Mechanism of ATP Dependent Chromatin Modelling and Editing by INO80 Remodellers

Informazioni relative al progetto

INO3D

ID dell’accordo di sovvenzione: 833613

DOI

10.3030/833613

Progetto chiuso

Data della firma CE 29 Maggio 2019

Data di avvio 1 Ottobre 2019

Data di completamento 30 Settembre 2025

Finanziato da

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Costo totale

€ 2 201 875,00

Contributo UE

€ 2 201 875,00

Coordinato da

LUDWIG-MAXIMILIANS-UNIVERSITAET MUENCHEN
Germany

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Pubblicazioni

Peer reviewed articles (9)

Hexasome-INO80 complex reveals structural basis of noncanonical nucleosome remodeling

Autori: Zhang M, Jungblut A, Kunert F, Hauptmann L, Hoffmann T, Kolesnikova O, Metzner F, Moldt M, Weis F, DiMaio F, Hopfner KP, Eustermann S.
Pubblicato in: Science, 2023, ISSN 0036-8075
Editore: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.adf6287

Megadalton chromatin remodelers: common principles for versatile functions.

Autori: Anna Jungblut; Sebastian Eustermann; Karl-Peter Hopfner
Pubblicato in: Current Opinion Struct Biol, Numero 1, 2020, ISSN 0959-440X
Editore: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.sbi.2020.06.024

Structural mechanism of extranucleosomal DNA readout by the INO80 complex

Autori: Franziska Kunert; Felix J. Metzner; James Jung; Markus Höpfler; Stephan Woike; Kevin Schall; Dirk Kostrewa; Manuela Moldt; Jia-Xuan Chen; Susanne Bantele; Boris Pfander; Sebastian Eustermann; Karl-Peter Hopfner
Pubblicato in: Science Advances, Numero 1, 2022, ISSN 2375-2548
Editore: AAAS
DOI: 10.1126/sciadv.add3189

A SAM-key domain required for enzymatic activity of the Fun30 nucleosome remodeler

Autori: Karl, Leonhard A; Galanti, Lorenzo; Bantele, Susanne CS; Metzner, Felix; Šafarić, Barbara; Rajappa, Lional; Foster, Benjamin; Borges Pires, Vanessa; Bansal, Priyanka; Chacin, Erika; Basquin, Jerôme; Duderstadt, Karl E; Kurat, Christoph F; Bartke, Till; Hopfner, Karl-Peter; Pfander, Boris
Pubblicato in: Life Science Alliance, Numero 1, 2023, ISSN 2575-1077
Editore: Life Science Alliance LLC
DOI: 10.26508/lsa.202201790

Measuring DNA mechanics on the genome scale

Autori: Aakash Basu, Dmitriy G. Bobrovnikov, Zan Qureshi, Tunc Kayikcioglu, Thuy T. M. Ngo, Anand Ranjan, Sebastian Eustermann, Basilio Cieza, Michael T. Morgan, Miroslav Hejna, H. Tomas Rube, Karl-Peter Hopfner, Cynthia Wolberger, Jun S. Song, Taekjip Ha
Pubblicato in: Nature, Numero 589/7842, 2021, Pagina/e 462-467, ISSN 0028-0836
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-020-03052-3

Structural basis for TBP displacement from TATA box DNA by the Swi2/Snf2 ATPase Mot1

Autori: Woike S, Eustermann S, Jung J, Wenzl SJ, Hagemann G, Bartho J, Lammens K, Butryn A, Herzog F, Hopfner KP
Pubblicato in: Nature Structural & Molecular Biology, 2023, ISSN 1545-9993
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41594-023-00966-0

Ruler elements in chromatin remodelers set nucleosome array spacing and phasing

Autori: Elisa Oberbeckmann, Vanessa Niebauer, Shinya Watanabe, Lucas Farnung, Manuela Moldt, Andrea Schmid, Patrick Cramer, Craig L. Peterson, Sebastian Eustermann, Karl-Peter Hopfner, Philipp Korber
Pubblicato in: Nature Communications, 2021, ISSN 2041-1723
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1101/2020.02.28.969618

Structural basis for human OGG1 processing 8-oxodGuo within nucleosome core particles

Autori: Mengtian Ren, Fabian Gut, Yilan Fan, Jingke Ma, Xiajing Shan, Aysenur Yikilmazsoy, Mariia Likhodeeva, Karl-Peter Hopfner, Chuanzheng Zhou
Pubblicato in: Nature Communications, Numero 15, 2024, ISSN 2041-1723
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-53811-3

Genome information processing by the INO80 chromatin remodeler positions nucleosomes

Autori: Elisa Oberbeckmann, Nils Krietenstein, Vanessa Niebauer, Yingfei Wang, Kevin Schall, Manuela Moldt, Tobias Straub, Remo Rohs, Karl-Peter Hopfner, Philipp Korber, Sebastian Eustermann
Pubblicato in: Nature Communications, 2021, ISSN 2041-1723
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1101/2020.11.03.366690

Other (3)

Recognition and remodelling of nucleosomes and hexasomes by the human INO80 complex

Autori: Priyanka Aggarwal, Manmohan Sharma, Stephan Woike, Franziska Kunert, Manuela Moldt, Karl-Peter Hopfner
Pubblicato in: BioRxiv, 2025
Editore: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2025.08.25.671740

Sequence- and chemical specificity define the functional landscape of intrinsically disordered regions

Autori: Iris Langstein-Skora, Andrea Schmid, Frauke Huth, Drin Shabani, Lorenz Spechtenhauser, Mariia Likhodeeva, Franziska Kunert, Felix J. Metzner, Ryan J. Emenecker, Mary O.G. Richardson, Wasim Aftab, Maximilian J. Götz, Sarah K. Payer, Niccoló Pietrantoni, Valentina Sjeničić, Sakthi K. Ravichandran, Till Bartke, Karl-Peter Hopfner, Ulrich Gerland, Philipp Korber, Alex S. Holehouse
Pubblicato in: BioRxiv, 2024
Editore: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2022.02.10.480018

Chromatin Protection by the Chromosomal Passenger Complex

Autori: A. Gireesh, M.A. Abad, R.-S. Nozawa, P. Sotelo-Parrilla, L.C. Dury, M. Likhodeeva, C. Spanos, C. Cardenal Peralta, J. Rappsilber, K.P. Hopfner, M.D. Wilson, W. Vanderlinden, T. Hirota, A.A. Jeyaprakash
Pubblicato in: BioRXiv, 2025
Editore: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2025.05.15.654082