Chromosome Replication Visualised by Cryo-EM

Información del proyecto

CRYOREP

Identificador del acuerdo de subvención: 820102

DOI

10.3030/820102

Proyecto cerrado

Fecha de la firma de la CE 17 Diciembre 2018

Fecha de inicio 1 Marzo 2019

Fecha de finalización 31 Agosto 2025

Financiado con arreglo a

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coste total

€ 2 000 000,00

Aportación de la UE

€ 2 000 000,00

Coordinado por

THE FRANCIS CRICK INSTITUTE LIMITED
United Kingdom

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Publicaciones

Peer reviewed articles (17)

Caught in the act: structural dynamics of replication origin activation and fork progression

Autores: Jacob S. Lewis, Alessandro Costa
Publicado en: Biochemical Society Transactions, Edición 48/3, 2020, Página(s) 1057-1066, ISSN 0300-5127
Editor: Portland Press, Ltd.
DOI: 10.1042/bst20190998

MCM double hexamer loading visualized with human proteins

Autores: Florian Weissmann, Julia F. Greiwe, Thomas Pühringer, Evelyn L. Eastwood, Emma C. Couves, Thomas C. R. Miller, John F. X. Diffley, Alessandro Costa
Publicado en: Nature, Edición 636, 2024, Página(s) 499-508, ISSN 0028-0836
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-024-08263-6

Unidirectional MCM translocation away from ORC drives origin licensing

Autores: Agata Butryn, Julia F. Greiwe, Alessandro Costa
Publicado en: Nature Communications, Edición 16, 2025, ISSN 2041-1723
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-025-56143-y

Microtubule Nucleation Properties of Single Human γTuRCs Explained by Their Cryo-EM Structure

Autores: Tanja Consolati; Julia Locke; Johanna Roostalu; Zhuo Angel Chen; Julian Gannon; Jayant Asthana; Wei Ming Lim; Fabrizio Martino; Milos A. Cvetkovic; Juri Rappsilber; Alessandro Costa; Thomas Surrey
Publicado en: Developmental Cell, 2020, ISSN 1534-5807
Editor: Cell Press
DOI: 10.1016/j.devcel.2020.04.019

In silico reconstitution of DNA replication. Lessons from single-molecule imaging and cryo-tomography applied to single-particle cryo-EM

Autores: Julia F. Greiwe, Giulia Zanetti, Thomas C.R. Miller, Alessandro Costa
Publicado en: Current Opinion in Structural Biology, Edición 72, 2024, Página(s) 279-286, ISSN 0959-440X
Editor: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.sbi.2021.11.015

Unwinding of a eukaryotic origin of replication visualized by cryo-EM

Autores: Sarah S. Henrikus, Marta H. Gross, Oliver Willhoft, Thomas Pühringer, Jacob S. Lewis, Allison W. McClure, Julia F. Greiwe, Giacomo Palm, Andrea Nans, John F. X. Diffley, Alessandro Costa
Publicado en: Nature Structural & Molecular Biology, Edición 31, 2024, Página(s) 1265-1276, ISSN 1545-9993
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41594-024-01280-z

Mechanism of replication origin melting nucleated by CMG helicase assembly

Autores: Jacob S. Lewis, Marta H. Gross, Joana Sousa, Sarah S. Henrikus, Julia F. Greiwe, Andrea Nans, John F. X. Diffley & Alessandro Costa
Publicado en: Nature, 2022, ISSN 0028-0836
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-022-04829-4

A structural framework for DNA replication and transcription through chromatin

Autores: Oliver Willhoft, Alessandro Costa
Publicado en: Current Opinion in Structural Biology, Edición 71, 2023, Página(s) 51-58, ISSN 0959-440X
Editor: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.sbi.2021.05.008

A Structure-Based Mechanism for DNA Entry into the Cohesin Ring

Autores: Torahiko L. Higashi, Patrik Eickhoff, Joana S. Sousa, Julia Locke, Andrea Nans, Helen R. Flynn, Ambrosius P. Snijders, George Papageorgiou, Nicola O’Reilly, Zhuo A. Chen, Francis J. O’Reilly, Juri Rappsilber, Alessandro Costa, Frank Uhlmann
Publicado en: Molecular Cell, Edición 79/6, 2020, Página(s) 917-933.e9, ISSN 1097-2765
Editor: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2020.07.013

Towards a Structural Mechanism for Sister Chromatid Cohesion Establishment at the Eukaryotic Replication Fork

Autores: Sarah S. Henrikus, Alessandro Costa
Publicado en: Biology, Edición 10, 2025, Página(s) 466, ISSN 2079-7737
Editor: MDPI AG
DOI: 10.3390/biology10060466

Multiple roles of Pol epsilon in eukaryotic chromosome replication

Autores: Milos A. Cvetkovic, Esther Ortega, Roberto Bellelli, Alessandro Costa
Publicado en: Biochemical Society Transactions, Edición 50, 2022, Página(s) 309-320, ISSN 0300-5127
Editor: Portland Press, Ltd.
DOI: 10.1042/bst20210082

Retroviral integration into nucleosomes through DNA looping and sliding along the histone octamer

Autores: Valerie E Pye; David Rueda; Peter Cherepanov; Marcus Wilson; Mohamed Ghoneim; Ludovic Renault
Publicado en: Nature Communications, 2019, ISSN 2041-1723
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1101/663336

Mechanism of head-to-head MCM double-hexamer formation revealed by cryo-EM

Autores: Thomas C. R. Miller, Julia Locke, Julia F. Greiwe, John F. X. Diffley, Alessandro Costa
Publicado en: Nature, Edición 575/7784, 2019, Página(s) 704-710, ISSN 0028-0836
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-019-1768-0

The structural mechanism of dimeric DONSON in replicative helicase activation

Autores: Milos A. Cvetkovic, Paolo Passaretti, Agata Butryn, Alicja Reynolds-Winczura, Georgia Kingsley, Aggeliki Skagia, Cyntia Fernandez-Cuesta, Divyasree Poovathumkadavil, Roger George, Anoop S. Chauhan, Satpal S. Jhujh, Grant S. Stewart, Agnieszka Gambus, Alessandro Costa
Publicado en: Molecular Cell, Edición 83, 2023, Página(s) 4017-4031.e9, ISSN 1097-2765
Editor: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2023.09.029

Molecular Basis for ATP-Hydrolysis-Driven DNA Translocation by the CMG Helicase of the Eukaryotic Replisome

Autores: Patrik Eickhoff, Hazal B. Kose, Fabrizio Martino, Tatjana Petojevic, Ferdos Abid Ali, Julia Locke, Nele Tamberg, Andrea Nans, James M. Berger, Michael R. Botchan, Hasan Yardimci, Alessandro Costa
Publicado en: Cell Reports, Edición 28/10, 2019, Página(s) 2673-2688.e8, ISSN 2211-1247
Editor: Cell Press
DOI: 10.1016/j.celrep.2019.07.104

Protocol for the purification of replisomes from the Xenopus laevis egg extract system for single-particle cryo-EM analysis

Autores: Paolo Passaretti, Milos A. Cvetkovic, Alessandro Costa, Agnieszka Gambus
Publicado en: STAR Protocols, Edición 5, 2025, Página(s) 103237, ISSN 2666-1667
Editor: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.xpro.2024.103237

Structural mechanism for the selective phosphorylation of DNA-loaded MCM double hexamers by the Dbf4-dependent kinase

Autores: Julia F. Greiwe, Thomas C. R. Miller, Julia Locke, Fabrizio Martino, Steven Howell, Anne Schreiber, Andrea Nans, John F. X. Diffley & Alessandro Costa
Publicado en: Nature Structural & Molecular Biology, 2022, ISSN 1545-9993
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41594-021-00698-z