Biomarker discovery by AI-guided, image based single-cell isolation proteomics

Información del proyecto

Visual Proteomics

Identificador del acuerdo de subvención: 846795

DOI

10.3030/846795

Proyecto cerrado

Fecha de la firma de la CE 26 Marzo 2019

Fecha de inicio 1 Abril 2019

Fecha de finalización 31 Marzo 2021

Financiado con arreglo a

• EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions

Coste total

€ 207 312,00

Aportación de la UE

€ 207 312,00

Coordinado por

KOBENHAVNS UNIVERSITET
Denmark

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Publicaciones

Other (4)

Ultra-high sensitivity mass spectrometry quantifies single-cell proteome changes upon perturbation

Autores: Andreas-David Brunner, Marvin Thielert, Catherine G. Vasilopoulou, Constantin Ammar, Fabian Coscia, Andreas Mund, Ole B. Hoerning, Nicolai Bache, Amalia Apalategui, Markus Lubeck, Sabrina Richter, David S. Fischer, Oliver Raether, Melvin A. Park, Florian Meier, Fabian J. Theis, Matthias Mann
Publicado en: bioRxiv, 2020
Editor: bioRxiv
DOI: 10.1101/2020.12.22.423933

Large scale discovery of coronavirus-host factor protein interaction motifs reveals SARS-CoV-2 specific mechanisms and vulnerabilities

Autores: Thomas Kruse, Caroline Benz, Dimitriya H. Garvanska, Richard Lindqvist, Filip Mihalic, Fabian Coscia, Ravi Teja Inturi, Ahmed Sayadi, VLeandro Simonetti, Emma Nilsson, Muhammad Ali, Johanna Kliche, Ainhoa Moliner Morro, Andreas Mund, Eva Andersson, Gerald McInerney, Matthias Mann, Per Jemth, Norman E Davey, Anna K Överby, Jakob Nilsson, Ylva Ivarsson
Publicado en: bioRxiv, 2021
Editor: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2021.04.19.440086

Clinical Knowledge Graph Integrates Proteomics Data into Clinical Decision-Making

Autores: Philipp E. Geyer; Alberto Santos; Lars Juhl Jensen; Ana R. Colaço; Filip Mundt; Annelaura Bach Nielsen; Nicolai J. Wewer Albrechtsen; Fabian Coscia; Lili Niu; Matthias Mann
Publicado en: bioRxiv, Edición 1, 2020
Editor: bioRxiv
DOI: 10.1101/2020.05.09.084897

AI-driven Deep Visual Proteomics defines cell identity and heterogeneity

Autores: Andreas Mund, Fabian Coscia, Réka Hollandi, Ferenc Kovács, András Kriston, Andreas-David Brunner, Michael Bzorek, Soraya Naimy, Lise Mette Rahbek Gjerdrum, Beatrice Dyring-Andersen, Jutta Bulkescher, Claudia Lukas, Christian Gnann, Emma Lundberg, Peter Horvath, Matthias Mann
Publicado en: bioRxiv, 2021
Editor: bioRxiv
DOI: 10.1101/2021.01.25.427969

Peer reviewed articles (3)

Spatially and cell-type resolved quantitative proteomic atlas of healthy human skin

Autores: Beatrice Dyring-Andersen, Marianne Bengtson Løvendorf, Fabian Coscia, Alberto Santos, Line Bruun Pilgaard Møller, Ana R. Colaço, Lili Niu, Michael Bzorek, Sophia Doll, Jørgen Lock Andersen, Rachael A. Clark, Lone Skov, Marcel B. M. Teunissen, Matthias Mann
Publicado en: Nature Communications, Edición 11/1, 2020, ISSN 2041-1723
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-020-19383-8

A streamlined mass spectrometry–based proteomics workflow for large‐scale FFPE tissue analysis

Autores: Fabian Coscia, Sophia Doll, Jacob Mathias Bech, Lisa Schweizer, Andreas Mund, Ernst Lengyel, Jan Lindebjerg, Gunvor Iben Madsen, José MA Moreira, Matthias Mann
Publicado en: The Journal of Pathology, Edición 251/1, 2020, Página(s) 100-112, ISSN 0022-3417
Editor: John Wiley & Sons Inc.
DOI: 10.1002/path.5420

Homology-directed repair protects the replicating genome from metabolic assaults

Autores: Somyajit, Kumar; Spies, Julian; Coscia, Fabian; Kirik, Ufuk; Rask, Maj-Britt; Lee, Ji-Hoon; Neelsen, Kai John; Mund, Andreas; Jensen, Lars Juhl; Paull, Tanya T; Mann, Matthias; Lukas, Jiri.
Publicado en: Developmental Cell, 2021, ISSN 1534-5807
Editor: Cell Press
DOI: 10.1016/j.devcel.2021.01.011