Excel in Rare Diseases’ Research: Focus on LYSOsomal Disorders and CILiopathies

Leistungen

D7.8 - LYSOCIL Final conference

Final conference at UNLNMSCEDOC ll the participants and steakholders related to RDs

D7.3 - Communication and promotional materials I

Informative brochures, presentations and movies on RDs

D7.2 - Project website launch and Visual Identity Guide

Creation of our Website with information on RDs and our visual logotype.

D7.6 - e-LYSOCIL RDs Research HUB launch

Website where partners can communicate, share and deposit research outputs for the general public.

D7.4 - Communication and promotional materials II

Informative brochures presentations and movies on RDs

D7.5 - Communication and promotional materials III

Informative brochures presentations and movies on RDs

Veröffentlichungen

SymmetryBreaking Cilia-Driven Flow in Embryogenesis

Autoren: David J. Smith, Thomas D. Montenegro-Johnson, Susana S. Lopes
Veröffentlicht in: Annual Review of Fluid Mechanics, 2018, ISSN 0066-4189
Herausgeber: Annual Reviews, Inc.
DOI: 10.1146/annurev-fluid-010518-040231

Pkd2 affects cilia length and impacts left-right flow dynamics and dand5 (project related publication after the start date of LYSOCIL project, RP2)

Autoren: Raquel Jacinto, Pedro Sampaio, Mónica Roxo-Rosa, Sara Pestana, Susana S Lopes
Veröffentlicht in: Front Cell Dev Biol, 2021, ISSN 2296-634X
Herausgeber: Frontiers Media S.A.
DOI: 10.3389/fcell.2021.624531

Zebrafish motile cilia as a model for Primary Ciliary Dyskinesia (project related publication after the start date of LYSOCIL project, RP2)

Autoren: Andreia L Pinto, Margarida Rasteiro, Catarina Bota, Sara Pestana, Pedro Sampaio, Claire Hogg, Thomas Burgoyne, Susana S Lopes
Veröffentlicht in: Int J Mol Sci, Ausgabe 22/16, 2021, ISSN 1661-6596
Herausgeber: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/ijms22168361

Rab35 controls cilium length, function and membrane composition (project related publication after the start date of LYSOCIL project, RP1)

Autoren: Stefanie Kuhns, Cecília Seixas, Sara Pestana, Bárbara Tavares, Renata Nogueira, Raquel Jacinto, José S Ramalho, Jeremy C Simpson, Jens S Andersen, Arnaud Echard, Susana S Lopes, Duarte C Barral, Oliver E Blacque
Veröffentlicht in: EMBO reports, Ausgabe 20/10, 2019, ISSN 1469-221X
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.15252/embr.201847625

Rab11 is required for lysosome exocytosis through the interaction with Rab3a, Sec15 and GRAB (project related publication after the start date of LYSOCIL project, RP2)

Autoren: Cristina Escrevente, Liliana Bento-Lopes, José S Ramalho, Duarte C Barral
Veröffentlicht in: J Cell Sci, Ausgabe 134/11, 2021, ISSN 0021-9533
Herausgeber: The Company of Biologists Ltd.
DOI: 10.1242/jcs.246694

Formation of lipofuscin-like autofluorescent granules in the retinal pigment epithelium requires lysosome dysfunction (project related publication after the start date of LYSOCIL project, RP2)

Autoren: Cristina Escrevente, Ana S Falcão, Michael J Hall, Mafalda Lopes-da-Silva, Pedro Antas, Miguel M Mesquita, Inês S Ferreira, M Helena Cardoso, Daniela Oliveira, Ana C Fradinho, Thomas Ciossek, Paul Nicklin, Clare E Futter, Sandra Tenreiro, Miguel C Seabra
Veröffentlicht in: Invest Ophthalmol Vis Sci, Ausgabe 62/9, 2021, ISSN 0146-0404
Herausgeber: Association for Research in Vision and Ophthalmology
DOI: 10.1167/iovs.62.9.39

Melanocore uptake by keratinocytes occurs through phagocytosis and involves protease-activated receptor-2 internalization (project related publication after the start date of LYSOCIL project, RP2)

Autoren: Hugo Moreiras ,Liliana Bento-Lopes, Matilde V. Neto, Cristina Escrevente, Luís C. Cabaço, Michael J. Hall, José S. Ramalho, Miguel C. Seabra, Duarte C. Barral
Veröffentlicht in: Traffic, Ausgabe 6, 2022, ISSN 1398-9219
Herausgeber: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/tra.12843

Current methods to analyze lysosome morphology, positioning, motility and function (project related publication after the start date of LYSOCIL project, RP2)

Autoren: Duarte C Barral, Leopoldo Staiano, Cláudia Guimas Almeida, Dan F Cutler, Emily R Eden, Clare E Futter, Antony Galione, André R A Marques, Diego Luis Medina, Gennaro Napolitano, Carmine Settembre, Otília V Vieira, Johannes M F G Aerts, Peace Atakpa-Adaji, Gemma Bruno, Antonella Capuozzo, Elvira De Leonibus, Chiara Di Malta, Cristina Escrevente, Alessandra Esposito, Paolo Grumati, Michael J Hall,
Veröffentlicht in: Traffic, Ausgabe 5, 2022, ISSN 1398-9219
Herausgeber: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/tra.12839

Zebrafish model as a screen to prevent cyst inflation in Autosomal Dominant Polycystic Kidney Disease (project related publication after the start date of LYSOCIL project, RP2)

Autoren: Inês Oliveira, Raquel Jacinto, Sara Pestana, Fernando Nolasco, Joaquim Calado, Susana Santos Lopes, Mónica Roxo-Rosa
Veröffentlicht in: Int J Mol Sci, Ausgabe 22/16, 2021, ISSN 1661-6596
Herausgeber: MDPI
DOI: 10.3390/ijms22169013

Carbon monoxide and mitochondria – modulation of cell metabolism, redox response and cell death

Autoren: Ana S. Almeida, Cláudia Figueiredo-Pereira, Helena L. A. Vieira
Veröffentlicht in: Frontiers in Physiology, Ausgabe 6, 2015, ISSN 1664-042X
Herausgeber: Frontiers Research Foundation

Carbon monoxide and the CNS: challenges and achievements

Autoren: Cláudia S F Queiroga, Alessandro Vercelli, Helena L A Vieira
Veröffentlicht in: British Journal of Pharmacology, Ausgabe 172/6, 2015, Seite(n) 1533-1545, ISSN 0007-1188
Herausgeber: Wiley-Blackwell
DOI: 10.1111/bph.12729

New method to assess mitophagy flux by flow cytometry

Autoren: Marta Mauro-Lizcano, Lorena Esteban-Martínez, Esther Seco, Ana Serrano-Puebla, Lucia Garcia-Ledo, Cláudia Figueiredo-Pereira, Helena L A Vieira, Patricia Boya
Veröffentlicht in: Autophagy, Ausgabe 11/5, 2015, Seite(n) 833-843, ISSN 1554-8627
Herausgeber: Landes Bioscience
DOI: 10.1080/15548627.2015.1034403

Rod disc renewal occurs by evagination of the ciliary plasma membrane that makes cadherin-based contacts with the inner segment

Autoren: Thomas Burgoyne, Ingrid P. Meschede, Jemima J. Burden, Maryse Bailly, Miguel C. Seabra, Clare E. Futter
Veröffentlicht in: Proceedings of the National Academy of Sciences, Ausgabe 112/52, 2015, Seite(n) 15922-15927, ISSN 0027-8424
Herausgeber: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.1509285113

Effect of carbon monoxide on gene expression in cerebrocortical astrocytes: Validation of reference genes for quantitative real-time PCR

Autoren: Sara R. Oliveira, Helena L.A. Vieira, Carlos B. Duarte
Veröffentlicht in: Nitric Oxide, Ausgabe 49, 2015, Seite(n) 80-89, ISSN 1089-8603
Herausgeber: Academic Press
DOI: 10.1016/j.niox.2015.07.003

Mitochondria and carbon monoxide: cytoprotection and control of cell metabolism - a role for Ca2+?

Autoren: Sara R. Oliveira, Cláudia S. F. Queiroga, Helena L. A. Vieira
Veröffentlicht in: The Journal of Physiology, 2015, ISSN 0022-3751
Herausgeber: Blackwell Publishing Inc.

Host cell autophagy contributes to Plasmodium liver development

Autoren: Carolina Thieleke‐Matos, Mafalda Lopes da Silva, Laura Cabrita‐Santos, Martim D. Portal, Inês P. Rodrigues, Vanessa Zuzarte‐Luis, José S. Ramalho, Clare E. Futter, Maria M. Mota, Duarte C. Barral, Miguel C. Seabra
Veröffentlicht in: Cellular Microbiology, 2015, ISSN 1462-5814
Herausgeber: Blackwell Publishing Inc.

Photoreceptor phagosome processing defects and disturbed autophagy in retinal pigment epithelium of Cln3Δex1-6 mice modelling juvenile neuronal ceroid lipofuscinosis (Batten disease).

Autoren: Silène T. Wavre-Shapton, Alessandra A. Calvi, Mark Turmaine, Miguel C. Seabra, Daniel F. Cutler, Clare E. Futter, Hannah M. Mitchison
Veröffentlicht in: Human Molecular Genetics, 2015, ISSN 0964-6906
Herausgeber: Oxford University Press

Rab27a GTPase modulates L-type Ca(2+) channel function via interaction with the II-III linker of CaV1.3 subunit.

Autoren: Nadine Reichhart, Magdalena Markowski, Shimpei Ishiyama, Andrea Wagner, Sergio Crespo-Garcia, Talitha Schorb, José S. Ramalho, Vladimir M. Milenkovic, Renate Föckler, Miguel C. Seabra, Olaf Strauß
Veröffentlicht in: Cellular Signalling, 2015, ISSN 0898-6568
Herausgeber: Elsevier BV

Exosome-delivered microRNAs modulate the inflammatory response to endotoxin

Autoren: Margaret Alexander, Ruozhen Hu, Marah C. Runtsch, Dominique A. Kagele, Timothy L. Mosbruger, Tanya Tolmachova, Miguel C. Seabra, June L. Round, Diane M. Ward, Ryan M. O’Connell
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 6/1, 2015, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/ncomms8321

Impact of the serum- and glucocorticoid-inducible kinase 1 on platelet dense granule biogenesis and secretion

Autoren: B. Walker, E. Schmid, A. Russo, E.-M. Schmidt, O. Burk, P. Münzer, A. Velic, B. Macek, M. Schaller, M. Schwab, M. C. Seabra, M. Gawaz, F. Lang, O. Borst
Veröffentlicht in: Journal of Thrombosis and Haemostasis, Ausgabe 13/7, 2015, Seite(n) 1325-1334, ISSN 1538-7933
Herausgeber: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/jth.12998

Regulation of melanosome number, shape and movement in the zebrafish retinal pigment epithelium by OA1 and PMEL

Autoren: T. Burgoyne, M. N. O'Connor, M. C. Seabra, D. F. Cutler, C. E. Futter
Veröffentlicht in: Journal of Cell Science, Ausgabe 128/7, 2015, Seite(n) 1400-1407, ISSN 0021-9533
Herausgeber: The Company of Biologists Ltd.
DOI: 10.1242/jcs.164400

Overexpression of BDNF and Full-Length TrkB Receptor Ameliorate Striatal Neural Survival in Huntington's Disease

Autoren: Ana Silva, Luana Naia, Alejandro Dominguez, Márcio Ribeiro, Joana Rodrigues, Otília V. Vieira, Volkmar Lessmann, Ana Cristina Rego
Veröffentlicht in: Neurodegenerative Diseases, Ausgabe 15/4, 2015, Seite(n) 207-218, ISSN 1660-2854
Herausgeber: S. Karger AG
DOI: 10.1159/000375447

Ischaemia-induced autophagy leads to degradation of gap junction protein connexin43 in cardiomyocytes

Autoren: Tania Martins-Marques, Steve Catarino, Monica Zuzarte, Carla Marques, Paulo Matafome, Paulo Pereira, Henrique Girão
Veröffentlicht in: Biochemical Journal, Ausgabe 467/2, 2015, Seite(n) 231-245, ISSN 0264-6021
Herausgeber: Portland Press, Ltd.
DOI: 10.1042/BJ20141370

K63 linked ubiquitin chain formation is a signal for HIF1A degradation by Chaperone-Mediated Autophagy

Autoren: Joao Vasco Ferreira, Ana Rosa Soares, Jose Silva Ramalho, Paulo Pereira, Henrique Girao
Veröffentlicht in: Scientific Reports, Ausgabe 5/1, 2015, ISSN 2045-2322
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/srep10210

Gap junctional protein Cx43 is involved in the communication between extracellular vesicles and mammalian cells

Autoren: Ana Rosa Soares, Tania Martins-Marques, Teresa Ribeiro-Rodrigues, Joao Vasco Ferreira, Steve Catarino, Maria João Pinho, Monica Zuzarte, Sandra Isabel Anjo, Bruno Manadas, Joost P.G. Sluijter, Paulo Pereira, Henrique Girao
Veröffentlicht in: Scientific Reports, Ausgabe 5/1, 2015, ISSN 2045-2322
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/srep13243

Interacting Network of the Gap Junction (GJ) Protein Connexin43 (Cx43) is Modulated by Ischemia and Reperfusion in the Heart

Autoren: Tania Martins-Marques, Sandra Isabel Anjo, Paulo Pereira, Bruno Manadas, Henrique Girão
Veröffentlicht in: Molecular & Cellular Proteomics, Ausgabe 14/11, 2015, Seite(n) 3040-3055, ISSN 1535-9476
Herausgeber: American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI: 10.1074/mcp.M115.052894

Heart ischemia results in connexin43 ubiquitination localized at the intercalated discs

Autoren: Tânia Martins-Marques, Steve Catarino, Carla Marques, Paulo Matafome, Teresa Ribeiro-Rodrigues, Rui Baptista, Paulo Pereira, Henrique Girão
Veröffentlicht in: Biochimie, Ausgabe 112, 2015, Seite(n) 196-201, ISSN 0300-9084
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.biochi.2015.02.020

Connexin 43 ubiquitination determines the fate of gap junctions: restrict to survive

Autoren: Teresa M. Ribeiro-Rodrigues, Steve Catarino, Maria J. Pinho, Paulo Pereira, Henrique Girao
Veröffentlicht in: Biochemical Society transactions, 2015, ISSN 0300-5127
Herausgeber: Portland Press, Ltd.

To beat or not to beat: degradation of Cx43 imposes the heart rhythm

Autoren: Tânia Martins-Marques, Steve Catarino, Carla Marques, Paulo Pereira, Henrique Girão
Veröffentlicht in: Biochemical Society transactions, 2015, ISSN 0300-5127
Herausgeber: Portland Press, Ltd.

Autophagy and Ubiquitination in Cardiovascular Diseases

Autoren: Tania Martins-Marques, Teresa Ribeiro-Rodrigues, Paulo Pereira, Patrice Codogno, Henrique Girao
Veröffentlicht in: DNA and Cell Biology, Ausgabe 34/4, 2015, Seite(n) 243-251, ISSN 1044-5498
Herausgeber: Mary Ann Liebert Inc.
DOI: 10.1089/dna.2014.2765

The zebrafish Kupffer's vesicle as a model system for the molecular mechanisms by which the lack of Polycystin-2 leads to stimulation of CFTR

Autoren: M. Roxo-Rosa, R. Jacinto, P. Sampaio, S. S. Lopes
Veröffentlicht in: Biology Open, Ausgabe 4/11, 2015, Seite(n) 1356-1366, ISSN 2046-6390
Herausgeber: Company of Biologists Ltd
DOI: 10.1242/bio.014076

Early steps in primary cilium assembly require EHD1/EHD3-dependent ciliary vesicle formation

Autoren: Quanlong Lu, Christine Insinna, Carolyn Ott, Jimmy Stauffer, Petra A. Pintado, Juliati Rahajeng, Ulrich Baxa, Vijay Walia, Adrian Cuenca, Yoo-Seok Hwang, Ira O. Daar, Susana Lopes, Jennifer Lippincott-Schwartz, Peter K. Jackson, Steve Caplan, Christopher J. Westlake
Veröffentlicht in: Nature Cell Biology, Ausgabe 17/3, 2015, Seite(n) 228-240, ISSN 1465-7392
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/ncb3109

Guidelines for the use and interpretation of assays for monitoring autophagy (3rd edition)

Autoren: Daniel J Klionsky, Kotb Abdelmohsen, Akihisa Abe, Md Joynal Abedin, Hagai Abeliovich, Abraham Acevedo Arozena, Hiroaki Adachi, Christopher M Adams, Peter D Adams, Khosrow Adeli, Peter J Adhihetty, Sharon G Adler, Galila Agam, Rajesh Agarwal, Manish K Aghi, Maria Agnello, Patrizia Agostinis, Patricia V Aguilar, Julio Aguirre-Ghiso, Edoardo M Airoldi, Slimane Ait-Si-Ali, Takahiko Akematsu, Emmanuel
Veröffentlicht in: Autophagy, Ausgabe 12/1, 2016, Seite(n) 1-222, ISSN 1554-8627
Herausgeber: Landes Bioscience
DOI: 10.1080/15548627.2015.1100356

Hippocampal neurogenesis response: What can we expect from two different models of hypertension?

Autoren: Daniela Pedroso, Ana R. Nunes, Lucília N. Diogo, Carole Oudot, Emília C. Monteiro, Catherine Brenner, Helena L.A. Vieira
Veröffentlicht in: Brain Research, Ausgabe 1646, 2016, Seite(n) 199-206, ISSN 0006-8993
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.brainres.2016.05.044

Carbon monoxide improves neuronal differentiation and yield by increasing the functioning and number of mitochondria

Autoren: Ana S. Almeida, Ursula Sonnewald, Paula M. Alves, Helena L.A. Vieira
Veröffentlicht in: Journal of Neurochemistry, Ausgabe 138/3, 2016, Seite(n) 423-435, ISSN 0022-3042
Herausgeber: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/jnc.13653

Carbon Monoxide Releasing Molecule-A1 (CORM-A1) Improves Neurogenesis: Increase of Neuronal Differentiation Yield by Preventing Cell Death

Autoren: Ana S. Almeida, Nuno L. Soares, Melissa Vieira, Jan Bert Gramsbergen, Helena L. A. Vieira
Veröffentlicht in: PLOS ONE, Ausgabe 11/5, 2016, Seite(n) e0154781, ISSN 1932-6203
Herausgeber: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pone.0154781

Arl13b and the exocyst interact synergistically in ciliogenesis

Autoren: Cecília Seixas, Soo Young Choi, Noemi Polgar, Nicole L. Umberger, Michael P. East, Xiaofeng Zuo, Hugo Moreiras, Rania Ghossoub, Alexandre Benmerah, Richard A. Kahn, Ben Fogelgren, Tamara Caspary, Joshua H. Lipschutz, Duarte C. Barral
Veröffentlicht in: Molecular Biology of the Cell, Ausgabe 27/2, 2016, Seite(n) 308-320, ISSN 1059-1524
Herausgeber: American Society for Cell Biology
DOI: 10.1091/mbc.E15-02-0061

shRNA-Based Screen Identifies Endocytic Recycling Pathway Components That Act as Genetic Modifiers of Alpha-Synuclein Aggregation, Secretion and Toxicity

Autoren: Susana A. Gonçalves, Diana Macedo, Helena Raquel, Pedro D. Simões, Flaviano Giorgini, José S. Ramalho, Duarte C. Barral, Luís Ferreira Moita, Tiago Fleming Outeiro
Veröffentlicht in: PLOS Genetics, Ausgabe 12/4, 2016, Seite(n) e1005995, ISSN 1553-7390
Herausgeber: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pgen.1005995

A Rab3a-dependent complex essential for lysosome positioning and plasma membrane repair

Autoren: Marisa Encarnação, Lília Espada, Cristina Escrevente, Denisa Mateus, José Ramalho, Xavier Michelet, Inês Santarino, Victor W. Hsu, Michael B. Brenner, Duarte C. Barral, Otília V. Vieira
Veröffentlicht in: The Journal of Cell Biology, Ausgabe 213/6, 2016, Seite(n) 631-640, ISSN 0021-9525
Herausgeber: Rockefeller University Press
DOI: 10.1083/jcb.201511093

Arf proteins in cancer cell migration

Autoren: Cristina Casalou, Alexandra Faustino, Duarte C. Barral
Veröffentlicht in: Small GTPases, Ausgabe 7/4, 2016, Seite(n) 270-282, ISSN 2154-1248
Herausgeber: Landes Bioscience
DOI: 10.1080/21541248.2016.1228792

Visual Acuity after Retinal Gene Therapy for Choroideremia

Autoren: Thomas L. Edwards, Jasleen K. Jolly, Markus Groppe, Alun R. Barnard, Charles L. Cottriall, Tanya Tolmachova, Graeme C. Black, Andrew R. Webster, Andrew J. Lotery, Graham E. Holder, Kanmin Xue, Susan M. Downes, Matthew P. Simunovic, Miguel C. Seabra, Robert E. MacLaren
Veröffentlicht in: New England Journal of Medicine, Ausgabe 374/20, 2016, Seite(n) 1996-1998, ISSN 0028-4793
Herausgeber: Massachusetts Medical Society
DOI: 10.1056/NEJMc1509501

Sequential and compartmentalized action of Rabs, SNAREs, and MAL in the apical delivery of fusiform vesicles in urothelial umbrella cells

Autoren: Bret Wankel, Jiangyong Ouyang, Xuemei Guo, Krassimira Hadjiolova, Jeremy Miller, Yi Liao, Daniel Kai Long Tham, Rok Romih, Leonardo R. Andrade, Iwona Gumper, Jean-Pierre Simon, Rakhee Sachdeva, Tanya Tolmachova, Miguel C. Seabra, Mitsunori Fukuda, Nicole Schaeren-Wiemers, Wan Jin Hong, David D. Sabatini, Xue-Ru Wu, Xiangpeng Kong, Gert Kreibich, Michael J. Rindler, Tung-Tien Sun
Veröffentlicht in: Molecular Biology of the Cell, Ausgabe 27/10, 2016, Seite(n) 1621-1634, ISSN 1059-1524
Herausgeber: American Society for Cell Biology
DOI: 10.1091/mbc.E15-04-0230

In vitro activity of quaternary ammonium surfactants against streptococcal, chlamydial, and gonococcal infective agents

Autoren: Ângela S. Inácio, Alexandra Nunes, Catarina Milho, Luís Jaime Mota, Maria J. Borrego, João P. Gomes, Winchil L. C. Vaz, Otília V. Vieira
Veröffentlicht in: Antimicrobial agents and chemotherapy, 2016, ISSN 0066-4804
Herausgeber: American Society for Microbiology

Quaternary ammonium surfactant structure determines selective toxicity towards bacteria: mechanisms of action and clinical implications in antibacterial prophylaxis

Autoren: Ângela S. Inácio, Neuza S. Domingues, Alexandra Nunes, Patrícia T. Martins, Maria J. Moreno, Luís M. Estronca, Rui Fernandes, António J. M. Moreno, Maria J. Borrego, João P. Gomes, Winchil L. C. Vaz, Otília V. Vieira
Veröffentlicht in: Journal of Antimicrobial Chemotherapy, Ausgabe 71/3, 2016, Seite(n) 641-654, ISSN 0305-7453
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/jac/dkv405

Presence of Cx43 in extracellular vesicles reduces the cardiotoxicity of the anti-tumour therapeutic approach with doxorubicin

Autoren: Tania Martins-Marques, Maria Joao Pinho, Monica Zuzarte, Carla Oliveira, Paulo Pereira, Joost P. G. Sluijter, Celia Gomes, Henrique Girao
Veröffentlicht in: Journal of Extracellular Vesicles, Ausgabe 5/1, 2016, Seite(n) 32538, ISSN 2001-3078
Herausgeber: Taylor & Francis
DOI: 10.3402/jev.v5.32538

Accelerated age-related olfactory decline among type 1 Usher patients

Autoren: João Carlos Ribeiro, Bárbara Oliveiros, Paulo Pereira, Natália António, Thomas Hummel, António Paiva, Eduardo D. Silva
Veröffentlicht in: Scientific Reports, Ausgabe 6/1, 2016, ISSN 2045-2322
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/srep28309

Three-dimensional flow in Kupffer’s Vesicle

Autoren: T. D. Montenegro-Johnson, D. I. Baker, D. J. Smith, S. S. Lopes
Veröffentlicht in: Journal of Mathematical Biology, Ausgabe 73/3, 2016, Seite(n) 705-725, ISSN 0303-6812
Herausgeber: Springer Verlag
DOI: 10.1007/s00285-016-0967-7

Report of the 4th European Zebrafish Principal Investigator Meeting

Autoren: Susana S. Lopes, Martin Distel, Claudia Linker, Rita Fior, Rui Monteiro, Isaac H. Bianco, Ruben Portugues, Uwe Strähle, Leonor Saúde
Veröffentlicht in: Zebrafish, Ausgabe 13/6, 2016, Seite(n) 590-595, ISSN 1545-8547
Herausgeber: Mary Ann Liebert Inc.
DOI: 10.1089/zeb.2016.1364

Role of Cell Metabolism and Mitochondrial Function During Adult Neurogenesis

Autoren: Ana S. Almeida, Helena L. A. Vieira
Veröffentlicht in: Neurochemical Research, Ausgabe 42/6, 2017, Seite(n) 1787-1794, ISSN 0364-3190
Herausgeber: Kluwer Academic/Plenum Publishers
DOI: 10.1007/s11064-016-2150-3

Mitochondrion: a common organelle for distinct cell deaths?

Autoren: Z. Wang, C. Figueiredo-Pereira, C. Oudot, H.L.A. Vieira, C. Brenner
Veröffentlicht in: International review of cell and molecular biology, 2017, ISSN 1937-6448
Herausgeber: Elsevier BV

Carbon monoxide reverses the metabolic adaptation of microglia cells to an inflammatory stimulus

Autoren: Jayne Louise Wilson, Frédéric Bouillaud, Ana S. Almeida, Helena L. Vieira, Mohand Ouidir Ouidja, Jean-Luc Dubois-Randé, Roberta Foresti, Roberto Motterlini
Veröffentlicht in: Free Radical Biology and Medicine, Ausgabe 104, 2017, Seite(n) 311-323, ISSN 0891-5849
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.freeradbiomed.2017.01.022

Commensal-to-pathogen transition: One-single transposon insertion results in two pathoadaptive traits in Escherichia coli -macrophage interaction

Autoren: João T. Proença, Duarte C. Barral, Isabel Gordo
Veröffentlicht in: Scientific Reports, Ausgabe 7/1, 2017, ISSN 2045-2322
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-017-04081-1

Rab27-Dependent Exosome Production Inhibits Chronic Inflammation and Enables Acute Responses to Inflammatory Stimuli

Autoren: Margaret Alexander, Andrew G. Ramstead, Kaylyn M. Bauer, Soh-Hyun Lee, Marah C. Runtsch, Jared Wallace, Thomas B. Huffaker, Dane K. Larsen, Tanya Tolmachova, Miguel C. Seabra, June L. Round, Diane M. Ward, Ryan M. O’Connell
Veröffentlicht in: The Journal of Immunology, Ausgabe 199/10, 2017, Seite(n) 3559-3570, ISSN 0022-1767
Herausgeber: American Association of Immunologists
DOI: 10.4049/jimmunol.1700904

Involvement of the p62/NRF2 signal transduction pathway on erythrophagocytosis

Autoren: Inês B. Santarino, Michelle S. Viegas, Neuza S. Domingues, Ana M. Ribeiro, Miguel P. Soares, Otília V. Vieira
Veröffentlicht in: Scientific Reports, Ausgabe 7/1, 2017, ISSN 2045-2322
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-017-05687-1

Maturation of phagosomes containing different erythrophagocytic particles in primary macrophages

Autoren: Inês B. Santarino, Otília V. Vieira
Veröffentlicht in: FEBS Open Bio, Ausgabe 7/9, 2017, Seite(n) 1281-1290, ISSN 2211-5463
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1002/2211-5463.12262

Cholesteryl hemiesters alter lysosome structure and function and induce proinflammatory cytokine production in macrophages

Autoren: Neuza Domingues, Luís M.B.B. Estronca, João Silva, Marisa R. Encarnação, Rita Mateus, Diogo Silva, Inês B. Santarino, Margarida Saraiva, Maria I.L. Soares, Teresa M.V.D. Pinho e Melo, António Jacinto, Winchil L.C. Vaz, Otília V. Vieira
Veröffentlicht in: Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular and Cell Biology of Lipids, Ausgabe 1862/2, 2017, Seite(n) 210-220, ISSN 1388-1981
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.bbalip.2016.10.009

Exosomes secreted by cardiomyocytes subjected to ischaemia promote cardiac angiogenesis

Autoren: Teresa M. Ribeiro-Rodrigues, Tiago L. Laundos, Rita Pereira-Carvalho, Daniela Batista-Almeida, Ricardo Pereira, Vanessa Coelho-Santos, Ana P. Silva, Rosa Fernandes, Monica Zuzarte, Francisco J. Enguita, Marina C. Costa, Perpetua Pinto-do-Ó, Marta T. Pinto, Pedro Gouveia, Lino Ferreira, Justin C. Mason, Paulo Pereira, Brenda R. Kwak, Diana S. Nascimento, Henrique Girão
Veröffentlicht in: Cardiovascular Research, Ausgabe 113/11, 2017, Seite(n) 1338-1350, ISSN 0008-6363
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1093/cvr/cvx118

Molecular control of chaperone-mediated autophagy

Autoren: Steve Catarino, Paulo Pereira, Henrique Girão
Veröffentlicht in: Essays In Biochemistry, Ausgabe 61/6, 2017, Seite(n) 663-674, ISSN 0071-1365
Herausgeber: Portland Press, Ltd.
DOI: 10.1042/EBC20170057

Hyperglycemia-induced degradation of HIF-1α contributes to impaired response of cardiomyocytes to hypoxia

Autoren: Ana Rita Ramalho, Adriana Toscano, Paulo Pereira, Henrique Girão, Lino Gonçalves, Carla Marques
Veröffentlicht in: Revista Portuguesa de Cardiologia, Ausgabe 36/5, 2017, Seite(n) 367-373, ISSN 0870-2551
Herausgeber: Sociedade Portuguesa De Cardiologia
DOI: 10.1016/j.repc.2016.09.018

Elucidation of the dynamic nature of interactome networks: A practical tutorial

Autoren: Sandra I. Anjo, Tania Martins-Marques, Paulo Pereira, Henrique Girão, Bruno Manadas
Veröffentlicht in: Journal of Proteomics, Ausgabe 171, 2018, Seite(n) 116-126, ISSN 1874-3919
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.jprot.2017.04.011

Bin1 and CD2AP polarise the endocytic generation of beta‐amyloid

Autoren: Florent Ubelmann, Tatiana Burrinha, Laura Salavessa, Ricardo Gomes, Cláudio Ferreira, Nuno Moreno, Cláudia Guimas Almeida
Veröffentlicht in: EMBO reports, Ausgabe 18/1, 2017, Seite(n) 102-122, ISSN 1469-221X
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.15252/embr.201642738

A Novel Protocol to Quantitatively Measure the Endocytic Trafficking of Amyloid Precursor Protein (APP) in Polarized Primary Neurons with Sub-cellular Resolution

Autoren: Florent Ubelmann, Tatiana Burrinha, Cláudia Guimas Almeida
Veröffentlicht in: BIO-PROTOCOL, Ausgabe 7/23, 2017, ISSN 2331-8325
Herausgeber: Bio-protocol LLC
DOI: 10.21769/BioProtoc.2629

Measuring the Endocytic Recycling of Amyloid Precursor Protein (APP) in Neuro2a Cells

Autoren: Florent Ubelmann, Tatiana Burrinha, Cláudia Guimas Almeida
Veröffentlicht in: BIO-PROTOCOL, Ausgabe 7/23, 2017, ISSN 2331-8325
Herausgeber: Bio-protocol LLC
DOI: 10.21769/BioProtoc.2635

Usefulness of zebrafish larvae to evaluate drug-induced functional and morphological renal tubular alterations

Autoren: Rita Gorgulho, Raquel Jacinto, Susana S. Lopes, Sofia A. Pereira, Erin M. Tranfield, Gabriel G. Martins, Emilio J. Gualda, Rico J. E. Derks, Ana C. Correia, Evelyne Steenvoorden, Petra Pintado, Oleg A. Mayboroda, Emilia C. Monteiro, Judit Morello
Veröffentlicht in: Archives of Toxicology, Ausgabe 92/1, 2018, Seite(n) 411-423, ISSN 0340-5761
Herausgeber: Springer Verlag
DOI: 10.1007/s00204-017-2063-1

Notch/Her12 signalling modulates, motile/immotile cilia ratio downstream of Foxj1a in zebrafish left-right organizer

Autoren: Barbara Tavares, Raquel Jacinto, Pedro Sampaio, Sara Pestana, Andreia Pinto, Andreia Vaz, Mónica Roxo-Rosa, Rui Gardner, Telma Lopes, Britta Schilling, Ian Henry, Leonor Saúde, Susana Santos Lopes
Veröffentlicht in: eLife, Ausgabe 6, 2017, ISSN 2050-084X
Herausgeber: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/eLife.25165

Dynamics of cilia length in left–right development

Autoren: P. Pintado, P. Sampaio, B. Tavares, T. D. Montenegro-Johnson, D. J. Smith, S. S. Lopes
Veröffentlicht in: Royal Society Open Science, Ausgabe 4/3, 2017, Seite(n) 161102, ISSN 2054-5703
Herausgeber: Royal Society Publishing
DOI: 10.1098/rsos.161102

Pure Polyphenols Applications for Cardiac Health and Disease

Autoren: Claudia N. Santos, Andreia Gomes, Carole Oudot, Daniela Dias-Pedroso, Ana Rodriguez-Mateos, Helena L.A. Vieira, Catherine Brenner
Veröffentlicht in: Current Pharmaceutical Design, Ausgabe 24/19, 2018, Seite(n) 2137-2156, ISSN 1381-6128
Herausgeber: Bentham Science Publishers
DOI: 10.2174/1381612824666180608102344

Intermittent, low dose carbon monoxide exposure enhances survival and dopaminergic differentiation of human neural stem cells

Autoren: Nanna Dreyer-Andersen, Ana Sofia Almeida, Pia Jensen, Morad Kamand, Justyna Okarmus, Tine Rosenberg, Stig Düring Friis, Alberto Martínez Serrano, Morten Blaabjerg, Bjarne Winther Kristensen, Troels Skrydstrup, Jan Bert Gramsbergen, Helena L. A. Vieira, Morten Meyer
Veröffentlicht in: PLOS ONE, Ausgabe 13/1, 2018, Seite(n) e0191207, ISSN 1932-6203
Herausgeber: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pone.0191207

Improvement of neuronal differentiation by carbon monoxide: Role of pentose phosphate pathway

Autoren: Ana S. Almeida, Nuno L. Soares, Catarina O. Sequeira, Sofia A. Pereira, Ursula Sonnewald, Helena L.A. Vieira
Veröffentlicht in: Redox Biology, Ausgabe 17, 2018, Seite(n) 338-347, ISSN 2213-2317
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.redox.2018.05.004

P2X7 Receptors Mediate CO-Induced Alterations in Gene Expression in Cultured Cortical Astrocytes—Transcriptomic Study

Autoren: Sara R. Oliveira, Cláudia Figueiredo-Pereira, Carlos B. Duarte, Helena L. A. Vieira
Veröffentlicht in: Molecular Neurobiology, 2018, ISSN 0893-7648
Herausgeber: Humana Press, Inc.
DOI: 10.1007/s12035-018-1302-7

Phenolic Metabolites Modulate Cardiomyocyte Beating in Response to Isoproterenol

Autoren: Daniela Dias-Pedroso, Joel Guerra, Andreia Gomes, Carole Oudot, Catherine Brenner, Cláudia N. Santos, Helena L. A. Vieira
Veröffentlicht in: Cardiovascular Toxicology, 2018, ISSN 1530-7905
Herausgeber: Humana Press, Inc.
DOI: 10.1007/s12012-018-9485-8

Melanin Transferred to Keratinocytes Resides in Nondegradative Endocytic Compartments

Autoren: Maria S. Correia, Hugo Moreiras, Francisco J.C. Pereira, Matilde V. Neto, Tiago C. Festas, Abul K. Tarafder, José S. Ramalho, Miguel C. Seabra, Duarte C. Barral
Veröffentlicht in: Journal of Investigative Dermatology, Ausgabe 138/3, 2018, Seite(n) 637-646, ISSN 0022-202X
Herausgeber: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1016/j.jid.2017.09.042

Rab GTPase regulation of bacteria and protozoa phagocytosis occurs through the modulation of phagocytic receptor surface expression

Autoren: Elsa Seixas, Cristina Escrevente, Miguel C. Seabra, Duarte C. Barral
Veröffentlicht in: Scientific Reports, Ausgabe 8/1, 2018, ISSN 2045-2322
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-018-31171-5

Beneficial effects on vision in patients undergoing retinal gene therapy for choroideremia

Autoren: Kanmin Xue, Jasleen K Jolly, Alun R. Barnard, Anna Rudenko, Anna P. Salvetti, Maria I. Patrício, Thomas L. Edwards, Markus Groppe, Harry O. Orlans, Tanya Tolmachova, Graeme C. Black, Andrew R. Webster, Andrew J. Lotery, Graham E. Holder, Susan M. Downes, Miguel C. Seabra, Robert E. MacLaren
Veröffentlicht in: Nature Medicine, Ausgabe 24/10, 2018, Seite(n) 1507-1512, ISSN 1078-8956
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41591-018-0185-5

Two-Year Results After AAV2-Mediated Gene Therapy for Choroideremia: The Alberta Experience

Autoren: Ioannis S. Dimopoulos, Stephanie C. Hoang, Alina Radziwon, Natalia M. Binczyk, Miguel C. Seabra, Robert E. MacLaren, Rizwan Somani, Matthew T.S. Tennant, Ian M. MacDonald
Veröffentlicht in: American Journal of Ophthalmology, Ausgabe 193, 2018, Seite(n) 130-142, ISSN 0002-9394
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.ajo.2018.06.011

Rab3a and Rab10 are regulators of lysosome exocytosis and plasma membrane repair

Autoren: Otilia V. Vieira
Veröffentlicht in: Small GTPases, Ausgabe 9/4, 2016, Seite(n) 349-351, ISSN 2154-1248
Herausgeber: Landes Bioscience
DOI: 10.1080/21541248.2016.1235004

Lipid and Non-lipid Factors Affecting Macrophage Dysfunction and Inflammation in Atherosclerosis

Autoren: Mark S. Gibson, Neuza Domingues, Otilia V. Vieira
Veröffentlicht in: Frontiers in Physiology, Ausgabe 9, 2018, ISSN 1664-042X
Herausgeber: Frontiers Research Foundation
DOI: 10.3389/fphys.2018.00654

Cholesterol is Inefficiently Converted to Cholesteryl Esters in the Blood of Cardiovascular Disease Patients

Autoren: Mathias J. Gerl, Winchil L. C. Vaz, Neuza Domingues, Christian Klose, Michal A. Surma, Júlio L. Sampaio, Manuel S. Almeida, Gustavo Rodrigues, Pedro Araújo-Gonçalves, Jorge Ferreira, Claudia Borbinha, João Pedro Marto, Miguel Viana-Baptista, Kai Simons, Otilia V. Vieira
Veröffentlicht in: Scientific Reports, Ausgabe 8/1, 2018, ISSN 2045-2322
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-018-33116-4

MicroRNA-424(322) as a new marker of disease progression in pulmonary arterial hypertension and its role in right ventricular hypertrophy by targeting SMURF1

Autoren: Rui Baptista, Carla Marques, Steve Catarino, Francisco J Enguita, Marina C Costa, Paulo Matafome, Mónica Zuzarte, Graça Castro, Abílio Reis, Pedro Monteiro, Mariano Pêgo, Paulo Pereira, Henrique Girão
Veröffentlicht in: Cardiovascular Research, Ausgabe 114/1, 2017, Seite(n) 53-64, ISSN 0008-6363
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1093/cvr/cvx187

The Endolysosomal System and Proteostasis: From Development to Degeneration

Autoren: Bettina Winckler, Victor Faundez, Sandra Maday, Qian Cai, Cláudia Guimas Almeida, Huaye Zhang
Veröffentlicht in: The Journal of Neuroscience, Ausgabe 38/44, 2018, Seite(n) 9364-9374, ISSN 0270-6474
Herausgeber: Society for Neuroscience
DOI: 10.1523/JNEUROSCI.1665-18.2018

Impact of late-onset Alzheimer’s genetic risk factors on beta-amyloid endocytic production

Autoren: Cláudia Guimas Almeida, Farzaneh Sadat Mirfakhar, Catarina Perdigão, Tatiana Burrinha
Veröffentlicht in: Cellular and Molecular Life Sciences, Ausgabe 75/14, 2018, Seite(n) 2577-2589, ISSN 1420-682X
Herausgeber: Birkhauser Verlag
DOI: 10.1007/s00018-018-2825-9

Wall stress enhanced exocytosis of extracellular vesicles as a possible mechanism of left-right symmetry-breaking in vertebrate development

Autoren: J. Solowiej-Wedderburn, D.J. Smith, S.S. Lopes, T.D. Montenegro-Johnson
Veröffentlicht in: Journal of Theoretical Biology, Ausgabe 460, 2019, Seite(n) 220-226, ISSN 0022-5193
Herausgeber: Academic Press
DOI: 10.1016/j.jtbi.2018.10.015

Zebrafish Larvae Are a Suitable Model to Investigate the Metabolic Phenotype of Drug-Induced Renal Tubular Injury

Autoren: Judit Morello, Rico J. E. Derks, Susana S. Lopes, Evelyne Steenvoorden, Emilia C. Monteiro, Oleg A. Mayboroda, Sofia A. Pereira
Veröffentlicht in: Frontiers in Pharmacology, Ausgabe 9, 2018, ISSN 1663-9812
Herausgeber: Frontiers Media S.A.
DOI: 10.3389/fphar.2018.01193

Arl13b Regulates Breast Cancer Cell Migration and Invasion by Controlling Integrin-Mediated Signaling

Autoren: Cristina Casalou, Alexandra Faustino, Fernanda Silva, Inês C. Ferreira, Daniela Vaqueirinho, Andreia Ferreira, Pedro Castanheira, Teresa Barona, José S. Ramalho, Jacinta Serpa, Ana Félix, Duarte C. Barral
Veröffentlicht in: Cancers, Ausgabe 11/10, 2019, Seite(n) 1461, ISSN 2072-6694
Herausgeber: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/cancers11101461

Melanin processing by keratinocytes: A non‐microbial type of host‐pathogen interaction?

Autoren: Hugo Moreiras, Mafalda Lopes‐da‐Silva, Miguel C. Seabra, Duarte C. Barral
Veröffentlicht in: Traffic, Ausgabe 20/4, 2019, Seite(n) 301-304, ISSN 1398-9219
Herausgeber: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/tra.12638

Nucleotide exchange factor Rab3GEP requires DENN and non-DENN elements for activation and targeting of Rab27a

Autoren: Paolo Sanzà, Richard D. Evans, Deborah A. Briggs, Marta Cantero, Lluis Montoliu, Shyamal Patel, Elena V. Sviderskaya, Aymelt Itzen, Ana C. Figueiredo, Miguel C. Seabra, Alistair N. Hume
Veröffentlicht in: Journal of Cell Science, Ausgabe 132/9, 2019, Seite(n) jcs212035, ISSN 0021-9533
Herausgeber: The Company of Biologists Ltd.
DOI: 10.1242/jcs.212035

Remodeling of the Basal Labyrinth of Retinal Pigment Epithelial Cells With Osmotic Challenge, Age, and Disease

Autoren: Matthew J. Hayes, Thomas Burgoyne, Silene T. Wavre-Shapton, Tanya Tolmachova, Miguel C. Seabra, Clare E. Futter
Veröffentlicht in: Investigative Opthalmology & Visual Science, Ausgabe 60/7, 2019, Seite(n) 2515, ISSN 1552-5783
Herausgeber: Invest Ophthalmol Vis Sci
DOI: 10.1167/iovs.19-26784

Dual chemical probes enable quantitative system-wide analysis of protein prenylation and prenylation dynamics

Autoren: Elisabeth M. Storck, Julia Morales-Sanfrutos, Remigiusz A. Serwa, Nattawadee Panyain, Thomas Lanyon-Hogg, Tanya Tolmachova, Leandro N. Ventimiglia, Juan Martin-Serrano, Miguel C. Seabra, Beata Wojciak-Stothard, Edward W. Tate
Veröffentlicht in: Nature Chemistry, Ausgabe 11/6, 2019, Seite(n) 552-561, ISSN 1755-4330
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41557-019-0237-6

Imbalanced mitochondrial function provokes heterotaxy via aberrant ciliogenesis

Autoren: Martin D. Burkhalter, Arthi Sridhar, Pedro Sampaio, Raquel Jacinto, Martina S. Burczyk, Cornelia Donow, Max Angenendt, Maja Hempel, Paul Walther, Petra Pennekamp, Heymut Omran, Susana S. Lopes, Stephanie M. Ware, Melanie Philipp
Veröffentlicht in: Journal of Clinical Investigation, Ausgabe 129/7, 2019, Seite(n) 2841-2855, ISSN 0021-9738
Herausgeber: American Society for Clinical Investigation
DOI: 10.1172/jci98890

Crosstalk between cilia and autophagy: implication for human diseases (project related publication after the start date of LYSOCIL project, RP2)

Autoren: Manuela Morleo, Helena L A Vieira, Petra Pennekamp, Alessandro Palma, Liliana Bento-Lopes, Heymut Omran, Susana S Lopes, Duarte C Barral, Brunella Franco
Veröffentlicht in: Autophagy, Ausgabe 1/20, 2022, ISSN 1554-8627
Herausgeber: Landes Bioscience
DOI: 10.1080/15548627.2022.2067383

Lysosome (dys)function in atherosclerosis – a big weight on the shoulders of a small organelle (project related publication after the start date of LYSOCIL project, RP2)

Autoren: André R A Marques, Cristiano Ramos, Gisela Machado-Oliveira, Otília V Vieira
Veröffentlicht in: Front Cell Dev Biol, 2021, ISSN 2296-634X
Herausgeber: Frontiers Media S.A.
DOI: 10.3389/fcell.2021.658995

Assessment of Mitochondrial Protein Glutathionylation as Signaling for CO Pathway

Autoren: Ana S. Almeida, Helena L. A. Vieira
Veröffentlicht in: Mitochondrial Medicine, Ausgabe 1264, 2015, Seite(n) 343-350, ISBN 978-1-4939-2256-7
Herausgeber: Springer New York
DOI: 10.1007/978-1-4939-2257-4_30

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