Skip to main content
Przejdź do strony domowej Komisji Europejskiej (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
polski pl
CORDIS - Wyniki badań wspieranych przez UE
CORDIS

SLAMseq: Temporal resolution in gene expression profiling across multiple platforms

Opis projektu

Poznać kinetykę cyklu życia RNA

Konwencjonalne metody sekwencjonowania RNA zapewniają wgląd w jakościowe i ilościowe zmiany we wszystkich rodzajach RNA w komórce. Uniemożliwia to rozróżnianie nowo zsyntezowanych i istniejących rodzajów RNA na przestrzeni czasu. Zespół finansowanego przez UE projektu SLAMseq skupi się na niedawno opracowanej metodzie alkilacji związanej z tiolami w celu przeprowadzenia metabolicznego sekwencjonowania RNA (SLAMseq), które umożliwia ilościową ocenę nowo zsyntetyzowanego RNA. Naukowcy nie tylko dostarczą informacji na temat kinetyki ekspresji genów, ale także wykorzystają SLAMseq do określenia biogenezy i obrotu różnych cząsteczek RNA, takich jak mikroRNA.

Cel

Current gene expression profiling by massive parallel RNA sequencing provides insight into relative abundance of RNA molecules but fails to resolve the underlying principles in gene regulation that are reflected in the intracellular kinetics of RNA biogenesis, processing and turnover. In the ERC-StG 'miRLIFE', we have developed a novel technology – SLAMseq – that uncovers a chemically modified nucleoside analog by sequencing. When coupled to metabolic RNA labeling and targeted RNA sequencing, SLAMseq provides unprecedented insights into the intracellular kinetics of gene expression in a rapid, scalable and cost-effective manner. Preliminary data show that the SLAMseq technology can be used to modify other nucleoside analogs and be applied for non-targeted RNA seq protocols. In this PoC, we aim to validate and prove this broader applicability of SLAMseq in order to enable and commercialize genome-wide, time-resolved transcriptomics. In this way, metabolic RNA sequencing will revolutionise biomedical research by providing experimental access to the molecular basis of human malignancies and treatments thereof.

Dziedzina nauki (EuroSciVoc)

Program(-y)

Temat(-y)

System finansowania

ERC-POC - Proof of Concept Grant

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania

Zaproszenie do składania wniosków

(odnośnik otworzy się w nowym oknie) ERC-2018-PoC

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszenia

Instytucja przyjmująca

INSTITUT FUER MOLEKULARE BIOTECHNOLOGIE GMBH
Wkład UE netto
€ 150 000,00
Adres
DR BOHRGASSE 3
1030 Wien
Austria
Region
Ostösterreich Wien Wien
Rodzaj działalności
Private for-profit entities (excluding Higher or Secondary Education Establishments)
Linki
Koszt całkowity
€ 150 000,00

Beneficjenci (1)