Opis projektu
Poznać kinetykę cyklu życia RNA
Konwencjonalne metody sekwencjonowania RNA zapewniają wgląd w jakościowe i ilościowe zmiany we wszystkich rodzajach RNA w komórce. Uniemożliwia to rozróżnianie nowo zsyntezowanych i istniejących rodzajów RNA na przestrzeni czasu. Zespół finansowanego przez UE projektu SLAMseq skupi się na niedawno opracowanej metodzie alkilacji związanej z tiolami w celu przeprowadzenia metabolicznego sekwencjonowania RNA (SLAMseq), które umożliwia ilościową ocenę nowo zsyntetyzowanego RNA. Naukowcy nie tylko dostarczą informacji na temat kinetyki ekspresji genów, ale także wykorzystają SLAMseq do określenia biogenezy i obrotu różnych cząsteczek RNA, takich jak mikroRNA.
Cel
Current gene expression profiling by massive parallel RNA sequencing provides insight into relative abundance of RNA molecules but fails to resolve the underlying principles in gene regulation that are reflected in the intracellular kinetics of RNA biogenesis, processing and turnover. In the ERC-StG 'miRLIFE', we have developed a novel technology – SLAMseq – that uncovers a chemically modified nucleoside analog by sequencing. When coupled to metabolic RNA labeling and targeted RNA sequencing, SLAMseq provides unprecedented insights into the intracellular kinetics of gene expression in a rapid, scalable and cost-effective manner. Preliminary data show that the SLAMseq technology can be used to modify other nucleoside analogs and be applied for non-targeted RNA seq protocols. In this PoC, we aim to validate and prove this broader applicability of SLAMseq in order to enable and commercialize genome-wide, time-resolved transcriptomics. In this way, metabolic RNA sequencing will revolutionise biomedical research by providing experimental access to the molecular basis of human malignancies and treatments thereof.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego.
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Program(-y)
System finansowania
ERC-POC - Proof of Concept GrantInstytucja przyjmująca
1030 Wien
Austria