Skip to main content
Vai all'homepage della Commissione europea (si apre in una nuova finestra)
italiano it
CORDIS - Risultati della ricerca dell’UE
CORDIS

SLAMseq: Temporal resolution in gene expression profiling across multiple platforms

Descrizione del progetto

Comprendere la cinetica del ciclo di vita dell’RNA

I metodi convenzionali di sequenziamento dell’RNA forniscono un’indicazione dei cambiamenti qualitativi e quantitativi in tutte le specie di RNA all’interno di una cellula. Ciò significa che non è possibile distinguere tra specie di RNA di nuova sintesi e già esistenti in una modalità a risoluzione temporale. Il progetto SLAMseq, finanziato dall’UE, si focalizzerà sull’alchilazione legata al tiolo di recente sviluppo per il metodo di sequenziamento metabolico dell’RNA (SLAMseq) che consente la quantificazione dell’RNA di nuova sintesi. Oltre alla comprensione della cinetica dell’espressione genica, i ricercatori utilizzeranno SLAMseq per determinare la biogenesi e il turnover di varie molecole di RNA, quali i microRNA.

Obiettivo

Current gene expression profiling by massive parallel RNA sequencing provides insight into relative abundance of RNA molecules but fails to resolve the underlying principles in gene regulation that are reflected in the intracellular kinetics of RNA biogenesis, processing and turnover. In the ERC-StG 'miRLIFE', we have developed a novel technology – SLAMseq – that uncovers a chemically modified nucleoside analog by sequencing. When coupled to metabolic RNA labeling and targeted RNA sequencing, SLAMseq provides unprecedented insights into the intracellular kinetics of gene expression in a rapid, scalable and cost-effective manner. Preliminary data show that the SLAMseq technology can be used to modify other nucleoside analogs and be applied for non-targeted RNA seq protocols. In this PoC, we aim to validate and prove this broader applicability of SLAMseq in order to enable and commercialize genome-wide, time-resolved transcriptomics. In this way, metabolic RNA sequencing will revolutionise biomedical research by providing experimental access to the molecular basis of human malignancies and treatments thereof.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

Programma(i)

Argomento(i)

Meccanismo di finanziamento

ERC-POC - Proof of Concept Grant

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

(si apre in una nuova finestra) ERC-2018-PoC

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Istituzione ospitante

INSTITUT FUER MOLEKULARE BIOTECHNOLOGIE GMBH
Contributo netto dell'UE
€ 150 000,00
Indirizzo
DR BOHRGASSE 3
1030 Wien
Austria
Regione
Ostösterreich Wien Wien
Tipo di attività
Private for-profit entities (excluding Higher or Secondary Education Establishments)
Collegamenti
Costo totale
€ 150 000,00

Beneficiari (1)