Biomarker discovery by AI-guided, image based single-cell isolation proteomics

Informacje na temat projektu

Visual Proteomics

Identyfikator umowy o grant: 846795

DOI

10.3030/846795

Projekt został zamknięty

Data podpisania przez KE 26 Marca 2019

Data rozpoczęcia 1 Kwietnia 2019

Data zakończenia 31 Marca 2021

Finansowanie w ramach

• EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions

Koszt całkowity

€ 207 312,00

Wkład UE

€ 207 312,00

Koordynowany przez

KOBENHAVNS UNIVERSITET
Denmark

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Publikacje

Other (4)

Ultra-high sensitivity mass spectrometry quantifies single-cell proteome changes upon perturbation

Autorzy: Andreas-David Brunner, Marvin Thielert, Catherine G. Vasilopoulou, Constantin Ammar, Fabian Coscia, Andreas Mund, Ole B. Hoerning, Nicolai Bache, Amalia Apalategui, Markus Lubeck, Sabrina Richter, David S. Fischer, Oliver Raether, Melvin A. Park, Florian Meier, Fabian J. Theis, Matthias Mann
Opublikowane w: bioRxiv, 2020
Wydawca: bioRxiv
DOI: 10.1101/2020.12.22.423933

Large scale discovery of coronavirus-host factor protein interaction motifs reveals SARS-CoV-2 specific mechanisms and vulnerabilities

Autorzy: Thomas Kruse, Caroline Benz, Dimitriya H. Garvanska, Richard Lindqvist, Filip Mihalic, Fabian Coscia, Ravi Teja Inturi, Ahmed Sayadi, VLeandro Simonetti, Emma Nilsson, Muhammad Ali, Johanna Kliche, Ainhoa Moliner Morro, Andreas Mund, Eva Andersson, Gerald McInerney, Matthias Mann, Per Jemth, Norman E Davey, Anna K Överby, Jakob Nilsson, Ylva Ivarsson
Opublikowane w: bioRxiv, 2021
Wydawca: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2021.04.19.440086

Clinical Knowledge Graph Integrates Proteomics Data into Clinical Decision-Making

Autorzy: Philipp E. Geyer; Alberto Santos; Lars Juhl Jensen; Ana R. Colaço; Filip Mundt; Annelaura Bach Nielsen; Nicolai J. Wewer Albrechtsen; Fabian Coscia; Lili Niu; Matthias Mann
Opublikowane w: bioRxiv, Numer 1, 2020
Wydawca: bioRxiv
DOI: 10.1101/2020.05.09.084897

AI-driven Deep Visual Proteomics defines cell identity and heterogeneity

Autorzy: Andreas Mund, Fabian Coscia, Réka Hollandi, Ferenc Kovács, András Kriston, Andreas-David Brunner, Michael Bzorek, Soraya Naimy, Lise Mette Rahbek Gjerdrum, Beatrice Dyring-Andersen, Jutta Bulkescher, Claudia Lukas, Christian Gnann, Emma Lundberg, Peter Horvath, Matthias Mann
Opublikowane w: bioRxiv, 2021
Wydawca: bioRxiv
DOI: 10.1101/2021.01.25.427969

Peer reviewed articles (3)

Spatially and cell-type resolved quantitative proteomic atlas of healthy human skin

Autorzy: Beatrice Dyring-Andersen, Marianne Bengtson Løvendorf, Fabian Coscia, Alberto Santos, Line Bruun Pilgaard Møller, Ana R. Colaço, Lili Niu, Michael Bzorek, Sophia Doll, Jørgen Lock Andersen, Rachael A. Clark, Lone Skov, Marcel B. M. Teunissen, Matthias Mann
Opublikowane w: Nature Communications, Numer 11/1, 2020, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-020-19383-8

A streamlined mass spectrometry–based proteomics workflow for large‐scale FFPE tissue analysis

Autorzy: Fabian Coscia, Sophia Doll, Jacob Mathias Bech, Lisa Schweizer, Andreas Mund, Ernst Lengyel, Jan Lindebjerg, Gunvor Iben Madsen, José MA Moreira, Matthias Mann
Opublikowane w: The Journal of Pathology, Numer 251/1, 2020, Strona(/y) 100-112, ISSN 0022-3417
Wydawca: John Wiley & Sons Inc.
DOI: 10.1002/path.5420

Homology-directed repair protects the replicating genome from metabolic assaults

Autorzy: Somyajit, Kumar; Spies, Julian; Coscia, Fabian; Kirik, Ufuk; Rask, Maj-Britt; Lee, Ji-Hoon; Neelsen, Kai John; Mund, Andreas; Jensen, Lars Juhl; Paull, Tanya T; Mann, Matthias; Lukas, Jiri.
Opublikowane w: Developmental Cell, 2021, ISSN 1534-5807
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.devcel.2021.01.011