The Quest of the Argonautes - from Myth to Reality

Informacje na temat projektu

ARGO

Identyfikator umowy o grant: 834279

DOI

10.3030/834279

Projekt został zamknięty

Data podpisania przez KE 20 Czerwca 2019

Data rozpoczęcia 1 Lipca 2019

Data zakończenia 30 Czerwca 2024

Finansowanie w ramach

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Koszt całkowity

€ 2 177 157,50

Wkład UE

€ 2 177 157,50

Koordynowany przez

WAGENINGEN UNIVERSITY
Netherlands

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Publikacje

Peer reviewed articles (14)

Alternative functions of CRISPR–Cas systems in the evolutionary arms race

Autorzy: Prarthana Mohanraju, Chinmoy Saha, Peter van Baarlen, Rogier Louwen, Raymond H. J. Staals, John van der Oost
Opublikowane w: Nature Reviews Microbiology, Numer 20, 2022, Strona(/y) 351-364, ISSN 1740-1526
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41579-021-00663-z

Growth-uncoupled isoprenoid synthesis in Rhodobacter sphaeroides

Autorzy: Enrico Orsi; Enrico Orsi; Ioannis Mougiakos; Wilbert Post; Jules Beekwilder; Marco Dompé; Gerrit Eggink; John van der Oost; Servé W. M. Kengen; Ruud A. Weusthuis
Opublikowane w: Biotechnology for biofuels, Numer 13/1, 2019, Strona(/y) 123, ISSN 1754-6834
Wydawca: BioMed Central Ltd.
DOI: 10.1186/s13068-020-01765-1

Type III-B CRISPR-Cas cascade of proteolytic cleavages

Autorzy: Jurre A. Steens, Jack P. K. Bravo, Carl Raymund P. Salazar, Caglar Yildiz, Afonso M. Amieiro, Stephan Köstlbacher, Stijn H. P. Prinsen, Ane S. Andres, Constantinos Patinios, Andreas Bardis, Arjan Barendregt, Richard A. Scheltema, Thijs J. G. Ettema, John van der Oost, David W. Taylor, Raymond H. J. Staals
Opublikowane w: Science, Numer 383, 2024, Strona(/y) 512-519, ISSN 0036-8075
Wydawca: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.adk0378

Modulating CRISPR-Cas Genome Editing Using Guide-Complementary DNA Oligonucleotides

Autorzy: Thomas Swartjes, Peng Shang, Dennis T.M. van den Berg, Tim Künne, Niels Geijsen, Stan J.J. Brouns, John van der Oost, Raymond H.J. Staals, Richard A. Notebaart
Opublikowane w: The CRISPR Journal, Numer 5, 2022, Strona(/y) 571-585, ISSN 2573-1599
Wydawca: Mary Ann Liebert
DOI: 10.1089/crispr.2022.0011

Characterization of the AcrIIC1 anti‒CRISPR protein for Cas9‒based genome engineering in E. coli

Autorzy: Despoina Trasanidou, Ana Potocnik, Patrick Barendse, Prarthana Mohanraju, Evgenios Bouzetos, Efthymios Karpouzis, Amber Desmet, Richard van Kranenburg, John van der Oost, Raymond H. J. Staals, Ioannis Mougiakos
Opublikowane w: Communications Biology, Numer 6, 2023, Strona(/y) 1042, ISSN 2399-3642
Wydawca: Nature Springer
DOI: 10.1038/s42003-023-05418-5

The genome editing revolution

Autorzy: van der Oost, John; Patinios, Constantinos
Opublikowane w: Trends in Biotechnology, Numer 41(3), 2022, Strona(/y) 396 - 409, ISSN 0167-7799
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.tibtech.2022.12.022

Editor's cut: DNA cleavage by CRISPR RNA-guided nucleases Cas9 and Cas12a

Autorzy: Thomas Swartjes; Raymond H.J. Staals; John van der Oost
Opublikowane w: Biochemical Society Transactions, Numer 02646021, 2020, Strona(/y) 207–219, ISSN 0264-6021
Wydawca: Portland Press, Ltd.
DOI: 10.1042/bst20190563

Mechanistic and evolutionary insights into a type V-M CRISPR–Cas effector enzyme

Autorzy: Satoshi N. Omura, Ryoya Nakagawa, Christian Südfeld, Ricardo Villegas Warren, Wen Y. Wu, Hisato Hirano, Charlie Laffeber, Tsukasa Kusakizako, Yoshiaki Kise, Joyce H. G. Lebbink, Yuzuru Itoh, John van der Oost, Osamu Nureki
Opublikowane w: Nature Structural & Molecular Biology, Numer 30, 2023, Strona(/y) 1172-1182, ISSN 1545-9993
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41594-023-01042-3

A hyperthermoactive-Cas9 editing tool reveals the role of a unique arsenite methyltransferase in the arsenic resistance system of Thermus thermophilus HB27

Autorzy: Giovanni Gallo; Ioannis Mougiakos; Bianco M; Carbonaro M; Andrea Carpentieri; Illiano A; Piero Pucci; Simonetta Bartolucci; van der Oost J; Gabriella Fiorentino
Opublikowane w: mBio, Numer 21612129, 2021, Strona(/y) e02813-21, ISSN 2161-2129
Wydawca: American Society for Microbiology
DOI: 10.1101/2021.07.12.452139

(R)evolution-on-a-chip.

Autorzy: Bouzetos, Evgenios; Ganar, Ketan Ashok; Mastrobattista, Enrico; Deshpande, Siddharth; van der Oost, John; Afd Pharmaceutics; Pharmaceutics
Opublikowane w: Trends in Biotechnology, Numer 40/1, 2022, Strona(/y) 60-67, ISSN 0167-7799
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.tibtech.2021.04.009

Efficient Cas9-based genome editing of Rhodobacter sphaeroides for metabolic engineering

Autorzy: Ioannis Mougiakos; Enrico Orsi; Mohammad Rifqi Ghiffary; Mohammad Rifqi Ghiffary; Wilbert Post; Alberto De Maria; Alberto De Maria; Belén Adiego-Pérez; Servé W. M. Kengen; Ruud A. Weusthuis; John van der Oost
Opublikowane w: Microbial Cell Factories, Numer 18/1, 2019, ISSN 2076-2607
Wydawca: Springer Nature
DOI: 10.1186/s12934-019-1255-1

Cryo-EM structure of the transposon-associated TnpB enzyme

Autorzy: Ryoya Nakagawa, Hisato Hirano, Satoshi N. Omura, Suchita Nety, Soumya Kannan, Han Altae-Tran, Xiao Yao, Yuriko Sakaguchi, Takayuki Ohira, Wen Y. Wu, Hiroshi Nakayama, Yutaro Shuto, Tatsuki Tanaka, Fumiya K. Sano, Tsukasa Kusakizako, Yoshiaki Kise, Yuzuru Itoh, Naoshi Dohmae, John van der Oost, Tsutomu Suzuki, Feng Zhang, Osamu Nureki
Opublikowane w: Nature, Numer 616, 2023, Strona(/y) 390-397, ISSN 0028-0836
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-023-05933-9

The miniature CRISPR-Cas12m effector binds DNA to block transcription

Autorzy: Wen Y. Wu, Prarthana Mohanraju, Chunyu Liao, Belén Adiego-Pérez, Sjoerd C.A. Creutzburg, Kira S. Makarova, Karlijn Keessen, Timon A. Lindeboom, Tahseen S. Khan, Stijn Prinsen, Rob Joosten, Winston X. Yan, Anzhela Migur, Charlie Laffeber, David A. Scott, Joyce H.G. Lebbink, Eugene V. Koonin, Chase L. Beisel, John van der Oost
Opublikowane w: Molecular Cell, Numer 82, 2024, Strona(/y) 4487-4502.e7, ISSN 1097-2765
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2022.11.003

Streamlined CRISPR genome engineering in wild-type bacteria using SIBR-Cas.

Autorzy: Constantinos Patinios; Sjoerd C.A. Creutzburg; Adini Q Arifah; Belén Adiego-Pérez; Evans A Gyimah; Colin J. Ingham; Servé W. M. Kengen; John van der Oost; Raymond H.J. Staals
Opublikowane w: Nucleic acids research, Numer 49/19, 2021, Strona(/y) 11392-11404, ISSN 1362-4962
Wydawca: Oxford Academic
DOI: 10.1093/nar/gkab893

Non-peer reviewed articles (2)

First structural insights into CRISPR-Cas-guided DNA transposition

Autorzy: John van der Oost, Ioannis Mougiakos
Opublikowane w: Cell Research, Numer 30, 2023, Strona(/y) 193-194, ISSN 1001-0602
Wydawca: Kexue Chubaneshe/Science Press
DOI: 10.1038/s41422-020-0284-y

Compact but mighty: Biology and applications of type III-E CRISPR-Cas systems

Autorzy: Jurre A. Steens, John van der Oost, Raymond H.J. Staals
Opublikowane w: Molecular Cell, Numer 82, 2024, Strona(/y) 4405-4406, ISSN 1097-2765
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2022.11.007