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Intra-tumoral heterogeneity in NRAS-driven metastatic melanoma

Descrizione del progetto

Comprendere la riprogrammazione multifase che causa il melanoma metastatico

Le metastasi del cancro sono responsabili del 90 % dei decessi dovuti a tumori. Nel processo metastatico avviene una riprogrammazione non genetica reversibile multifase, che consente alle cellule cancerogene di migrare, invadere e adattarsi attivamente ai microambienti mutevoli. Per comprendere il processo di metastasi occorrono metodologie in grado di studiare la riprogrammazione non genetica nel tempo e nello spazio con risoluzione a singola cellula. Il progetto INHuMAN, finanziato dall’UE, utilizzerà la profilazione e il tracciamento del lignaggio di singole cellule per eseguire un’analisi longitudinale della diversità e delle traiettorie degli stati cellulari del melanoma durante la disseminazione metastatica in un modello murino di melanoma clinicamente rilevante. La ricerca farà luce sulle reti di regolazione genica che sono alla base degli stati cellulari metastatici, allo scopo di individuare i target che contribuiscono alle fasi iniziali del processo metastatico.

Obiettivo

Metastasis is largely refractory to therapy and, thereby, responsible for 90% of cancer-related deaths. An incomplete view of the mechanisms that drive metastasis has been a major barrier to rational development of effective therapeutics and prognostic diagnostics for metastatic patients. There is increasing evidence that this multi-step process involves reversible non-genetic reprogramming events allowing cancer cells to acquire diverse phenotypic features needed to migrate, invade, intra/extra-vasate and actively adapt to the varying environment (stress) they encounter. Understanding metastasis therefore requires methodologies that capture the magnitude and dynamics of non-genetic reprogramming in 4D (space and time) at the single-cell resolution. The advent of reliable single-cell multi-Omics analytical tools allows the simultaneous profiling of single cell’s genome, epigenome and transcriptome. Integrating single-cell profiling with lineage tracing provides a robust framework for defining cell fate transitions, intermediate states and trajectory inference. The host lab has recently used such a powerful combination of approaches to study the cellular origin of melanoma, the early molecular events associated with initiation of the disease and to portray cell state dynamics during therapy response. I propose to exploit this know-how to perform a longitudinal and exhaustive analysis of the diversity and trajectories of melanoma cell states during metastatic dissemination using a clinically-relevant mouse model of melanoma, a disease with a very high metastatic propensity. The gene regulatory networks underlying the identified metastatic cell states will be deciphered and the data exploited to develop therapeutic modalities targeting (amenable) drivers of state switching that contribute to early key steps of the metastatic process. The project is expected to lead to new avenues for early detection and interception of metastatic melanoma.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.

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Meccanismo di finanziamento

MSCA-IF-EF-ST -

Coordinatore

VIB VZW
Contributo netto dell'UE
€ 166 320,00
Indirizzo
SUZANNE TASSIERSTRAAT 1
9052 ZWIJNAARDE - GENT
Belgio

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Regione
Vlaams Gewest Prov. Oost-Vlaanderen Arr. Gent
Tipo di attività
Organizzazioni di ricerca
Collegamenti
Costo totale
€ 166 320,00