HEalth data LInkage for ClinicAL benefit

Projektinformationen

HELICAL

ID Finanzhilfevereinbarung: 813545

DOI

10.3030/813545

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 31 August 2018

Startdatum 1 Januar 2019

Enddatum 30 Juni 2023

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions

Gesamtkosten

€ 4 050 338,34

EU-Beitrag

€ 4 050 338,34

Koordiniert durch

THE PROVOST, FELLOWS, FOUNDATION SCHOLARS & THE OTHER MEMBERS OF BOARD, OF THE COLLEGE OF THE HOLY & UNDIVIDED TRINITY OF QUEEN ELIZABETH NEAR DUBLIN
Ireland

CORDIS bietet Links zu öffentlichen Ergebnissen und Veröffentlichungen von HORIZONT-Projekten.

Links zu Ergebnissen und Veröffentlichungen von RP7-Projekten sowie Links zu einigen Typen spezifischer Ergebnisse wie Datensätzen und Software werden dynamisch von OpenAIRE abgerufen.

Leistungen

Documents, reports (26)

Plan for Exploitation and Dissemination of Results

To guide WP 7 activity

Report on protein composition of EV

ESR 11

Statistical Software Package and Code

ESR 3

Governance framework for research in rare diseases

ESR 15

WP 3 Summary report

Report on WP 3 outputs

Report on suitability of EV as disease marker in AAV

ESR 11

Data Management Plan (DMP)

ESR 15

Report on the analysis of the molecular mechanisms in the context of a human interaction network

ESR 9

WP1 Summary Report

Report on WP1 outputs

Validated / endorsed ethical and governance framework

Report on WP4 outputs

Report describing vasculitis flare prodome

ESR1

Report on development of a multivariate assay for the diagnosis of different forms of vasculitis

ESR 14

Final Report

Final summary of achievements of consortium along with plans for sustainability

Report on clinical evaluation of automated descriptor reading in tissue morphometry

ESR 12

Report summarising key pathways activated in tissue from patients with GCA

ESR 10

Dissemination/Exploitation 2

Report to be the basis of the periodic report

Communication/Public Engagement 2

Report to be the basis of the periodic report

Report on identification of new genetic associations

ESR 8

Dissemination/Exploitation 1

Report to be the basis of the periodic report

WP 2 Report Summary

Report on WP 2 outputs

Report on genetic/epigenetic markers of GCA & related vasculitides

ESR 78

Report on minimal biomarker set for diagnosis of active vasculitis

ESR 14

Report on the role of environment in AAV onset

ESR45

Report on the analysis of the vasculitis associated autoantibody repertoire

KTH

Helical IG policies

ESR 15

Communication/Public Engagement 1

Report to be the basis of the periodic report

Open Research Data Pilot (1)

Open Data research Pilot

ORDP

Veröffentlichungen

Non-peer reviewed articles (1)

COVID-19 Pandemic Sets New Clues on the Transmission Pathways in Kawasaki Disease

Autoren: Xavier Rodó, Alejandro Fontal
Veröffentlicht in: JAMA Network Open, Ausgabe 4/4, 2021, Seite(n) e214624, ISSN 2574-3805
Herausgeber: JAMA Network
DOI: 10.1001/jamanetworkopen.2021.4624

Peer reviewed articles (21)

Climatic signatures in the different COVID-19 pandemic waves across both hemispheres

Autoren: Alejandro Fontal, Menno J. Bouma, Adrià San-José, Leonardo López, Mercedes Pascual & Xavier Rodó
Veröffentlicht in: Nature Computational Science, 2021, ISSN 2662-8457
Herausgeber: Springer Nature
DOI: 10.1038/s43588-021-00136-6

DECODE: a computational pipeline to discover T cell receptor binding rules

Autoren: Iliana Papadopoulou, An-Phi Nguyen, Anna Weber, María Rodríguez Martínez
Veröffentlicht in: Bioinformatics, Ausgabe 38, 2022, ISSN 1367-4803
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/bioinformatics/btac257

ANCA-associated vasculitis in Ireland: a multi-centre national cohort study

Autoren: Jennifer Scott, Eithne Nic an Ríogh , Shamma Al Nokhatha1, Cliona Cowhig, Alyssa Verrelli, Ted Fitzgerald, Arthur White, Cathal Walsh, Louis Aslett, Declan DeFreitas, Michael R. Clarkson, John Holian, Matthew D. Griffin, Niall Conlon , Yvonne O’Meara, Liam Casserly, Eamonn Molloy, Julie Power, Sarah M. Moran, Mark A. Little
Veröffentlicht in: HRB Open Res, 2022, ISSN 2515-4826
Herausgeber: Research Limited
DOI: 10.12688/hrbopenres.13651.1

Isolation of Small Extracellular Vesicles from Human Sera

Autoren: Małgorzata S. Małys, Christof Aigner, Stefan M. Schulz, Helga Schachner, Andrew J. Rees, Renate Kain
Veröffentlicht in: International Journal of Molecular Sciences, Ausgabe 22/9, 2021, Seite(n) 4653, ISSN 1422-0067
Herausgeber: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/ijms22094653

Persisting Salivary IgG Against SARS-CoV-2 at 9 Months After Mild COVID-19: A Complementary Approach to Population Surveys

Autoren: Hassan Alkharaan, Shaghayegh Bayati, Cecilia Hellström, Soo Aleman, Annika Olsson, Karin Lindahl, Gordana Bogdanovic, Katie Healy, Georgios Tsilingaridis, Patricia De Palma, Sophia Hober, Anna Månberg, Peter Nilsson, Elisa Pin, Margaret Sällberg Chen
Veröffentlicht in: The Journal of Infectious Diseases, Ausgabe 224/3, 2021, Seite(n) 407-414, ISSN 0022-1899
Herausgeber: University of Chicago Press
DOI: 10.1093/infdis/jiab256

Benchmarking solutions to the T-cell receptor epitope prediction problem: IMMREP22 workshop report

Autoren: Pieter Meysman, Justin Barton, Barbara Bravi, Liel Cohen-Lavi, Vadim Karnaukhov, Elias Lilleskov, Alessandro Montemurro, Morten Nielsen, Thierry Mora, Paul Pereira, Anna Postovskaya, María Rodríguez Martínez, Jorge Fernandez-de-Cossio-Diaz, Alexandra Vujkovic, Aleksandra M. Walczak, Anna Weber, Rose Yin, Anne Eugster, Virag Sharma
Veröffentlicht in: ImmunoInformatics, Ausgabe Vol 9, 2023, ISSN 2667-1190
Herausgeber: Elsevier
DOI: 10.1016/j.immuno.2023.100024

Evaluating the usability of a semantic environmental health data framework: Approach and study

Autoren: Albert Navarro-Gallinad, Fabrizio Orlandi, Jennifer Scott, Mark Little, Declan O'Sullivan
Veröffentlicht in: Semantic Web, Ausgabe Pre-press, 2022, ISSN 1570-0844
Herausgeber: IOS Press
DOI: 10.3233/sw-223212

Identification of new risk loci shared across systemic vasculitides points towards potential target genes for drug repurposing.

Autoren: Lourdes Ortiz-Fernández; Elio G Carmona; Martin Kerick; Paul Lyons; Francisco David Carmona; Raquel López Mejías; Chiea Chuen Khor; Peter C Grayson; Enrico Tombetti; Lindi Jiang; Haner Direskeneli; Guher Saruhan-Direskeneli; José-Luis Callejas-Rubio; Augusto Vaglio; Carlo Salvarani; Jose Hernández-Rodríguez; Maria Cinta Cid; Ann W Morgan; Peter A Merkel; David Burgner; Kenneth GC Smith; Migu
Veröffentlicht in: Annals of Rheumatic Disease, Ausgabe 1, 2022, ISSN 0003-4967
Herausgeber: BMJ Publishing Group
DOI: 10.1136/ard-2022-223697

On the interpretation of the atmospheric mechanism transporting the environmental trigger of Kawasaki Disease

Autoren: Joan Ballester, Sílvia Borràs, Roger Curcoll, Albert Navarro-Gallinad, Sofya Pozdniakova, Lidia Cañas, Jane C. Burns, Xavier Rodó
Veröffentlicht in: PLOS ONE, Ausgabe 14/12, 2019, Seite(n) e0226402, ISSN 1932-6203
Herausgeber: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pone.0226402

The end of social confinement and COVID-19 re-emergence risk.

Autoren: López, Leonardo; Rodó, Xavier
Veröffentlicht in: Nature Human Behaviour, Ausgabe 2, 2020, ISSN 2397-3374
Herausgeber: Springer Nature Limited
DOI: 10.1038/s41562-020-0908-8

Blocking GM-CSF receptor α with mavrilimumab reduces infiltrating cells, pro-inflammatory markers and neoangiogenesis in ex vivo cultured arteries from patients with giant cell arteritis

Autoren: Marc Corbera-Bellalta, Roser Alba-Rovira, Sujatha Muralidharan, Georgina Espígol-Frigolé, Roberto Ríos-Garcés, Javier Marco-Hernández, Amanda Denuc, Farah Kamberovic, Patricia Pérez-Galán, Alexandra Joseph, Annalisa D’Andrea, Kent Bondensgaard, Maria C Cid, John F Paolini
Veröffentlicht in: Annals of the Rheumatic Diseases, Ausgabe 81/4, 2022, ISSN 0003-4967
Herausgeber: BMJ Publishing Group
DOI: 10.1136/annrheumdis-2021-220873

Methylome and transcriptome profiling of giant cell arteritis monocytes reveals novel pathways involved in disease pathogenesis and molecular response to glucocorticoids

Autoren: Elkyn Estupiñán-Moreno, Lourdes Ortiz-Fernández, Tianlu Li, Jose Hernández-Rodríguez, Laura Ciudad, Eduardo Andrés-León, Laura Carmen Terron-Camero, Sergio Prieto-González, Georgina Espígol-Frigolé, Maria Cinta Cid, Ana Márquez, Esteban Ballestar, Javier Martín
Veröffentlicht in: Annals of the Rheumatic Diseases, Ausgabe 81/9, 2022, ISSN 0003-4967
Herausgeber: BMJ Publishing Group
DOI: 10.1136/annrheumdis-2022-222156

IDENTIFICATION OF NEW RISK LOCI AND PATHWAYS INVOLVED IN GCA PATHOGENESIS BY A GENOME-WIDE STUDY

Autoren: G. Borrego-Yaniz, L. Ortiz-Fernández, M. Kerick, A. Madrid-Paredes, A. Vaglio, J. Hernández-Rodríguez, S. Mackie, S. Castañeda, R. Solans-Laqué, J. Mestre, B. Dasgupta, R. Watts, N. Khalidi, C. Langford, S. R. Ytterberg, L. Beretta, M. Govoni, G. Emmi, M. A. Cimmino, T. Witte, T. Neumann, J. Holle, V. Schönau, G. Pugnet, T. Papo, J. Haroche, A. Mahr, L. Mouthon, Ø. Molberg, A. Diamantopoulo
Veröffentlicht in: Annals of the Rheumatic Diseases, Ausgabe volume 82, supplement 1, year 2023, 2023, Seite(n) page 68, ISSN 0003-4967
Herausgeber: BMJ Publishing Group
DOI: 10.1136/annrheumdis-2023-eular.673

Incidence of giant cell arteritis in six districts of Paris, France (2015–2017)

Autoren: Solange Gonzalez Chiappe; Sarah Lechtman; Carla Soledad Maldini; Arsène Mekinian; Thomas Papo; Thomas Sené; Alfred Daniel Mahr
Veröffentlicht in: Rheumatology International, Ausgabe 42, 2022, ISSN 1437-160X
Herausgeber: Springer
DOI: 10.1007/s00296-022-05167-4

Environmental risk factors associated with ANCA associated vasculitis: A systematic mapping review

Autoren: Jennifer Scott, Jack Hartnett, David Mockler, Mark A. Little
Veröffentlicht in: Autoimmunity Reviews, Ausgabe 19/11, 2020, Seite(n) 102660, ISSN 1568-9972
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.autrev.2020.102660

Small extracellular vesicles are released ex vivo from platelets into serum and from residual blood cells into stored plasma

Autoren: Małgorzata S. Małys, Maximilian C. Köller, Kristin Papp, Christof Aigner, Daffodil Dioso, Patrick Mucher, Helga Schachner, Michael Bonelli, Helmuth Haslacher, Andrew J. Rees, Renate Kain
Veröffentlicht in: Journal of Extracellular Biology, Ausgabe Vol.2/5, 2023, ISSN 2001-3078
Herausgeber: Wiley in pqrtnership with ISEV
DOI: 10.1002/jex2.88

A Literature Review on the GDPR, COVID-19 and the Ethical Considerations of Data Protection During a Time of Crisis

Autoren: Maria Christofidou, Nathan Lea, Pascal Coorevits
Veröffentlicht in: Yearbook of Medical Informatics, Ausgabe 30/01, 2021, Seite(n) 226-232, ISSN 0943-4747
Herausgeber: Pubmed
DOI: 10.1055/s-0041-1726512

Somatostatin Receptor PET/MR Imaging of Inflammation in Patients With Large Vessel Vasculitis and Atherosclerosis

Autoren: Andrej Corovic, Christopher Wall, Meritxell Nus, Deepa Gopalan, Yuan Huang, Maria Imaz, Michal Zulcinski, Marta Peverelli, Anna Uryga, Jordi Lambert, Dario Bressan, Robert T. Maughan, Charis Pericleous, Suraiya Dubash, Natasha Jordan, David R. Jayne, Stephen P. Hoole, Patrick A. Calvert, Andrew F. Dean, Doris Rassl, Tara Barwick, Mark Iles, Mattia Frontini, Greg Hannon, Roido Manavaki, Tim D. Fr
Veröffentlicht in: Journal of the American College of Cardiology, Ausgabe Vol. 81 No. 4, 2023, ISSN 0735-1097
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.jacc.2022.10.034

TITAN: T Cell Receptor Specificity Prediction with Bimodal Attention Networks

Autoren: Weber, Anna; Born, Jannis; Martínez, María Rodríguez
Veröffentlicht in: Bioinformatics, Ausgabe 10, 2021, ISSN 1367-4803
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.48550/arxiv.2105.03323

Sub-weekly signatures relate ultrafine aerosols enriched in metals from intensive farming and urban pollution to Kawasaki disease

Autoren: Xavier Rodó, Albert Navarro-Gallinad, Tomoko Kojima, Josep-Anton Morguí, Silvia Borràs and Alejandro Fontal
Veröffentlicht in: Environmental Research Letters, Ausgabe Vol.18, n.7, 2023, ISSN 1748-9326
Herausgeber: Institute of Physics Publishing
DOI: 10.1088/1748-9326/acd798

The association between ambient UVB dose and ANCA-associated vasculitis relapse and onset

Autoren: Scott, J; Havyarimana, E; Navarro-Gallinad, A; White, A; Wyse, J; van Geffen, J; van Weele, M; Buettner, A; Wanigasekera, T; Walsh, C; Aslett, LJM; Kelleher, JD; Power, J; Ng, J; O’Sullivan, D; Hederman, L; Basu, N; Little, MA; Zgaga, L; , RKD and UKIVAS groups
Veröffentlicht in: Arthritis Research & Therapy, 2022, Vol.24(1), pp.147 [Peer Reviewed Journal], Ausgabe 13, 2022, ISSN 1478-6362
Herausgeber: Springer Nature
DOI: 10.1186/s13075-022-02834-6

Conference proceedings (3)

Enhancing Rare Disease Research with Semantic Integration of Environmental and Health Data

Autoren: Albert Navarro-Gallinad, Fabrizio Orlandi, Declan O'Sullivan
Veröffentlicht in: IJCKG'21, Ausgabe 10, 2022, Seite(n) 19-27
Herausgeber: Association for Computing Machinery
DOI: 10.1145/3502223.3502226

The Semantic Combining for Exploration of Environmental and Disease Data Dashboard for Clinician Researchers

Autoren: Albert Navarro-Gallinad, Alan Meehan, and Declan O’Sullivan
Veröffentlicht in: VOILA! 2020 Visualization and Interaction for Ontologies and Linked Data 5th International Workshop co-located with ISWC 2020, November 2nd 2020, Virtual Conference, Ausgabe Annual, 2020
Herausgeber: http://ceur-ws.org/

Proceedings of the 20th International Vasculitis and ANCA workshop 3-6th April 2022

Autoren: Michael Clarkson; Allyson Egan; Mark A Little
Veröffentlicht in: Proceedings of the 20th International Vasculitis and ANCA workshop 3-6th April 2022, Ausgabe 8, 2022
Herausgeber: Zenodo
DOI: 10.5281/zenodo.6454077

Thesis and dissertations (3)

A Usable Knowledge Graph Framework for Linking Health Events with Environmental Data

Autoren: Navarro Gallinad, Albert
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: Trinity College Dublin

Estudio de las causas moleculares de la arteritis de células gigantes mediante una aproximación sistémica

Autoren: Estupiñán Moreno, Elkyn Fabián
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: University of Granada

Autoantibody profiling in autoimmune diseases

Autoren: Shaghayegh Bayati
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: KTH

Other (1)

HELICAL Open Research Guidelines

Autoren: Christofidou, Maria; Navarro-Gallinad, Albert
Veröffentlicht in: Ausgabe 3, 2022
Herausgeber: Zenodo
DOI: 10.5281/zenodo.7214802