Chromosome Replication Visualised by Cryo-EM

Informazioni relative al progetto

CRYOREP

ID dell’accordo di sovvenzione: 820102

DOI

10.3030/820102

Progetto chiuso

Data della firma CE 17 Dicembre 2018

Data di avvio 1 Marzo 2019

Data di completamento 31 Agosto 2025

Finanziato da

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Costo totale

€ 2 000 000,00

Contributo UE

€ 2 000 000,00

Coordinato da

THE FRANCIS CRICK INSTITUTE LIMITED
United Kingdom

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I link ai risultati e alle pubblicazioni dei progetti del 7° PQ, così come i link ad alcuni tipi di risultati specifici come dataset e software, sono recuperati dinamicamente da .OpenAIRE .

Pubblicazioni

Peer reviewed articles (17)

Caught in the act: structural dynamics of replication origin activation and fork progression

Autori: Jacob S. Lewis, Alessandro Costa
Pubblicato in: Biochemical Society Transactions, Numero 48/3, 2020, Pagina/e 1057-1066, ISSN 0300-5127
Editore: Portland Press, Ltd.
DOI: 10.1042/bst20190998

MCM double hexamer loading visualized with human proteins

Autori: Florian Weissmann, Julia F. Greiwe, Thomas Pühringer, Evelyn L. Eastwood, Emma C. Couves, Thomas C. R. Miller, John F. X. Diffley, Alessandro Costa
Pubblicato in: Nature, Numero 636, 2024, Pagina/e 499-508, ISSN 0028-0836
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-024-08263-6

Unidirectional MCM translocation away from ORC drives origin licensing

Autori: Agata Butryn, Julia F. Greiwe, Alessandro Costa
Pubblicato in: Nature Communications, Numero 16, 2025, ISSN 2041-1723
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-025-56143-y

Microtubule Nucleation Properties of Single Human γTuRCs Explained by Their Cryo-EM Structure

Autori: Tanja Consolati; Julia Locke; Johanna Roostalu; Zhuo Angel Chen; Julian Gannon; Jayant Asthana; Wei Ming Lim; Fabrizio Martino; Milos A. Cvetkovic; Juri Rappsilber; Alessandro Costa; Thomas Surrey
Pubblicato in: Developmental Cell, 2020, ISSN 1534-5807
Editore: Cell Press
DOI: 10.1016/j.devcel.2020.04.019

In silico reconstitution of DNA replication. Lessons from single-molecule imaging and cryo-tomography applied to single-particle cryo-EM

Autori: Julia F. Greiwe, Giulia Zanetti, Thomas C.R. Miller, Alessandro Costa
Pubblicato in: Current Opinion in Structural Biology, Numero 72, 2024, Pagina/e 279-286, ISSN 0959-440X
Editore: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.sbi.2021.11.015

Unwinding of a eukaryotic origin of replication visualized by cryo-EM

Autori: Sarah S. Henrikus, Marta H. Gross, Oliver Willhoft, Thomas Pühringer, Jacob S. Lewis, Allison W. McClure, Julia F. Greiwe, Giacomo Palm, Andrea Nans, John F. X. Diffley, Alessandro Costa
Pubblicato in: Nature Structural & Molecular Biology, Numero 31, 2024, Pagina/e 1265-1276, ISSN 1545-9993
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41594-024-01280-z

Mechanism of replication origin melting nucleated by CMG helicase assembly

Autori: Jacob S. Lewis, Marta H. Gross, Joana Sousa, Sarah S. Henrikus, Julia F. Greiwe, Andrea Nans, John F. X. Diffley & Alessandro Costa
Pubblicato in: Nature, 2022, ISSN 0028-0836
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-022-04829-4

A structural framework for DNA replication and transcription through chromatin

Autori: Oliver Willhoft, Alessandro Costa
Pubblicato in: Current Opinion in Structural Biology, Numero 71, 2023, Pagina/e 51-58, ISSN 0959-440X
Editore: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.sbi.2021.05.008

A Structure-Based Mechanism for DNA Entry into the Cohesin Ring

Autori: Torahiko L. Higashi, Patrik Eickhoff, Joana S. Sousa, Julia Locke, Andrea Nans, Helen R. Flynn, Ambrosius P. Snijders, George Papageorgiou, Nicola O’Reilly, Zhuo A. Chen, Francis J. O’Reilly, Juri Rappsilber, Alessandro Costa, Frank Uhlmann
Pubblicato in: Molecular Cell, Numero 79/6, 2020, Pagina/e 917-933.e9, ISSN 1097-2765
Editore: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2020.07.013

Towards a Structural Mechanism for Sister Chromatid Cohesion Establishment at the Eukaryotic Replication Fork

Autori: Sarah S. Henrikus, Alessandro Costa
Pubblicato in: Biology, Numero 10, 2025, Pagina/e 466, ISSN 2079-7737
Editore: MDPI AG
DOI: 10.3390/biology10060466

Multiple roles of Pol epsilon in eukaryotic chromosome replication

Autori: Milos A. Cvetkovic, Esther Ortega, Roberto Bellelli, Alessandro Costa
Pubblicato in: Biochemical Society Transactions, Numero 50, 2022, Pagina/e 309-320, ISSN 0300-5127
Editore: Portland Press, Ltd.
DOI: 10.1042/bst20210082

Retroviral integration into nucleosomes through DNA looping and sliding along the histone octamer

Autori: Valerie E Pye; David Rueda; Peter Cherepanov; Marcus Wilson; Mohamed Ghoneim; Ludovic Renault
Pubblicato in: Nature Communications, 2019, ISSN 2041-1723
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1101/663336

Mechanism of head-to-head MCM double-hexamer formation revealed by cryo-EM

Autori: Thomas C. R. Miller, Julia Locke, Julia F. Greiwe, John F. X. Diffley, Alessandro Costa
Pubblicato in: Nature, Numero 575/7784, 2019, Pagina/e 704-710, ISSN 0028-0836
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-019-1768-0

The structural mechanism of dimeric DONSON in replicative helicase activation

Autori: Milos A. Cvetkovic, Paolo Passaretti, Agata Butryn, Alicja Reynolds-Winczura, Georgia Kingsley, Aggeliki Skagia, Cyntia Fernandez-Cuesta, Divyasree Poovathumkadavil, Roger George, Anoop S. Chauhan, Satpal S. Jhujh, Grant S. Stewart, Agnieszka Gambus, Alessandro Costa
Pubblicato in: Molecular Cell, Numero 83, 2023, Pagina/e 4017-4031.e9, ISSN 1097-2765
Editore: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2023.09.029

Molecular Basis for ATP-Hydrolysis-Driven DNA Translocation by the CMG Helicase of the Eukaryotic Replisome

Autori: Patrik Eickhoff, Hazal B. Kose, Fabrizio Martino, Tatjana Petojevic, Ferdos Abid Ali, Julia Locke, Nele Tamberg, Andrea Nans, James M. Berger, Michael R. Botchan, Hasan Yardimci, Alessandro Costa
Pubblicato in: Cell Reports, Numero 28/10, 2019, Pagina/e 2673-2688.e8, ISSN 2211-1247
Editore: Cell Press
DOI: 10.1016/j.celrep.2019.07.104

Protocol for the purification of replisomes from the Xenopus laevis egg extract system for single-particle cryo-EM analysis

Autori: Paolo Passaretti, Milos A. Cvetkovic, Alessandro Costa, Agnieszka Gambus
Pubblicato in: STAR Protocols, Numero 5, 2025, Pagina/e 103237, ISSN 2666-1667
Editore: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.xpro.2024.103237

Structural mechanism for the selective phosphorylation of DNA-loaded MCM double hexamers by the Dbf4-dependent kinase

Autori: Julia F. Greiwe, Thomas C. R. Miller, Julia Locke, Fabrizio Martino, Steven Howell, Anne Schreiber, Andrea Nans, John F. X. Diffley & Alessandro Costa
Pubblicato in: Nature Structural & Molecular Biology, 2022, ISSN 1545-9993
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41594-021-00698-z