Skip to main content
Weiter zur Homepage der Europäischen Kommission (öffnet in neuem Fenster)
Deutsch Deutsch
CORDIS - Forschungsergebnisse der EU
CORDIS

Exploiting the Tumor Proteome Activity Status for Future Cancer Therapies

CORDIS bietet Links zu öffentlichen Ergebnissen und Veröffentlichungen von HORIZONT-Projekten.

Links zu Ergebnissen und Veröffentlichungen von RP7-Projekten sowie Links zu einigen Typen spezifischer Ergebnisse wie Datensätzen und Software werden dynamisch von OpenAIRE abgerufen.

Veröffentlichungen

Proteome activity landscapes of tumor cell lines determine drug responses (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Martin Frejno, Chen Meng, Benjamin Ruprecht, Thomas Oellerich, Sebastian Scheich, Karin Kleigrewe, Enken Drecoll, Patroklos Samaras, Alexander Hogrebe, Dominic Helm, Julia Mergner, Jana Zecha, Stephanie Heinzlmeir, Mathias Wilhelm, Julia Dorn, Hans-Michael Kvasnicka, Hubert Serve, Wilko Weichert, Bernhard Kuster
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 11/1, 2020, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-020-17336-9

Decrypting the molecular basis of cellular drug phenotypes by dose-resolved expression proteomics (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Stephan Eckert, Nicola Berner, Karl Kramer, Annika Schneider, Julian Müller, Severin Lechner, Sarah Brajkovic, Amirhossein Sakhteman, Christian Graetz, Jonas Fackler, Michael Dudek, Michael W. Pfaffl, Percy Knolle, Stephanie Wilhelm, Bernhard Kuster
Veröffentlicht in: Nature Biotechnology, 2024, ISSN 1087-0156
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41587-024-02218-y

Data, Reagents, Assays and Merits of Proteomics for SARS-CoV-2 Research and Testing (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Jana Zecha, Chien-Yun Lee, Florian P. Bayer, Chen Meng, Vincent Grass, Johannes Zerweck, Karsten Schnatbaum, Thomas Michler, Andreas Pichlmair, Christina Ludwig, Bernhard Kuster
Veröffentlicht in: Molecular & Cellular Proteomics, Ausgabe 19/9, 2020, Seite(n) 1503-1522, ISSN 1535-9476
Herausgeber: American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI: 10.1074/mcp.ra120.002164

CurveCurator: a recalibrated F-statistic to assess, classify, and explore significance of dose-response curves (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Bayer FP, Gander M, Kuster B, The M
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 14(1), 2023, Seite(n) 7902, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-43696-z

Evaluation of Disposable Trap Column nanoLC-FAIMS-MS/MS for the Proteomic Analysis of FFPE Tissue (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Stephan Eckert, Yun-Chien Chang, Florian P Bayer, Matthew The, Peer-Hendrik Kuhn, Wilko Weichert, Bernhard Kuster
Veröffentlicht in: Journal of Proteome Research, Ausgabe 20(12), 2021, Seite(n) 5402-5411, ISSN 1535-3893
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jproteome.1c00695

Robust Microflow LC-MS/MS for Proteome Analysis: 38 000 Runs and Counting (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Bian Y, Bayer FP, Chang YC, Meng C, Hoefer S, Deng N, Zheng R, Boychenko O, Kuster B.
Veröffentlicht in: Analytical Chemistry, 2021, ISSN 0003-2700
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.analchem.1c00257

Identification of 7 000-9 000 Proteins from Cell Lines and Tissues by Single-Shot Microflow LC-MS/MS. (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Yangyang Bian; Yangyang Bian; Piero Giansanti; Julia Mergner; Runsheng Zheng; Mathias Wilhelm; Alexander Boychenko; Bernhard Kuster
Veröffentlicht in: Analytical Chemistry, Ausgabe 93(25), 2021, Seite(n) 8687-8692, ISSN 0003-2700
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.analchem.1c00738

ProteomicsDB: toward a FAIR open-source resource for life-science research (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Lautenbacher, L., Samaras, P., Muller, J., Grafberger, A., Shraideh, M., Rank, J., Fuchs, S. T., Schmidt, T. K., The, M., Dallago, C., Wittges, H., Rost, B., Krcmar, H., Kuster, B. & Wilhelm, M.
Veröffentlicht in: Nucleic Acids Research, 2022, ISSN 0305-1048
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkab1026

Mass spectrometry-based draft of the mouse proteome (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Piero Giansanti, Patroklos Samaras, Yangyang Bian, Chen Meng, Andrea Coluccio, Martin Frejno, Hannah Jakubowsky, Sophie Dobiasch, Rashmi R Hazarika, Julia Rechenberger, Julia Calzada-Wack, Johannes Krumm, Sebastian Mueller, Chien-Yun Lee, Nicole Wimberger, Ludwig Lautenbacher, Zonera Hassan, Yun-Chien Chang, Chiara Falcomatà, Florian P Bayer, Stefanie Bärthel, Tobias Schmidt, Roland Rad, Stephan
Veröffentlicht in: Nature Methods, 2022, ISSN 1548-7091
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41592-022-01526-y

Chemical proteomics reveals the target landscape of 1,000 kinase inhibitors. (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Reinecke M, Brear P, Vornholz L, Berger BT, Seefried F, Wilhelm S, Samaras P, Gyenis L, Litchfield DW, Médard G, Müller S, Ruland J, Hyvönen M, Wilhelm M, Kuster B.
Veröffentlicht in: Nature Chemical Biology, 2023, ISSN 1552-4450
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41589-023-01459-3

SIMSI-Transfer: Software-Assisted Reduction of Missing Values in Phosphoproteomic and Proteomic Isobaric Labeling Data Using Tandem Mass Spectrum Clustering (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Firas Hamood, Florian P Bayer, Mathias Wilhelm, Bernhard Kuster, Matthew The
Veröffentlicht in: Molecular & Cellular Proteomics, Ausgabe 21(8), 2022, Seite(n) 100238, ISSN 1535-9476
Herausgeber: American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI: 10.1016/j.mcpro.2022.100238

Decrypting drug actions and protein modifications by dose- and time-resolved proteomics (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Zecha J, Bayer FP, Wiechmann S, Woortman J, Berner N, Müller J, Schneider A, Kramer K, Abril-Gil M, Hopf T, Reichart L, Chen L, Hansen FM, Lechner S, Samaras P, Eckert S, Lautenbacher L, Reinecke M, Hamood F, Prokofeva P, Vornholz L, Falcomatà C, Dorsch M, Schröder A, Venhuizen A, Wilhelm S, Médard G, Stoehr G, Ruland J, Grüner BM, Saur D, Buchner M, Ruprecht B, Hahne H, The M, Wilhelm M, Kus
Veröffentlicht in: Science, Ausgabe 380(6640), 2023, Seite(n) 93–101, ISSN 0036-8075
Herausgeber: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.ade3925

Illuminating phenotypic drug responses of sarcoma cells to kinase inhibitors by phosphoproteomics (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Lee CY, The M, Meng C, Bayer FP, Putzker K, Müller J, Streubel J, Woortman J, Sakhteman A, Resch M, Schneider A, Wilhelm S, Kuster B
Veröffentlicht in: Molecular Systems Biology, Ausgabe 20(1), 2023, Seite(n) 28-55, ISSN 1744-4292
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s44320-023-00004-7

Reanalysis of ProteomicsDB Using an Accurate, Sensitive, and Scalable False Discovery Rate Estimation Approach for Protein Groups (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Matthew The, Patroklos Samaras, Bernhard Kuster, Mathias Wilhelm
Veröffentlicht in: Molecular & Cellular Proteomics, Ausgabe 21(12), 2022, Seite(n) 100437, ISSN 1535-9476
Herausgeber: American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI: 10.1016/j.mcpro.2022.100437

Decrypting lysine deacetylase inhibitor action and protein modifications by dose-resolved proteomics (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Yun-Chien Chang, Christian Gnann, Raphael R. Steimbach, Florian P. Bayer, Severin Lechner, Amirhossein Sakhteman, Miriam Abele, Jana Zecha, Jakob Trendel, Matthew The, Emma Lundberg, Aubry K. Miller, Bernhard Kuster
Veröffentlicht in: Cell Reports, Ausgabe 43, 2024, Seite(n) 114272, ISSN 2211-1247
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.celrep.2024.114272

Linking post-translational modifications and protein turnover by site-resolved protein turnover profiling (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Jana Zecha, Wassim Gabriel, Ria Spalek, Yun-Chien Chang, Julia Mergner, Mathias Wilhelm, Florian Bassermann, Bernhard Kuster
Veröffentlicht in: Nature communications, Ausgabe 13(1), 2022, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-27639-0

Robust, reproducible and quantitative analysis of thousands of proteomes by micro-flow LC-MS/MS (öffnet in neuem Fenster)

Autoren: Yangyang Bian, Runsheng Zheng, Florian P. Bayer, Cassandra Wong, Yun-Chien Chang, Chen Meng, Daniel P. Zolg, Maria Reinecke,Jana Zecha, Svenja Wiechmann, Stephanie Heinzlmeir, Johannes Scherr, Bernhard Hemmer,Mike Baynham, Anne-Claude Gingras, Oleksandr Boychenko, and Bernhard Kuster
Veröffentlicht in: Nature communications, Ausgabe 11(1), 2020, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-019-13973-x

Suche nach OpenAIRE-Daten ...

Bei der Suche nach OpenAIRE-Daten ist ein Fehler aufgetreten

Es liegen keine Ergebnisse vor

Mein Booklet 0 0