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CORDIS - Forschungsergebnisse der EU
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Chromatin organization PROfiling with high-throughput super-resolution microscopy on a CHIP

CORDIS bietet Links zu öffentlichen Ergebnissen und Veröffentlichungen von HORIZONT-Projekten.

Links zu Ergebnissen und Veröffentlichungen von RP7-Projekten sowie Links zu einigen Typen spezifischer Ergebnisse wie Datensätzen und Software werden dynamisch von OpenAIRE abgerufen.

Leistungen

Data management plan (öffnet in neuem Fenster)

Data management plan. Determination of research data accessible to the public

Kick-off meeting organization (öffnet in neuem Fenster)

Organization of project kick-off meeting to nominate the steering committee organize the WPs activity

LSF image simulator (öffnet in neuem Fenster)

LSF image simulator: realistic LSF datasets.

Third year annual meeting organization (öffnet in neuem Fenster)

Organization of annual meeting with project partners steering and mentoring committee

Software for phenotype profiling (öffnet in neuem Fenster)

Software suite dedicated to phenotype profiling

First Year annual meeting organization (öffnet in neuem Fenster)

Organization of project annual meeting with steering and mentoring committee to monitor the progress of the WPs activity

Real-time demodulation software of structured light (öffnet in neuem Fenster)

Demodulation software real time demodulation of structured light

Second year annual meeting organization (öffnet in neuem Fenster)

Organization of annual meeting with project partners steering and mentoring committee

Dissemination and exploitation plan (öffnet in neuem Fenster)

Report on the possible dissemination and exploitation of results.

High throughput imaging (öffnet in neuem Fenster)

Validation of imaging in a fluidic channel at high throughput

Phase shifter performance assesmet (öffnet in neuem Fenster)

Characterization of the phase shifter integrated on chip Maximum frequency will be retrieved

Updated dissemination and exploitation plan (öffnet in neuem Fenster)

Update of the plan containing actions for dissemination and exploitation of results on the basis of the project development

Benchmarking virtual instrumentation (öffnet in neuem Fenster)

Benchmarking virtual instrumentation select suitable microscopic setups

Cancer cell high throughput imaging (öffnet in neuem Fenster)

Retrieving high quality imaging of thousands of cancer cellssample

Optimal imaging settings for SIM (öffnet in neuem Fenster)

Optimal imaging settings for SIM and superresolution SIM characterization of image quality obtained by using structured light at different frequencies phases and angles

Web Page and Logo (öffnet in neuem Fenster)

Web Page. Design and make accessible a web page for external and internal access. Project Logo designed. Available at Month 2 and constantly updated during the project.

Veröffentlichungen

GPU-accelerated real-time reconstruction in Python of three-dimensional datasets from structured illumination microscopy with hexagonal patterns (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Hai Gong, Wenjun Guo and Mark A. A. Neil
Veröffentlicht in: Philosophical Transactions of the Royal Society A: Mathematical, Physical and Engineering Sciences, 2021, ISSN 1364-503X
Herausgeber: Royal Society of London
DOI: 10.1098/rsta.2020.0162

Detecting differences of fluorescent markers distribution in single cell microscopy: textural or pointillist feature space? (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Ali Ahmad, Carole Frindel and David Rousseau
Veröffentlicht in: Frontiers in Robotics and AI, 2020, ISSN 2296-9144
Herausgeber: Frontiers
DOI: 10.3389/frobt.2020.00039

Laser-Assisted Etching of EagleXG Glass by Irradiation at Low Pulse-Repetition Rate (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Roberto Memeo, Mattia Bertaso, Roberto Osellame, Francesca Bragheri and Andrea Crespi
Veröffentlicht in: APPLIED SCIENCES, 2022, ISSN 2076-3417
Herausgeber: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/app12030948

Strategies for improved temporal response of glass-based optical switches (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Calvarese, Matteo; Paiè, Petra; Ceccarelli, Francesco; Sala, Federico; Bassi, Andrea; Osellame, Roberto; Bragheri, Francesca
Veröffentlicht in: Scientific Reports, Vol 12, Iss 1, Pp 1-9 (2022), Ausgabe 2, 2022, ISSN 2045-2322
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-021-04218-3

Effects of Thermal Annealing on Femtosecond Laser Micromachined Glass Surfaces (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Federico Sala, Petra Paié, Rebeca Martínez Vázquez, Roberto Osellame and Francesca Bragheri
Veröffentlicht in: Micromachines, 2021, ISSN 2072-666X
Herausgeber: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/mi12020180

MicroVIP: Microscopy image simulation on the Virtual Imaging Platform (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Ali Ahmad; Ali Ahmad; Guillaume Vanel; Sorina Camarasu-Pop; Axel Bonnet; Carole Frindel; David Rousseau
Veröffentlicht in: SoftwareX, Vol 16, Ausgabe 1, 2021, Seite(n) 100854, ISSN 0950-5849
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.softx.2021.100854

Femtosecond-laser-written optofluidics in alumino-borosilicate glass (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Andrea Crespi, Roberto Osellame, Francesca Bragheri
Veröffentlicht in: Optical Materials: X, Ausgabe 4, 2019, Seite(n) 100042, ISSN 2590-1478
Herausgeber: Elsevier
DOI: 10.1016/j.omx.2019.100042

Automatic imaging of Drosophila embryos with light sheet fluorescence microscopy on chip (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Roberto Memeo, Petra Paiè, Federico Sala, Michele Castriotta, Chiara Guercio, Thomas Vaccari, Roberto Osellame, Andrea Bassi and Francesca Bragheri
Veröffentlicht in: Journal of Biophotonics, 2020, ISSN 1864-063X
Herausgeber: Wiley - VCH Verlag GmbH & CO. KGaA
DOI: 10.1002/jbio.202000396

Improving axial resolution in SIM using deep learning (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Boland, Miguel; Cohen, Edward A. K.; Flaxman, Seth; Neil, Mark A. A.
Veröffentlicht in: Philosophical Transactions of the Royal Society A: Mathematical, Physical and Engineering Sciences, Ausgabe 4, 2021, ISSN 1364-503X
Herausgeber: Royal Society of London
DOI: 10.1098/rsta.2020.0298

High-throughput 3D imaging of single cells with light-sheet fluorescence microscopy on chip (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Sala, Federico; Castriotta, Michele; Paiè, Petra; Farina, Andrea; D’Annunzio, Sarah; Zippo, Alessio; Osellame, Roberto; Bragheri, Francesca; Bassi, Andrea
Veröffentlicht in: Biomed Opt Express, Ausgabe 5, 2020, ISSN 2156-7085
Herausgeber: The Optical Society
DOI: 10.1364/boe.393892

Editorial for the Special Issue on New Trends and Applications in Femtosecond Laser Micromachining (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Francesca Bragheri, Petra Paiè, Rebeca Martinez Vázquez
Veröffentlicht in: Micromachines, 2022, ISSN 2072-666X
Herausgeber: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/mi13020150

Optofluidic lab-on-chips for high throughput 3D imaging of cells and tissues (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Federico Sala, Petra Paiè, Roberto Memeo, Roberto Osellame, Andrea Farina, Andrea Bassi, Francesca Bragheri
Veröffentlicht in: EPJ Web of Conferences, Ausgabe 215, 2019, Seite(n) 11002, ISSN 2100-014X
Herausgeber: EDP Sciences
DOI: 10.1051/epjconf/201921511002

Deep learning based detection of cells in 3D light sheet fluorescence microscopy

Autoren: Ali Ahmad, Carole Frindel, Pejman Rasti, David Sarrut, David Rousseau
Veröffentlicht in: Quantitative BioImaging Conference, 2019
Herausgeber: None

Détection de différence de densité de marqueurs fluorescents en microscopie superrésolue : approche pointilliste ou texturale ?

Autoren: Ali Ahmad, Carole Frindel, David Rousseau
Veröffentlicht in: 2019
Herausgeber: GRETSI, Groupe d’Etudes du Traitement du Signal et des Images

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