Description du projet
La modélisation mécaniste virtuelle pour prévoir les thérapies personnalisées pour les cancers pédiatriques
Le projet iPC, financé par l’UE, élabore une approche personnalisée de la médecine pour les enfants atteints de cancer, qui se concentre sur les tumeurs pédiatriques à forte incidence et à haut risque. Cet effort de calcul combinera des modèles fondés sur la connaissance, d’apprentissage automatique et mécanistes dans le but de prévoir les thérapies standard et expérimentales optimales pour chaque enfant. L’approche repose sur des modèles de patients virtuels dont l’analyse permettra d’établir des diagnostics personnalisés et des recommandations de traitements. Le consortium est composé d’experts en recherche fondamentale, translationnelle et clinique. Il a établi des relations solides avec des organisations de patients prestigieuses et des essais cliniques axés sur la médecine personnalisée pour les études de cas proposées.
Objectif
Effective personalized medicine for paediatric cancers must address a multitude of challenges, including domain-specific challenges. To overcome these challenges, we propose a comprehensive computational effort to combine knowledge-base, machine-learning, and mechanistic models to predict optimal standard and experimental therapies for each child. Our approach is based on virtual patient models–in-silico avatars whose analysis can inform personalized diagnostics and recommend treatments. Our platform will also allow care givers to query models and infer benefits and drawbacks for specific treatment combinations for each child. To construct these models, we will combine state-of-the-art computational methods and data from molecular assays, and clinical and preclinical studies. We will test their predictions prospectively on data from clinical trials and test therapies in pre-clinical settings. We will focus on a select panel of paediatric tumours including both high-incidence and high-risk tumour types. To accomplish our goals, we have assembled an interdisciplinary team consisting of basic, translational, and clinical researchers—all amongst the leaders in their respective fields—and established strong relationships with European Centres of Excellence, patient organizations, and clinical trials focus on personalized medicine for our proposed case studies. We will produce, assemble, standardize, and harmonize accessible high-quality multi-disciplinary data and leverage the potential of Big Data and HPC for the personalized treatments of European citizens. We will make our models and data available through a cloud-based platform, whose exploitation will be maximised through a collaboration with the European Open Science Cloud initiative. In summary, iPC will address the critical need for personalized medicine for children with cancer, contribute to the digitalization of clinical workflows, and enable the Digital Single Market of the EU data infrastructure.
Champ scientifique
- natural sciencescomputer and information sciencesdata sciencebig data
- natural sciencescomputer and information sciencescomputational science
- medical and health sciencesclinical medicineoncology
- medical and health scienceshealth sciencespersonalized medicine
- medical and health sciencesclinical medicinepaediatrics
Mots‑clés
Programme(s)
Régime de financement
RIA - Research and Innovation actionCoordinateur
9500 Villach
Autriche
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L’entreprise s’est définie comme une PME (petite et moyenne entreprise) au moment de la signature de la convention de subvention.
Participants (22)
8803 Rueschlikon
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77030 Houston Tx
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75231 Paris
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64289 Darmstadt
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80138 Napoli
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9000 Gent
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08034 Barcelona
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Entité juridique autre qu’un sous-traitant qui est affiliée ou juridiquement liée à un participant. L’entité réalise des travaux dans les conditions prévues par la convention de subvention, fournit des biens ou des services pour l’action, mais n’a pas signé la convention de subvention. Le tiers respecte les règles applicables au participant qui lui est lié dans le cadre de la convention de subvention en ce qui concerne l’éligibilité des coûts et le contrôle des dépenses.
08003 Barcelona
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1000 Ljubljana
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L’entreprise s’est définie comme une PME (petite et moyenne entreprise) au moment de la signature de la convention de subvention.
3584CS Utrecht
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80539 Munchen
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1081 HV Amsterdam
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69120 Heidelberg
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08916 Badalona Barcelona
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12489 Berlin
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L’entreprise s’est définie comme une PME (petite et moyenne entreprise) au moment de la signature de la convention de subvention.
8006 Zurich
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69120 Heidelberg
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80539 Muenchen
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19104 Philadelphia
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00185 Roma
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2145 Westmead, New South Wales
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10117 Berlin
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