacomo Cavalli
Opublikowane w: Journal of Molecular Biology, Numer 432/3, 2020, Strona(/y) 676-681, ISSN 0022-2836
Wydawca: Academic Press
DOI: 10.1016/j.jmb.2019.10.014

Sustained inactivation of the Polycomb PRC1 complex induces DNA repair defects and genomic instability in epigenetic tumors

Autorzy: Chetan C. Rawal, Vincent Loubiere, Nadejda L. Butova, Juliette Gracia, Victoria Parreno, Chiara Merigliano, Anne-Marie Martinez, Giacomo Cavalli, Irene Chiolo
Opublikowane w: Histochemistry and Cell Biology, Numer 162, 2024, Strona(/y) 133-147, ISSN 0948-6143
Wydawca: Springer Verlag
DOI: 10.1007/s00418-024-02302-z

Principles of genome folding into topologically associating domains

Autorzy: Quentin Szabo, Frédéric Bantignies, Giacomo Cavalli
Opublikowane w: Science Advances, Numer 5/4, 2019, Strona(/y) eaaw1668, ISSN 2375-2548
Wydawca: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/sciadv.aaw1668

Repression and 3D-restructuring resolves regulatory conflicts in evolutionarily rearranged genomes

Autorzy: Alessa R. Ringel, Quentin Szabo, Andrea M. Chiariello, Konrad Chudzik, Robert Schöpflin, Patricia Rothe, Alexandra L. Mattei, Tobias Zehnder, Dermot Harnett, Verena Laupert, Simona Bianco, Sara Hetzel, Juliane Glaser, Mai H.Q. Phan, Magdalena Schindler, Daniel M. Ibrahim, Christina Paliou, Andrea Esposito, Cesar A. Prada-Medina, Stefan A. Haas, Peter Giere, Martin Vingron, Lars Wittler, Alexander
Opublikowane w: Cell, Numer 185, 2022, Strona(/y) 3689-3704.e21, ISSN 0092-8674
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2022.09.006

Transient loss of Polycomb components induces an epigenetic cancer fate

Autorzy: V. Parreno, V. Loubiere, B. Schuettengruber, L. Fritsch, C. C. Rawal, M. Erokhin, B. Győrffy, D. Normanno, M. Di Stefano, J. Moreaux, N. L. Butova, I. Chiolo, D. Chetverina, A.-M. Martinez, G. Cavalli
Opublikowane w: Nature, Numer 629, 2024, Strona(/y) 688-696, ISSN 0028-0836
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-024-07328-w

HiCmapTools: a tool to access HiC contact maps

Autorzy: Jia-Ming Chang, Yi-Fu Weng, Wei-Ting Chang, Fu-An Lin, Giacomo Cavalli
Opublikowane w: BMC Bioinformatics, Numer 23, 2022, ISSN 1471-2105
Wydawca: BioMed Central
DOI: 10.1186/s12859-022-04589-y

Interchromosomal contacts between regulatory regions trigger stable transgenerational epigenetic inheritance in Drosophila

Autorzy: Maximilian H. Fitz-James, Gonzalo Sabarís, Peter Sarkies, Frédéric Bantignies, Giacomo Cavalli
Opublikowane w: Molecular Cell, Numer 85, 2025, Strona(/y) 677-691.e6, ISSN 1097-2765
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2024.11.021

A mechanistic basis for genetic assimilation in natural fly populations

Autorzy: Gonzalo Sabarís, Bernd Schuettengruber, Giorgio L. Papadopoulos, Marta Coronado-Zamora, Maximilian H. Fitz-James, Josefa González, Giacomo Cavalli
Opublikowane w: Proceedings of the National Academy of Sciences, Numer 122, 2025, ISSN 0027-8424
Wydawca: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.2415982122

Widespread activation of developmental gene expression characterized by PRC1-dependent chromatin looping

Autorzy: V. Loubiere, G. L. Papadopoulos, Q. Szabo, A-M. Martinez, G. Cavalli
Opublikowane w: Science Advances, Numer 6/2, 2020, Strona(/y) eaax4001, ISSN 2375-2548
Wydawca: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/sciadv.aax4001

Advances in epigenetics link genetics to the environment and disease

Autorzy: Giacomo Cavalli, Edith Heard
Opublikowane w: Nature, Numer 571/7766, 2019, Strona(/y) 489-499, ISSN 0028-0836
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-019-1411-0

4D Genome Rewiring during Oncogene-Induced and Replicative Senescence

Autorzy: Satish Sati, Boyan Bonev, Quentin Szabo, Daniel Jost, Paul Bensadoun, Francois Serra, Vincent Loubiere, Giorgio Lucio Papadopoulos, Juan-Carlos Rivera-Mulia, Lauriane Fritsch, Pauline Bouret, David Castillo, Josep Ll. Gelpi, Modesto Orozco, Cedric Vaillant, Franck Pellestor, Frederic Bantignies, Marc A. Marti-Renom, David M. Gilbert, Jean-Marc Lemaitre, Giacomo Cavalli
Opublikowane w: Molecular Cell, Numer 78/3, 2020, Strona(/y) 522-538.e9, ISSN 1097-2765
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2020.03.007

Regulation of single-cell genome organization into TADs and chromatin nanodomains

Autorzy: Quentin Szabo, Axelle Donjon, Ivana Jerković, Giorgio L. Papadopoulos, Thierry Cheutin, Boyan Bonev, Elphège P. Nora, Benoit G. Bruneau, Frédéric Bantignies, Giacomo Cavalli
Opublikowane w: Nature Genetics, Numer 52/11, 2020, Strona(/y) 1151-1157, ISSN 1061-4036
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41588-020-00716-8

Understanding 3D genome organization by multidisciplinary methods

Autorzy: Ivana Jerkovic´, Giacomo Cavalli
Opublikowane w: Nature Reviews Molecular Cell Biology, 2021, ISSN 1471-0072
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41580-021-00362-w

Mechanisms of Polycomb group protein function in cancer

Autorzy: Victoria Parreno, Anne-Marie Martinez, Giacomo Cavalli
Opublikowane w: Cell Research, Numer 32, 2022, Strona(/y) 231-253, ISSN 1001-0602
Wydawca: Kexue Chubaneshe/Science Press
DOI: 10.1038/s41422-021-00606-6