Mechanism of ATP Dependent Chromatin Modelling and Editing by INO80 Remodellers

Projektinformationen

INO3D

ID Finanzhilfevereinbarung: 833613

DOI

10.3030/833613

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 29 Mai 2019

Startdatum 1 Oktober 2019

Enddatum 30 September 2025

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten

€ 2 201 875,00

EU-Beitrag

€ 2 201 875,00

Koordiniert durch

LUDWIG-MAXIMILIANS-UNIVERSITAET MUENCHEN
Germany

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Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (9)

Hexasome-INO80 complex reveals structural basis of noncanonical nucleosome remodeling

Autoren: Zhang M, Jungblut A, Kunert F, Hauptmann L, Hoffmann T, Kolesnikova O, Metzner F, Moldt M, Weis F, DiMaio F, Hopfner KP, Eustermann S.
Veröffentlicht in: Science, 2023, ISSN 0036-8075
Herausgeber: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.adf6287

Megadalton chromatin remodelers: common principles for versatile functions.

Autoren: Anna Jungblut; Sebastian Eustermann; Karl-Peter Hopfner
Veröffentlicht in: Current Opinion Struct Biol, Ausgabe 1, 2020, ISSN 0959-440X
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.sbi.2020.06.024

Structural mechanism of extranucleosomal DNA readout by the INO80 complex

Autoren: Franziska Kunert; Felix J. Metzner; James Jung; Markus Höpfler; Stephan Woike; Kevin Schall; Dirk Kostrewa; Manuela Moldt; Jia-Xuan Chen; Susanne Bantele; Boris Pfander; Sebastian Eustermann; Karl-Peter Hopfner
Veröffentlicht in: Science Advances, Ausgabe 1, 2022, ISSN 2375-2548
Herausgeber: AAAS
DOI: 10.1126/sciadv.add3189

A SAM-key domain required for enzymatic activity of the Fun30 nucleosome remodeler

Autoren: Karl, Leonhard A; Galanti, Lorenzo; Bantele, Susanne CS; Metzner, Felix; Šafarić, Barbara; Rajappa, Lional; Foster, Benjamin; Borges Pires, Vanessa; Bansal, Priyanka; Chacin, Erika; Basquin, Jerôme; Duderstadt, Karl E; Kurat, Christoph F; Bartke, Till; Hopfner, Karl-Peter; Pfander, Boris
Veröffentlicht in: Life Science Alliance, Ausgabe 1, 2023, ISSN 2575-1077
Herausgeber: Life Science Alliance LLC
DOI: 10.26508/lsa.202201790

Measuring DNA mechanics on the genome scale

Autoren: Aakash Basu, Dmitriy G. Bobrovnikov, Zan Qureshi, Tunc Kayikcioglu, Thuy T. M. Ngo, Anand Ranjan, Sebastian Eustermann, Basilio Cieza, Michael T. Morgan, Miroslav Hejna, H. Tomas Rube, Karl-Peter Hopfner, Cynthia Wolberger, Jun S. Song, Taekjip Ha
Veröffentlicht in: Nature, Ausgabe 589/7842, 2021, Seite(n) 462-467, ISSN 0028-0836
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-020-03052-3

Structural basis for TBP displacement from TATA box DNA by the Swi2/Snf2 ATPase Mot1

Autoren: Woike S, Eustermann S, Jung J, Wenzl SJ, Hagemann G, Bartho J, Lammens K, Butryn A, Herzog F, Hopfner KP
Veröffentlicht in: Nature Structural & Molecular Biology, 2023, ISSN 1545-9993
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41594-023-00966-0

Ruler elements in chromatin remodelers set nucleosome array spacing and phasing

Autoren: Elisa Oberbeckmann, Vanessa Niebauer, Shinya Watanabe, Lucas Farnung, Manuela Moldt, Andrea Schmid, Patrick Cramer, Craig L. Peterson, Sebastian Eustermann, Karl-Peter Hopfner, Philipp Korber
Veröffentlicht in: Nature Communications, 2021, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1101/2020.02.28.969618

Structural basis for human OGG1 processing 8-oxodGuo within nucleosome core particles

Autoren: Mengtian Ren, Fabian Gut, Yilan Fan, Jingke Ma, Xiajing Shan, Aysenur Yikilmazsoy, Mariia Likhodeeva, Karl-Peter Hopfner, Chuanzheng Zhou
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 15, 2024, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-53811-3

Genome information processing by the INO80 chromatin remodeler positions nucleosomes

Autoren: Elisa Oberbeckmann, Nils Krietenstein, Vanessa Niebauer, Yingfei Wang, Kevin Schall, Manuela Moldt, Tobias Straub, Remo Rohs, Karl-Peter Hopfner, Philipp Korber, Sebastian Eustermann
Veröffentlicht in: Nature Communications, 2021, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1101/2020.11.03.366690

Other (3)

Recognition and remodelling of nucleosomes and hexasomes by the human INO80 complex

Autoren: Priyanka Aggarwal, Manmohan Sharma, Stephan Woike, Franziska Kunert, Manuela Moldt, Karl-Peter Hopfner
Veröffentlicht in: BioRxiv, 2025
Herausgeber: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2025.08.25.671740

Sequence- and chemical specificity define the functional landscape of intrinsically disordered regions

Autoren: Iris Langstein-Skora, Andrea Schmid, Frauke Huth, Drin Shabani, Lorenz Spechtenhauser, Mariia Likhodeeva, Franziska Kunert, Felix J. Metzner, Ryan J. Emenecker, Mary O.G. Richardson, Wasim Aftab, Maximilian J. Götz, Sarah K. Payer, Niccoló Pietrantoni, Valentina Sjeničić, Sakthi K. Ravichandran, Till Bartke, Karl-Peter Hopfner, Ulrich Gerland, Philipp Korber, Alex S. Holehouse
Veröffentlicht in: BioRxiv, 2024
Herausgeber: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2022.02.10.480018

Chromatin Protection by the Chromosomal Passenger Complex

Autoren: A. Gireesh, M.A. Abad, R.-S. Nozawa, P. Sotelo-Parrilla, L.C. Dury, M. Likhodeeva, C. Spanos, C. Cardenal Peralta, J. Rappsilber, K.P. Hopfner, M.D. Wilson, W. Vanderlinden, T. Hirota, A.A. Jeyaprakash
Veröffentlicht in: BioRXiv, 2025
Herausgeber: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2025.05.15.654082