The Quest of the Argonautes - from Myth to Reality

Informazioni relative al progetto

ARGO

ID dell’accordo di sovvenzione: 834279

DOI

10.3030/834279

Progetto chiuso

Data della firma CE 20 Giugno 2019

Data di avvio 1 Luglio 2019

Data di completamento 30 Giugno 2024

Finanziato da

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Costo totale

€ 2 177 157,50

Contributo UE

€ 2 177 157,50

Coordinato da

WAGENINGEN UNIVERSITY
Netherlands

CORDIS fornisce collegamenti ai risultati finali pubblici e alle pubblicazioni dei progetti ORIZZONTE.

I link ai risultati e alle pubblicazioni dei progetti del 7° PQ, così come i link ad alcuni tipi di risultati specifici come dataset e software, sono recuperati dinamicamente da .OpenAIRE .

Pubblicazioni

Peer reviewed articles (14)

Alternative functions of CRISPR–Cas systems in the evolutionary arms race

Autori: Prarthana Mohanraju, Chinmoy Saha, Peter van Baarlen, Rogier Louwen, Raymond H. J. Staals, John van der Oost
Pubblicato in: Nature Reviews Microbiology, Numero 20, 2022, Pagina/e 351-364, ISSN 1740-1526
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41579-021-00663-z

Growth-uncoupled isoprenoid synthesis in Rhodobacter sphaeroides

Autori: Enrico Orsi; Enrico Orsi; Ioannis Mougiakos; Wilbert Post; Jules Beekwilder; Marco Dompé; Gerrit Eggink; John van der Oost; Servé W. M. Kengen; Ruud A. Weusthuis
Pubblicato in: Biotechnology for biofuels, Numero 13/1, 2019, Pagina/e 123, ISSN 1754-6834
Editore: BioMed Central Ltd.
DOI: 10.1186/s13068-020-01765-1

Type III-B CRISPR-Cas cascade of proteolytic cleavages

Autori: Jurre A. Steens, Jack P. K. Bravo, Carl Raymund P. Salazar, Caglar Yildiz, Afonso M. Amieiro, Stephan Köstlbacher, Stijn H. P. Prinsen, Ane S. Andres, Constantinos Patinios, Andreas Bardis, Arjan Barendregt, Richard A. Scheltema, Thijs J. G. Ettema, John van der Oost, David W. Taylor, Raymond H. J. Staals
Pubblicato in: Science, Numero 383, 2024, Pagina/e 512-519, ISSN 0036-8075
Editore: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.adk0378

Modulating CRISPR-Cas Genome Editing Using Guide-Complementary DNA Oligonucleotides

Autori: Thomas Swartjes, Peng Shang, Dennis T.M. van den Berg, Tim Künne, Niels Geijsen, Stan J.J. Brouns, John van der Oost, Raymond H.J. Staals, Richard A. Notebaart
Pubblicato in: The CRISPR Journal, Numero 5, 2022, Pagina/e 571-585, ISSN 2573-1599
Editore: Mary Ann Liebert
DOI: 10.1089/crispr.2022.0011

Characterization of the AcrIIC1 anti‒CRISPR protein for Cas9‒based genome engineering in E. coli

Autori: Despoina Trasanidou, Ana Potocnik, Patrick Barendse, Prarthana Mohanraju, Evgenios Bouzetos, Efthymios Karpouzis, Amber Desmet, Richard van Kranenburg, John van der Oost, Raymond H. J. Staals, Ioannis Mougiakos
Pubblicato in: Communications Biology, Numero 6, 2023, Pagina/e 1042, ISSN 2399-3642
Editore: Nature Springer
DOI: 10.1038/s42003-023-05418-5

The genome editing revolution

Autori: van der Oost, John; Patinios, Constantinos
Pubblicato in: Trends in Biotechnology, Numero 41(3), 2022, Pagina/e 396 - 409, ISSN 0167-7799
Editore: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.tibtech.2022.12.022

Editor's cut: DNA cleavage by CRISPR RNA-guided nucleases Cas9 and Cas12a

Autori: Thomas Swartjes; Raymond H.J. Staals; John van der Oost
Pubblicato in: Biochemical Society Transactions, Numero 02646021, 2020, Pagina/e 207–219, ISSN 0264-6021
Editore: Portland Press, Ltd.
DOI: 10.1042/bst20190563

Mechanistic and evolutionary insights into a type V-M CRISPR–Cas effector enzyme

Autori: Satoshi N. Omura, Ryoya Nakagawa, Christian Südfeld, Ricardo Villegas Warren, Wen Y. Wu, Hisato Hirano, Charlie Laffeber, Tsukasa Kusakizako, Yoshiaki Kise, Joyce H. G. Lebbink, Yuzuru Itoh, John van der Oost, Osamu Nureki
Pubblicato in: Nature Structural & Molecular Biology, Numero 30, 2023, Pagina/e 1172-1182, ISSN 1545-9993
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41594-023-01042-3

A hyperthermoactive-Cas9 editing tool reveals the role of a unique arsenite methyltransferase in the arsenic resistance system of Thermus thermophilus HB27

Autori: Giovanni Gallo; Ioannis Mougiakos; Bianco M; Carbonaro M; Andrea Carpentieri; Illiano A; Piero Pucci; Simonetta Bartolucci; van der Oost J; Gabriella Fiorentino
Pubblicato in: mBio, Numero 21612129, 2021, Pagina/e e02813-21, ISSN 2161-2129
Editore: American Society for Microbiology
DOI: 10.1101/2021.07.12.452139

(R)evolution-on-a-chip.

Autori: Bouzetos, Evgenios; Ganar, Ketan Ashok; Mastrobattista, Enrico; Deshpande, Siddharth; van der Oost, John; Afd Pharmaceutics; Pharmaceutics
Pubblicato in: Trends in Biotechnology, Numero 40/1, 2022, Pagina/e 60-67, ISSN 0167-7799
Editore: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.tibtech.2021.04.009

Efficient Cas9-based genome editing of Rhodobacter sphaeroides for metabolic engineering

Autori: Ioannis Mougiakos; Enrico Orsi; Mohammad Rifqi Ghiffary; Mohammad Rifqi Ghiffary; Wilbert Post; Alberto De Maria; Alberto De Maria; Belén Adiego-Pérez; Servé W. M. Kengen; Ruud A. Weusthuis; John van der Oost
Pubblicato in: Microbial Cell Factories, Numero 18/1, 2019, ISSN 2076-2607
Editore: Springer Nature
DOI: 10.1186/s12934-019-1255-1

Cryo-EM structure of the transposon-associated TnpB enzyme

Autori: Ryoya Nakagawa, Hisato Hirano, Satoshi N. Omura, Suchita Nety, Soumya Kannan, Han Altae-Tran, Xiao Yao, Yuriko Sakaguchi, Takayuki Ohira, Wen Y. Wu, Hiroshi Nakayama, Yutaro Shuto, Tatsuki Tanaka, Fumiya K. Sano, Tsukasa Kusakizako, Yoshiaki Kise, Yuzuru Itoh, Naoshi Dohmae, John van der Oost, Tsutomu Suzuki, Feng Zhang, Osamu Nureki
Pubblicato in: Nature, Numero 616, 2023, Pagina/e 390-397, ISSN 0028-0836
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-023-05933-9

The miniature CRISPR-Cas12m effector binds DNA to block transcription

Autori: Wen Y. Wu, Prarthana Mohanraju, Chunyu Liao, Belén Adiego-Pérez, Sjoerd C.A. Creutzburg, Kira S. Makarova, Karlijn Keessen, Timon A. Lindeboom, Tahseen S. Khan, Stijn Prinsen, Rob Joosten, Winston X. Yan, Anzhela Migur, Charlie Laffeber, David A. Scott, Joyce H.G. Lebbink, Eugene V. Koonin, Chase L. Beisel, John van der Oost
Pubblicato in: Molecular Cell, Numero 82, 2024, Pagina/e 4487-4502.e7, ISSN 1097-2765
Editore: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2022.11.003

Streamlined CRISPR genome engineering in wild-type bacteria using SIBR-Cas.

Autori: Constantinos Patinios; Sjoerd C.A. Creutzburg; Adini Q Arifah; Belén Adiego-Pérez; Evans A Gyimah; Colin J. Ingham; Servé W. M. Kengen; John van der Oost; Raymond H.J. Staals
Pubblicato in: Nucleic acids research, Numero 49/19, 2021, Pagina/e 11392-11404, ISSN 1362-4962
Editore: Oxford Academic
DOI: 10.1093/nar/gkab893

Non-peer reviewed articles (2)

First structural insights into CRISPR-Cas-guided DNA transposition

Autori: John van der Oost, Ioannis Mougiakos
Pubblicato in: Cell Research, Numero 30, 2023, Pagina/e 193-194, ISSN 1001-0602
Editore: Kexue Chubaneshe/Science Press
DOI: 10.1038/s41422-020-0284-y

Compact but mighty: Biology and applications of type III-E CRISPR-Cas systems

Autori: Jurre A. Steens, John van der Oost, Raymond H.J. Staals
Pubblicato in: Molecular Cell, Numero 82, 2024, Pagina/e 4405-4406, ISSN 1097-2765
Editore: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2022.11.007