Chromosome Replication Visualised by Cryo-EM

Projektinformationen

CRYOREP

ID Finanzhilfevereinbarung: 820102

DOI

10.3030/820102

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 17 Dezember 2018

Startdatum 1 März 2019

Enddatum 31 August 2025

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten

€ 2 000 000,00

EU-Beitrag

€ 2 000 000,00

Koordiniert durch

THE FRANCIS CRICK INSTITUTE LIMITED
United Kingdom

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Links zu Ergebnissen und Veröffentlichungen von RP7-Projekten sowie Links zu einigen Typen spezifischer Ergebnisse wie Datensätzen und Software werden dynamisch von OpenAIRE abgerufen.

Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (17)

Caught in the act: structural dynamics of replication origin activation and fork progression

Autoren: Jacob S. Lewis, Alessandro Costa
Veröffentlicht in: Biochemical Society Transactions, Ausgabe 48/3, 2020, Seite(n) 1057-1066, ISSN 0300-5127
Herausgeber: Portland Press, Ltd.
DOI: 10.1042/bst20190998

MCM double hexamer loading visualized with human proteins

Autoren: Florian Weissmann, Julia F. Greiwe, Thomas Pühringer, Evelyn L. Eastwood, Emma C. Couves, Thomas C. R. Miller, John F. X. Diffley, Alessandro Costa
Veröffentlicht in: Nature, Ausgabe 636, 2024, Seite(n) 499-508, ISSN 0028-0836
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-024-08263-6

Unidirectional MCM translocation away from ORC drives origin licensing

Autoren: Agata Butryn, Julia F. Greiwe, Alessandro Costa
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 16, 2025, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-025-56143-y

Microtubule Nucleation Properties of Single Human γTuRCs Explained by Their Cryo-EM Structure

Autoren: Tanja Consolati; Julia Locke; Johanna Roostalu; Zhuo Angel Chen; Julian Gannon; Jayant Asthana; Wei Ming Lim; Fabrizio Martino; Milos A. Cvetkovic; Juri Rappsilber; Alessandro Costa; Thomas Surrey
Veröffentlicht in: Developmental Cell, 2020, ISSN 1534-5807
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.devcel.2020.04.019

In silico reconstitution of DNA replication. Lessons from single-molecule imaging and cryo-tomography applied to single-particle cryo-EM

Autoren: Julia F. Greiwe, Giulia Zanetti, Thomas C.R. Miller, Alessandro Costa
Veröffentlicht in: Current Opinion in Structural Biology, Ausgabe 72, 2024, Seite(n) 279-286, ISSN 0959-440X
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.sbi.2021.11.015

Unwinding of a eukaryotic origin of replication visualized by cryo-EM

Autoren: Sarah S. Henrikus, Marta H. Gross, Oliver Willhoft, Thomas Pühringer, Jacob S. Lewis, Allison W. McClure, Julia F. Greiwe, Giacomo Palm, Andrea Nans, John F. X. Diffley, Alessandro Costa
Veröffentlicht in: Nature Structural & Molecular Biology, Ausgabe 31, 2024, Seite(n) 1265-1276, ISSN 1545-9993
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41594-024-01280-z

Mechanism of replication origin melting nucleated by CMG helicase assembly

Autoren: Jacob S. Lewis, Marta H. Gross, Joana Sousa, Sarah S. Henrikus, Julia F. Greiwe, Andrea Nans, John F. X. Diffley & Alessandro Costa
Veröffentlicht in: Nature, 2022, ISSN 0028-0836
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-022-04829-4

A structural framework for DNA replication and transcription through chromatin

Autoren: Oliver Willhoft, Alessandro Costa
Veröffentlicht in: Current Opinion in Structural Biology, Ausgabe 71, 2023, Seite(n) 51-58, ISSN 0959-440X
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.sbi.2021.05.008

A Structure-Based Mechanism for DNA Entry into the Cohesin Ring

Autoren: Torahiko L. Higashi, Patrik Eickhoff, Joana S. Sousa, Julia Locke, Andrea Nans, Helen R. Flynn, Ambrosius P. Snijders, George Papageorgiou, Nicola O’Reilly, Zhuo A. Chen, Francis J. O’Reilly, Juri Rappsilber, Alessandro Costa, Frank Uhlmann
Veröffentlicht in: Molecular Cell, Ausgabe 79/6, 2020, Seite(n) 917-933.e9, ISSN 1097-2765
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2020.07.013

Towards a Structural Mechanism for Sister Chromatid Cohesion Establishment at the Eukaryotic Replication Fork

Autoren: Sarah S. Henrikus, Alessandro Costa
Veröffentlicht in: Biology, Ausgabe 10, 2025, Seite(n) 466, ISSN 2079-7737
Herausgeber: MDPI AG
DOI: 10.3390/biology10060466

Multiple roles of Pol epsilon in eukaryotic chromosome replication

Autoren: Milos A. Cvetkovic, Esther Ortega, Roberto Bellelli, Alessandro Costa
Veröffentlicht in: Biochemical Society Transactions, Ausgabe 50, 2022, Seite(n) 309-320, ISSN 0300-5127
Herausgeber: Portland Press, Ltd.
DOI: 10.1042/bst20210082

Retroviral integration into nucleosomes through DNA looping and sliding along the histone octamer

Autoren: Valerie E Pye; David Rueda; Peter Cherepanov; Marcus Wilson; Mohamed Ghoneim; Ludovic Renault
Veröffentlicht in: Nature Communications, 2019, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1101/663336

Mechanism of head-to-head MCM double-hexamer formation revealed by cryo-EM

Autoren: Thomas C. R. Miller, Julia Locke, Julia F. Greiwe, John F. X. Diffley, Alessandro Costa
Veröffentlicht in: Nature, Ausgabe 575/7784, 2019, Seite(n) 704-710, ISSN 0028-0836
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-019-1768-0

The structural mechanism of dimeric DONSON in replicative helicase activation

Autoren: Milos A. Cvetkovic, Paolo Passaretti, Agata Butryn, Alicja Reynolds-Winczura, Georgia Kingsley, Aggeliki Skagia, Cyntia Fernandez-Cuesta, Divyasree Poovathumkadavil, Roger George, Anoop S. Chauhan, Satpal S. Jhujh, Grant S. Stewart, Agnieszka Gambus, Alessandro Costa
Veröffentlicht in: Molecular Cell, Ausgabe 83, 2023, Seite(n) 4017-4031.e9, ISSN 1097-2765
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2023.09.029

Molecular Basis for ATP-Hydrolysis-Driven DNA Translocation by the CMG Helicase of the Eukaryotic Replisome

Autoren: Patrik Eickhoff, Hazal B. Kose, Fabrizio Martino, Tatjana Petojevic, Ferdos Abid Ali, Julia Locke, Nele Tamberg, Andrea Nans, James M. Berger, Michael R. Botchan, Hasan Yardimci, Alessandro Costa
Veröffentlicht in: Cell Reports, Ausgabe 28/10, 2019, Seite(n) 2673-2688.e8, ISSN 2211-1247
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.celrep.2019.07.104

Protocol for the purification of replisomes from the Xenopus laevis egg extract system for single-particle cryo-EM analysis

Autoren: Paolo Passaretti, Milos A. Cvetkovic, Alessandro Costa, Agnieszka Gambus
Veröffentlicht in: STAR Protocols, Ausgabe 5, 2025, Seite(n) 103237, ISSN 2666-1667
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.xpro.2024.103237

Structural mechanism for the selective phosphorylation of DNA-loaded MCM double hexamers by the Dbf4-dependent kinase

Autoren: Julia F. Greiwe, Thomas C. R. Miller, Julia Locke, Fabrizio Martino, Steven Howell, Anne Schreiber, Andrea Nans, John F. X. Diffley & Alessandro Costa
Veröffentlicht in: Nature Structural & Molecular Biology, 2022, ISSN 1545-9993
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41594-021-00698-z