Chromosome Replication Visualised by Cryo-EM

Informations projet

CRYOREP

N° de convention de subvention: 820102

DOI

10.3030/820102

Projet clôturé

Date de signature de la CE 17 Decembre 2018

Date de début 1 Mars 2019

Date de fin 31 Août 2025

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 2 000 000,00

Contribution de l’UE

€ 2 000 000,00

Coordonné par

THE FRANCIS CRICK INSTITUTE LIMITED
United Kingdom

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Publications

Peer reviewed articles (17)

Caught in the act: structural dynamics of replication origin activation and fork progression

Auteurs: Jacob S. Lewis, Alessandro Costa
Publié dans: Biochemical Society Transactions, Numéro 48/3, 2020, Page(s) 1057-1066, ISSN 0300-5127
Éditeur: Portland Press, Ltd.
DOI: 10.1042/bst20190998

MCM double hexamer loading visualized with human proteins

Auteurs: Florian Weissmann, Julia F. Greiwe, Thomas Pühringer, Evelyn L. Eastwood, Emma C. Couves, Thomas C. R. Miller, John F. X. Diffley, Alessandro Costa
Publié dans: Nature, Numéro 636, 2024, Page(s) 499-508, ISSN 0028-0836
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-024-08263-6

Unidirectional MCM translocation away from ORC drives origin licensing

Auteurs: Agata Butryn, Julia F. Greiwe, Alessandro Costa
Publié dans: Nature Communications, Numéro 16, 2025, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-025-56143-y

Microtubule Nucleation Properties of Single Human γTuRCs Explained by Their Cryo-EM Structure

Auteurs: Tanja Consolati; Julia Locke; Johanna Roostalu; Zhuo Angel Chen; Julian Gannon; Jayant Asthana; Wei Ming Lim; Fabrizio Martino; Milos A. Cvetkovic; Juri Rappsilber; Alessandro Costa; Thomas Surrey
Publié dans: Developmental Cell, 2020, ISSN 1534-5807
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.devcel.2020.04.019

In silico reconstitution of DNA replication. Lessons from single-molecule imaging and cryo-tomography applied to single-particle cryo-EM

Auteurs: Julia F. Greiwe, Giulia Zanetti, Thomas C.R. Miller, Alessandro Costa
Publié dans: Current Opinion in Structural Biology, Numéro 72, 2024, Page(s) 279-286, ISSN 0959-440X
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.sbi.2021.11.015

Unwinding of a eukaryotic origin of replication visualized by cryo-EM

Auteurs: Sarah S. Henrikus, Marta H. Gross, Oliver Willhoft, Thomas Pühringer, Jacob S. Lewis, Allison W. McClure, Julia F. Greiwe, Giacomo Palm, Andrea Nans, John F. X. Diffley, Alessandro Costa
Publié dans: Nature Structural & Molecular Biology, Numéro 31, 2024, Page(s) 1265-1276, ISSN 1545-9993
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41594-024-01280-z

Mechanism of replication origin melting nucleated by CMG helicase assembly

Auteurs: Jacob S. Lewis, Marta H. Gross, Joana Sousa, Sarah S. Henrikus, Julia F. Greiwe, Andrea Nans, John F. X. Diffley & Alessandro Costa
Publié dans: Nature, 2022, ISSN 0028-0836
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-022-04829-4

A structural framework for DNA replication and transcription through chromatin

Auteurs: Oliver Willhoft, Alessandro Costa
Publié dans: Current Opinion in Structural Biology, Numéro 71, 2023, Page(s) 51-58, ISSN 0959-440X
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.sbi.2021.05.008

A Structure-Based Mechanism for DNA Entry into the Cohesin Ring

Auteurs: Torahiko L. Higashi, Patrik Eickhoff, Joana S. Sousa, Julia Locke, Andrea Nans, Helen R. Flynn, Ambrosius P. Snijders, George Papageorgiou, Nicola O’Reilly, Zhuo A. Chen, Francis J. O’Reilly, Juri Rappsilber, Alessandro Costa, Frank Uhlmann
Publié dans: Molecular Cell, Numéro 79/6, 2020, Page(s) 917-933.e9, ISSN 1097-2765
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2020.07.013

Towards a Structural Mechanism for Sister Chromatid Cohesion Establishment at the Eukaryotic Replication Fork

Auteurs: Sarah S. Henrikus, Alessandro Costa
Publié dans: Biology, Numéro 10, 2025, Page(s) 466, ISSN 2079-7737
Éditeur: MDPI AG
DOI: 10.3390/biology10060466

Multiple roles of Pol epsilon in eukaryotic chromosome replication

Auteurs: Milos A. Cvetkovic, Esther Ortega, Roberto Bellelli, Alessandro Costa
Publié dans: Biochemical Society Transactions, Numéro 50, 2022, Page(s) 309-320, ISSN 0300-5127
Éditeur: Portland Press, Ltd.
DOI: 10.1042/bst20210082

Retroviral integration into nucleosomes through DNA looping and sliding along the histone octamer

Auteurs: Valerie E Pye; David Rueda; Peter Cherepanov; Marcus Wilson; Mohamed Ghoneim; Ludovic Renault
Publié dans: Nature Communications, 2019, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1101/663336

Mechanism of head-to-head MCM double-hexamer formation revealed by cryo-EM

Auteurs: Thomas C. R. Miller, Julia Locke, Julia F. Greiwe, John F. X. Diffley, Alessandro Costa
Publié dans: Nature, Numéro 575/7784, 2019, Page(s) 704-710, ISSN 0028-0836
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-019-1768-0

The structural mechanism of dimeric DONSON in replicative helicase activation

Auteurs: Milos A. Cvetkovic, Paolo Passaretti, Agata Butryn, Alicja Reynolds-Winczura, Georgia Kingsley, Aggeliki Skagia, Cyntia Fernandez-Cuesta, Divyasree Poovathumkadavil, Roger George, Anoop S. Chauhan, Satpal S. Jhujh, Grant S. Stewart, Agnieszka Gambus, Alessandro Costa
Publié dans: Molecular Cell, Numéro 83, 2023, Page(s) 4017-4031.e9, ISSN 1097-2765
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2023.09.029

Molecular Basis for ATP-Hydrolysis-Driven DNA Translocation by the CMG Helicase of the Eukaryotic Replisome

Auteurs: Patrik Eickhoff, Hazal B. Kose, Fabrizio Martino, Tatjana Petojevic, Ferdos Abid Ali, Julia Locke, Nele Tamberg, Andrea Nans, James M. Berger, Michael R. Botchan, Hasan Yardimci, Alessandro Costa
Publié dans: Cell Reports, Numéro 28/10, 2019, Page(s) 2673-2688.e8, ISSN 2211-1247
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.celrep.2019.07.104

Protocol for the purification of replisomes from the Xenopus laevis egg extract system for single-particle cryo-EM analysis

Auteurs: Paolo Passaretti, Milos A. Cvetkovic, Alessandro Costa, Agnieszka Gambus
Publié dans: STAR Protocols, Numéro 5, 2025, Page(s) 103237, ISSN 2666-1667
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.xpro.2024.103237

Structural mechanism for the selective phosphorylation of DNA-loaded MCM double hexamers by the Dbf4-dependent kinase

Auteurs: Julia F. Greiwe, Thomas C. R. Miller, Julia Locke, Fabrizio Martino, Steven Howell, Anne Schreiber, Andrea Nans, John F. X. Diffley & Alessandro Costa
Publié dans: Nature Structural & Molecular Biology, 2022, ISSN 1545-9993
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41594-021-00698-z