Descrizione del progetto
Approfondimento sulla patogenesi della SMD: il ruolo dei fattori di splicing
La sindrome mielodisplastica (SMD) è un gruppo eterogeneo di disturbi correlato a cellule del sangue disfunzionali, che spesso progredisce in leucemia. La SMD è caratterizzata da mutazioni nei geni implicati nello splicing dell’mRNA, ma il meccanismo patogenetico non è chiaro. Il progetto PATRES-MDS, finanziato dall’UE, studierà l’ipotesi secondo la quale le cellule del sangue che portano mutazioni nei geni del fattore di splicing dominano e guidano l’ematopoiesi clonale negli individui di età superiore ai 70 anni. I ricercatori studieranno l’interazione dell’invecchiamento con le mutazioni nei geni SF3B1 e SRSF2, che codificano le proteine del meccanismo di splicing. I geni saranno inoltre testati in un modello murino della malattia per individuare ulteriori perturbazioni in vivo che guidano la SMD.
Obiettivo
The myelodysplastic syndromes (MDS) are a heterogeneous group of malignancies of the haematopoietic stem cell (HSC) with a tendency for leukaemic transformation. Despite some new therapies, the MDS are lethal to most sufferers and in need of new effective treatments. Splicing factor gene mutations are the commonest class of somatic alterations in MDS and primarily affect the genes SF3B1, SRSF2, U2AF1 and ZRSR2. The mutations are associated with altered mRNA splicing, but each affects different transcripts and it is unclear how they drive MDS. It has been hypothesised that different mutations share pathogenetic mechanisms, distinct from their effects on alternative splicing. Recently, augmented R-Loop formation leading to cell cycle arrest of haematopoietic progenitors was identified as one such mechanism. However, we have no understanding of how the mutations drive clonal HSC expansion, a critical node for the development of new treatments. To this end, we and others described the phenomenon of clonal haematopoiesis (CH), widely held as the precursor of MDS and other myeloid cancers. We observed CH driven by splicing gene mutations only in individuals aged ≥ 70-years-old. This and other observations point to an interaction between ageing and the ability of splice factor mutations to drive clonal expansion. Here, I propose to investigate the two most common variants in MDS, SF3B1-K700E and SRSF2-P95H.
Research Plan
1. Characterise the global impact of the mutations using state-of-the-art transcriptomics and proteomics
2. Use bone marrow samples from elderly humans to study the interaction of ageing with splicing factor mutations
3. Generate mosaic mutant mice to investigate the impact of ageing and other perturbations on SF3B1-K700E and SRSF2-P95H haematopoiesis
Findings will be validated and pursued mechanistically to derive new insights into the molecular mechanisms and interaction of the mutations with ageing, whilst also identifying new candidate therapies.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
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- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine proteomica
- scienze naturali scienze biologiche genetica mutazione
- scienze mediche e della salute medicina clinica oncologia
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
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H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
PROGRAMMA PRINCIPALE
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Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
ERC-COG - Consolidator Grant
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Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
(si apre in una nuova finestra) ERC-2018-COG
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Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
CB2 1TN CAMBRIDGE
Regno Unito
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.