Projektbeschreibung
Die Erforschung adaptiver Eigenschaften von Krebszellen bei der Krankheitsprogression
Die Zusammensetzung und molekularen Eigenschaften von Tumoren ändern sich im Laufe der Krankheit; die Mechanismen hinter diesen Veränderungen sind jedoch noch immer unzureichend erforscht. Das EU-finanzierte Projekt CancerADAPT basiert auf dem Postulat, dass Krebszellen auf adaptive transkriptionelle und metabolische Mechanismen angewiesen sind, wodurch schnell neue Mikroumgebungen geschaffen werden können, während die Erkrankung weiter voranschreitet. Das Projekt möchte die molekularen Hinweise vorhersagen, welche für die adaptiven Eigenschaften von Prostatakrebszellen verantwortlich sind. Anhand von Einzelzell-RNA-Sequenzierung, räumlicher Transkriptomik und multiregionalen Omik-Ansätzen möchte das Forschungsteam die transkriptionelle und metabolische Diversität von Tumoren über den Verlauf der Krankheit hinweg erkennen. Mittels rechnergestützter Analysen wird es die vorhergesagten Anpassungsstrategien von Prostatakrebszellen als Reaktion auf Veränderungen in der Mikroumgebung eines Tumors identifizieren und klassifizieren können.
Ziel
The composition and molecular features of tumours vary during the course of the disease, and the selection pressure imposed by the environment is a central component in this process. Evolutionary principles have been exploited to explain the genomic aberrations in cancer. However, the phenotypic changes underlying disease progression remain poorly understood. In the past years, I have contributed to identify and characterise the therapeutic implications underlying metabolic alterations that are intrinsic to primary tumours or metastasis. In CancerADAPT I postulate that cancer cells rely on adaptive transcriptional & metabolic mechanisms [converging on a Metabolic Phenotype] in order to rapidly succeed in their establishment in new microenvironments along disease progression. I aim to predict the molecular cues that govern the adaptive properties in prostate cancer (PCa), one of the most commonly diagnosed cancers in men and an important source of cancer-related deaths. I will exploit single cell RNASeq, spatial transcriptomics and multiregional OMICs in order to identify the transcriptional and metabolic diversity within tumours and along disease progression. I will complement experimental strategies with computational analyses that identify and classify the predicted adaptation strategies of PCa cells in response to variations in the tumour microenvironment. Metabolic phenotypes postulated to sustain PCa adaptability will be functionally and mechanistically deconstructed. We will identify therapeutic strategies emanating from these results through in silico methodologies and small molecule high-throughput screening, and evaluate their potential to hamper the adaptability of tumour cells in vitro and in vivo, in two specific aspects: metastasis and therapy response. CancerADAPT will generate fundamental understanding on how cancer cells adapt in our organism, in turn leading to therapeutic strategies that increase the efficacy of current treatments.
Wissenschaftliches Gebiet
Schlüsselbegriffe
Programm/Programme
Thema/Themen
Finanzierungsplan
ERC-COG - Consolidator GrantGastgebende Einrichtung
48160 DERIO VIZCAYA
Spanien