Mechanism of ATP Dependent Chromatin Modelling and Editing by INO80 Remodellers

Informacje na temat projektu

INO3D

Identyfikator umowy o grant: 833613

DOI

10.3030/833613

Projekt został zamknięty

Data podpisania przez KE 29 Maja 2019

Data rozpoczęcia 1 Października 2019

Data zakończenia 30 Września 2025

Finansowanie w ramach

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Koszt całkowity

€ 2 201 875,00

Wkład UE

€ 2 201 875,00

Koordynowany przez

LUDWIG-MAXIMILIANS-UNIVERSITAET MUENCHEN
Germany

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Publikacje

Peer reviewed articles (9)

Hexasome-INO80 complex reveals structural basis of noncanonical nucleosome remodeling

Autorzy: Zhang M, Jungblut A, Kunert F, Hauptmann L, Hoffmann T, Kolesnikova O, Metzner F, Moldt M, Weis F, DiMaio F, Hopfner KP, Eustermann S.
Opublikowane w: Science, 2023, ISSN 0036-8075
Wydawca: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.adf6287

Megadalton chromatin remodelers: common principles for versatile functions.

Autorzy: Anna Jungblut; Sebastian Eustermann; Karl-Peter Hopfner
Opublikowane w: Current Opinion Struct Biol, Numer 1, 2020, ISSN 0959-440X
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.sbi.2020.06.024

Structural mechanism of extranucleosomal DNA readout by the INO80 complex

Autorzy: Franziska Kunert; Felix J. Metzner; James Jung; Markus Höpfler; Stephan Woike; Kevin Schall; Dirk Kostrewa; Manuela Moldt; Jia-Xuan Chen; Susanne Bantele; Boris Pfander; Sebastian Eustermann; Karl-Peter Hopfner
Opublikowane w: Science Advances, Numer 1, 2022, ISSN 2375-2548
Wydawca: AAAS
DOI: 10.1126/sciadv.add3189

A SAM-key domain required for enzymatic activity of the Fun30 nucleosome remodeler

Autorzy: Karl, Leonhard A; Galanti, Lorenzo; Bantele, Susanne CS; Metzner, Felix; Šafarić, Barbara; Rajappa, Lional; Foster, Benjamin; Borges Pires, Vanessa; Bansal, Priyanka; Chacin, Erika; Basquin, Jerôme; Duderstadt, Karl E; Kurat, Christoph F; Bartke, Till; Hopfner, Karl-Peter; Pfander, Boris
Opublikowane w: Life Science Alliance, Numer 1, 2023, ISSN 2575-1077
Wydawca: Life Science Alliance LLC
DOI: 10.26508/lsa.202201790

Measuring DNA mechanics on the genome scale

Autorzy: Aakash Basu, Dmitriy G. Bobrovnikov, Zan Qureshi, Tunc Kayikcioglu, Thuy T. M. Ngo, Anand Ranjan, Sebastian Eustermann, Basilio Cieza, Michael T. Morgan, Miroslav Hejna, H. Tomas Rube, Karl-Peter Hopfner, Cynthia Wolberger, Jun S. Song, Taekjip Ha
Opublikowane w: Nature, Numer 589/7842, 2021, Strona(/y) 462-467, ISSN 0028-0836
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-020-03052-3

Structural basis for TBP displacement from TATA box DNA by the Swi2/Snf2 ATPase Mot1

Autorzy: Woike S, Eustermann S, Jung J, Wenzl SJ, Hagemann G, Bartho J, Lammens K, Butryn A, Herzog F, Hopfner KP
Opublikowane w: Nature Structural & Molecular Biology, 2023, ISSN 1545-9993
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41594-023-00966-0

Ruler elements in chromatin remodelers set nucleosome array spacing and phasing

Autorzy: Elisa Oberbeckmann, Vanessa Niebauer, Shinya Watanabe, Lucas Farnung, Manuela Moldt, Andrea Schmid, Patrick Cramer, Craig L. Peterson, Sebastian Eustermann, Karl-Peter Hopfner, Philipp Korber
Opublikowane w: Nature Communications, 2021, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1101/2020.02.28.969618

Structural basis for human OGG1 processing 8-oxodGuo within nucleosome core particles

Autorzy: Mengtian Ren, Fabian Gut, Yilan Fan, Jingke Ma, Xiajing Shan, Aysenur Yikilmazsoy, Mariia Likhodeeva, Karl-Peter Hopfner, Chuanzheng Zhou
Opublikowane w: Nature Communications, Numer 15, 2024, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-53811-3

Genome information processing by the INO80 chromatin remodeler positions nucleosomes

Autorzy: Elisa Oberbeckmann, Nils Krietenstein, Vanessa Niebauer, Yingfei Wang, Kevin Schall, Manuela Moldt, Tobias Straub, Remo Rohs, Karl-Peter Hopfner, Philipp Korber, Sebastian Eustermann
Opublikowane w: Nature Communications, 2021, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1101/2020.11.03.366690

Other (3)

Recognition and remodelling of nucleosomes and hexasomes by the human INO80 complex

Autorzy: Priyanka Aggarwal, Manmohan Sharma, Stephan Woike, Franziska Kunert, Manuela Moldt, Karl-Peter Hopfner
Opublikowane w: BioRxiv, 2025
Wydawca: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2025.08.25.671740

Sequence- and chemical specificity define the functional landscape of intrinsically disordered regions

Autorzy: Iris Langstein-Skora, Andrea Schmid, Frauke Huth, Drin Shabani, Lorenz Spechtenhauser, Mariia Likhodeeva, Franziska Kunert, Felix J. Metzner, Ryan J. Emenecker, Mary O.G. Richardson, Wasim Aftab, Maximilian J. Götz, Sarah K. Payer, Niccoló Pietrantoni, Valentina Sjeničić, Sakthi K. Ravichandran, Till Bartke, Karl-Peter Hopfner, Ulrich Gerland, Philipp Korber, Alex S. Holehouse
Opublikowane w: BioRxiv, 2024
Wydawca: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2022.02.10.480018

Chromatin Protection by the Chromosomal Passenger Complex

Autorzy: A. Gireesh, M.A. Abad, R.-S. Nozawa, P. Sotelo-Parrilla, L.C. Dury, M. Likhodeeva, C. Spanos, C. Cardenal Peralta, J. Rappsilber, K.P. Hopfner, M.D. Wilson, W. Vanderlinden, T. Hirota, A.A. Jeyaprakash
Opublikowane w: BioRXiv, 2025
Wydawca: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2025.05.15.654082