Mechanism of ATP Dependent Chromatin Modelling and Editing by INO80 Remodellers

Informations projet

INO3D

N° de convention de subvention: 833613

DOI

10.3030/833613

Projet clôturé

Date de signature de la CE 29 Mai 2019

Date de début 1 Octobre 2019

Date de fin 30 Septembre 2025

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 2 201 875,00

Contribution de l’UE

€ 2 201 875,00

Coordonné par

LUDWIG-MAXIMILIANS-UNIVERSITAET MUENCHEN
Germany

CORDIS fournit des liens vers les livrables publics et les publications des projets HORIZON.

Les liens vers les livrables et les publications des projets du 7e PC, ainsi que les liens vers certains types de résultats spécifiques tels que les jeux de données et les logiciels, sont récupérés dynamiquement sur OpenAIRE .

Publications

Peer reviewed articles (9)

Hexasome-INO80 complex reveals structural basis of noncanonical nucleosome remodeling

Auteurs: Zhang M, Jungblut A, Kunert F, Hauptmann L, Hoffmann T, Kolesnikova O, Metzner F, Moldt M, Weis F, DiMaio F, Hopfner KP, Eustermann S.
Publié dans: Science, 2023, ISSN 0036-8075
Éditeur: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.adf6287

Megadalton chromatin remodelers: common principles for versatile functions.

Auteurs: Anna Jungblut; Sebastian Eustermann; Karl-Peter Hopfner
Publié dans: Current Opinion Struct Biol, Numéro 1, 2020, ISSN 0959-440X
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.sbi.2020.06.024

Structural mechanism of extranucleosomal DNA readout by the INO80 complex

Auteurs: Franziska Kunert; Felix J. Metzner; James Jung; Markus Höpfler; Stephan Woike; Kevin Schall; Dirk Kostrewa; Manuela Moldt; Jia-Xuan Chen; Susanne Bantele; Boris Pfander; Sebastian Eustermann; Karl-Peter Hopfner
Publié dans: Science Advances, Numéro 1, 2022, ISSN 2375-2548
Éditeur: AAAS
DOI: 10.1126/sciadv.add3189

A SAM-key domain required for enzymatic activity of the Fun30 nucleosome remodeler

Auteurs: Karl, Leonhard A; Galanti, Lorenzo; Bantele, Susanne CS; Metzner, Felix; Šafarić, Barbara; Rajappa, Lional; Foster, Benjamin; Borges Pires, Vanessa; Bansal, Priyanka; Chacin, Erika; Basquin, Jerôme; Duderstadt, Karl E; Kurat, Christoph F; Bartke, Till; Hopfner, Karl-Peter; Pfander, Boris
Publié dans: Life Science Alliance, Numéro 1, 2023, ISSN 2575-1077
Éditeur: Life Science Alliance LLC
DOI: 10.26508/lsa.202201790

Measuring DNA mechanics on the genome scale

Auteurs: Aakash Basu, Dmitriy G. Bobrovnikov, Zan Qureshi, Tunc Kayikcioglu, Thuy T. M. Ngo, Anand Ranjan, Sebastian Eustermann, Basilio Cieza, Michael T. Morgan, Miroslav Hejna, H. Tomas Rube, Karl-Peter Hopfner, Cynthia Wolberger, Jun S. Song, Taekjip Ha
Publié dans: Nature, Numéro 589/7842, 2021, Page(s) 462-467, ISSN 0028-0836
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-020-03052-3

Structural basis for TBP displacement from TATA box DNA by the Swi2/Snf2 ATPase Mot1

Auteurs: Woike S, Eustermann S, Jung J, Wenzl SJ, Hagemann G, Bartho J, Lammens K, Butryn A, Herzog F, Hopfner KP
Publié dans: Nature Structural & Molecular Biology, 2023, ISSN 1545-9993
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41594-023-00966-0

Ruler elements in chromatin remodelers set nucleosome array spacing and phasing

Auteurs: Elisa Oberbeckmann, Vanessa Niebauer, Shinya Watanabe, Lucas Farnung, Manuela Moldt, Andrea Schmid, Patrick Cramer, Craig L. Peterson, Sebastian Eustermann, Karl-Peter Hopfner, Philipp Korber
Publié dans: Nature Communications, 2021, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1101/2020.02.28.969618

Structural basis for human OGG1 processing 8-oxodGuo within nucleosome core particles

Auteurs: Mengtian Ren, Fabian Gut, Yilan Fan, Jingke Ma, Xiajing Shan, Aysenur Yikilmazsoy, Mariia Likhodeeva, Karl-Peter Hopfner, Chuanzheng Zhou
Publié dans: Nature Communications, Numéro 15, 2024, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-53811-3

Genome information processing by the INO80 chromatin remodeler positions nucleosomes

Auteurs: Elisa Oberbeckmann, Nils Krietenstein, Vanessa Niebauer, Yingfei Wang, Kevin Schall, Manuela Moldt, Tobias Straub, Remo Rohs, Karl-Peter Hopfner, Philipp Korber, Sebastian Eustermann
Publié dans: Nature Communications, 2021, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1101/2020.11.03.366690

Other (3)

Recognition and remodelling of nucleosomes and hexasomes by the human INO80 complex

Auteurs: Priyanka Aggarwal, Manmohan Sharma, Stephan Woike, Franziska Kunert, Manuela Moldt, Karl-Peter Hopfner
Publié dans: BioRxiv, 2025
Éditeur: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2025.08.25.671740

Sequence- and chemical specificity define the functional landscape of intrinsically disordered regions

Auteurs: Iris Langstein-Skora, Andrea Schmid, Frauke Huth, Drin Shabani, Lorenz Spechtenhauser, Mariia Likhodeeva, Franziska Kunert, Felix J. Metzner, Ryan J. Emenecker, Mary O.G. Richardson, Wasim Aftab, Maximilian J. Götz, Sarah K. Payer, Niccoló Pietrantoni, Valentina Sjeničić, Sakthi K. Ravichandran, Till Bartke, Karl-Peter Hopfner, Ulrich Gerland, Philipp Korber, Alex S. Holehouse
Publié dans: BioRxiv, 2024
Éditeur: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2022.02.10.480018

Chromatin Protection by the Chromosomal Passenger Complex

Auteurs: A. Gireesh, M.A. Abad, R.-S. Nozawa, P. Sotelo-Parrilla, L.C. Dury, M. Likhodeeva, C. Spanos, C. Cardenal Peralta, J. Rappsilber, K.P. Hopfner, M.D. Wilson, W. Vanderlinden, T. Hirota, A.A. Jeyaprakash
Publié dans: BioRXiv, 2025
Éditeur: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2025.05.15.654082