Description du projet
Informations sur la cinétique du cycle de vie de l’ARN
Les méthodes conventionnelles de séquençage de l’ARN fournissent une indication des changements qualitatifs et quantitatifs qui surviennent dans toutes les espèces d’ARN à l’intérieur d’une cellule. Il est donc impossible de distinguer les espèces d’ARN nouvellement synthétisées des espèces d’ARN existantes après un certain intervalle de temps. Le projet SLAMseq, financé par l’UE, s’intéressera tout particulièrement à la méthode SLAMseq (thiol-linked alkylation for the metabolic sequencing of RNA), récemment développée, qui permet de quantifier l’ARN nouvellement synthétisé. En plus d’obtenir des informations sur la cinétique de l’expression génétique, SLAMseq permettra aux chercheurs de déterminer la biogenèse et le renouvellement de différentes molécules d’ARN, telles que les microARN.
Objectif
Current gene expression profiling by massive parallel RNA sequencing provides insight into relative abundance of RNA molecules but fails to resolve the underlying principles in gene regulation that are reflected in the intracellular kinetics of RNA biogenesis, processing and turnover. In the ERC-StG 'miRLIFE', we have developed a novel technology – SLAMseq – that uncovers a chemically modified nucleoside analog by sequencing. When coupled to metabolic RNA labeling and targeted RNA sequencing, SLAMseq provides unprecedented insights into the intracellular kinetics of gene expression in a rapid, scalable and cost-effective manner. Preliminary data show that the SLAMseq technology can be used to modify other nucleoside analogs and be applied for non-targeted RNA seq protocols. In this PoC, we aim to validate and prove this broader applicability of SLAMseq in order to enable and commercialize genome-wide, time-resolved transcriptomics. In this way, metabolic RNA sequencing will revolutionise biomedical research by providing experimental access to the molecular basis of human malignancies and treatments thereof.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
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Programme(s)
Appel à propositions
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2018-PoC
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ERC-POC - Proof of Concept GrantInstitution d’accueil
1030 Wien
Autriche