The Quest of the Argonautes - from Myth to Reality

Información del proyecto

ARGO

Identificador del acuerdo de subvención: 834279

DOI

10.3030/834279

Proyecto cerrado

Fecha de la firma de la CE 20 Junio 2019

Fecha de inicio 1 Julio 2019

Fecha de finalización 30 Junio 2024

Financiado con arreglo a

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coste total

€ 2 177 157,50

Aportación de la UE

€ 2 177 157,50

Coordinado por

WAGENINGEN UNIVERSITY
Netherlands

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Publicaciones

Peer reviewed articles (14)

Alternative functions of CRISPR–Cas systems in the evolutionary arms race

Autores: Prarthana Mohanraju, Chinmoy Saha, Peter van Baarlen, Rogier Louwen, Raymond H. J. Staals, John van der Oost
Publicado en: Nature Reviews Microbiology, Edición 20, 2022, Página(s) 351-364, ISSN 1740-1526
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41579-021-00663-z

Growth-uncoupled isoprenoid synthesis in Rhodobacter sphaeroides

Autores: Enrico Orsi; Enrico Orsi; Ioannis Mougiakos; Wilbert Post; Jules Beekwilder; Marco Dompé; Gerrit Eggink; John van der Oost; Servé W. M. Kengen; Ruud A. Weusthuis
Publicado en: Biotechnology for biofuels, Edición 13/1, 2019, Página(s) 123, ISSN 1754-6834
Editor: BioMed Central Ltd.
DOI: 10.1186/s13068-020-01765-1

Type III-B CRISPR-Cas cascade of proteolytic cleavages

Autores: Jurre A. Steens, Jack P. K. Bravo, Carl Raymund P. Salazar, Caglar Yildiz, Afonso M. Amieiro, Stephan Köstlbacher, Stijn H. P. Prinsen, Ane S. Andres, Constantinos Patinios, Andreas Bardis, Arjan Barendregt, Richard A. Scheltema, Thijs J. G. Ettema, John van der Oost, David W. Taylor, Raymond H. J. Staals
Publicado en: Science, Edición 383, 2024, Página(s) 512-519, ISSN 0036-8075
Editor: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.adk0378

Modulating CRISPR-Cas Genome Editing Using Guide-Complementary DNA Oligonucleotides

Autores: Thomas Swartjes, Peng Shang, Dennis T.M. van den Berg, Tim Künne, Niels Geijsen, Stan J.J. Brouns, John van der Oost, Raymond H.J. Staals, Richard A. Notebaart
Publicado en: The CRISPR Journal, Edición 5, 2022, Página(s) 571-585, ISSN 2573-1599
Editor: Mary Ann Liebert
DOI: 10.1089/crispr.2022.0011

Characterization of the AcrIIC1 anti‒CRISPR protein for Cas9‒based genome engineering in E. coli

Autores: Despoina Trasanidou, Ana Potocnik, Patrick Barendse, Prarthana Mohanraju, Evgenios Bouzetos, Efthymios Karpouzis, Amber Desmet, Richard van Kranenburg, John van der Oost, Raymond H. J. Staals, Ioannis Mougiakos
Publicado en: Communications Biology, Edición 6, 2023, Página(s) 1042, ISSN 2399-3642
Editor: Nature Springer
DOI: 10.1038/s42003-023-05418-5

The genome editing revolution

Autores: van der Oost, John; Patinios, Constantinos
Publicado en: Trends in Biotechnology, Edición 41(3), 2022, Página(s) 396 - 409, ISSN 0167-7799
Editor: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.tibtech.2022.12.022

Editor's cut: DNA cleavage by CRISPR RNA-guided nucleases Cas9 and Cas12a

Autores: Thomas Swartjes; Raymond H.J. Staals; John van der Oost
Publicado en: Biochemical Society Transactions, Edición 02646021, 2020, Página(s) 207–219, ISSN 0264-6021
Editor: Portland Press, Ltd.
DOI: 10.1042/bst20190563

Mechanistic and evolutionary insights into a type V-M CRISPR–Cas effector enzyme

Autores: Satoshi N. Omura, Ryoya Nakagawa, Christian Südfeld, Ricardo Villegas Warren, Wen Y. Wu, Hisato Hirano, Charlie Laffeber, Tsukasa Kusakizako, Yoshiaki Kise, Joyce H. G. Lebbink, Yuzuru Itoh, John van der Oost, Osamu Nureki
Publicado en: Nature Structural & Molecular Biology, Edición 30, 2023, Página(s) 1172-1182, ISSN 1545-9993
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41594-023-01042-3

A hyperthermoactive-Cas9 editing tool reveals the role of a unique arsenite methyltransferase in the arsenic resistance system of Thermus thermophilus HB27

Autores: Giovanni Gallo; Ioannis Mougiakos; Bianco M; Carbonaro M; Andrea Carpentieri; Illiano A; Piero Pucci; Simonetta Bartolucci; van der Oost J; Gabriella Fiorentino
Publicado en: mBio, Edición 21612129, 2021, Página(s) e02813-21, ISSN 2161-2129
Editor: American Society for Microbiology
DOI: 10.1101/2021.07.12.452139

(R)evolution-on-a-chip.

Autores: Bouzetos, Evgenios; Ganar, Ketan Ashok; Mastrobattista, Enrico; Deshpande, Siddharth; van der Oost, John; Afd Pharmaceutics; Pharmaceutics
Publicado en: Trends in Biotechnology, Edición 40/1, 2022, Página(s) 60-67, ISSN 0167-7799
Editor: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.tibtech.2021.04.009

Efficient Cas9-based genome editing of Rhodobacter sphaeroides for metabolic engineering

Autores: Ioannis Mougiakos; Enrico Orsi; Mohammad Rifqi Ghiffary; Mohammad Rifqi Ghiffary; Wilbert Post; Alberto De Maria; Alberto De Maria; Belén Adiego-Pérez; Servé W. M. Kengen; Ruud A. Weusthuis; John van der Oost
Publicado en: Microbial Cell Factories, Edición 18/1, 2019, ISSN 2076-2607
Editor: Springer Nature
DOI: 10.1186/s12934-019-1255-1

Cryo-EM structure of the transposon-associated TnpB enzyme

Autores: Ryoya Nakagawa, Hisato Hirano, Satoshi N. Omura, Suchita Nety, Soumya Kannan, Han Altae-Tran, Xiao Yao, Yuriko Sakaguchi, Takayuki Ohira, Wen Y. Wu, Hiroshi Nakayama, Yutaro Shuto, Tatsuki Tanaka, Fumiya K. Sano, Tsukasa Kusakizako, Yoshiaki Kise, Yuzuru Itoh, Naoshi Dohmae, John van der Oost, Tsutomu Suzuki, Feng Zhang, Osamu Nureki
Publicado en: Nature, Edición 616, 2023, Página(s) 390-397, ISSN 0028-0836
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-023-05933-9

The miniature CRISPR-Cas12m effector binds DNA to block transcription

Autores: Wen Y. Wu, Prarthana Mohanraju, Chunyu Liao, Belén Adiego-Pérez, Sjoerd C.A. Creutzburg, Kira S. Makarova, Karlijn Keessen, Timon A. Lindeboom, Tahseen S. Khan, Stijn Prinsen, Rob Joosten, Winston X. Yan, Anzhela Migur, Charlie Laffeber, David A. Scott, Joyce H.G. Lebbink, Eugene V. Koonin, Chase L. Beisel, John van der Oost
Publicado en: Molecular Cell, Edición 82, 2024, Página(s) 4487-4502.e7, ISSN 1097-2765
Editor: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2022.11.003

Streamlined CRISPR genome engineering in wild-type bacteria using SIBR-Cas.

Autores: Constantinos Patinios; Sjoerd C.A. Creutzburg; Adini Q Arifah; Belén Adiego-Pérez; Evans A Gyimah; Colin J. Ingham; Servé W. M. Kengen; John van der Oost; Raymond H.J. Staals
Publicado en: Nucleic acids research, Edición 49/19, 2021, Página(s) 11392-11404, ISSN 1362-4962
Editor: Oxford Academic
DOI: 10.1093/nar/gkab893

Non-peer reviewed articles (2)

First structural insights into CRISPR-Cas-guided DNA transposition

Autores: John van der Oost, Ioannis Mougiakos
Publicado en: Cell Research, Edición 30, 2023, Página(s) 193-194, ISSN 1001-0602
Editor: Kexue Chubaneshe/Science Press
DOI: 10.1038/s41422-020-0284-y

Compact but mighty: Biology and applications of type III-E CRISPR-Cas systems

Autores: Jurre A. Steens, John van der Oost, Raymond H.J. Staals
Publicado en: Molecular Cell, Edición 82, 2024, Página(s) 4405-4406, ISSN 1097-2765
Editor: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2022.11.007