Biomarker discovery by AI-guided, image based single-cell isolation proteomics

Informazioni relative al progetto

Visual Proteomics

ID dell’accordo di sovvenzione: 846795

DOI

10.3030/846795

Progetto chiuso

Data della firma CE 26 Marzo 2019

Data di avvio 1 Aprile 2019

Data di completamento 31 Marzo 2021

Finanziato da

• EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions

Costo totale

€ 207 312,00

Contributo UE

€ 207 312,00

Coordinato da

KOBENHAVNS UNIVERSITET
Denmark

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I link ai risultati e alle pubblicazioni dei progetti del 7° PQ, così come i link ad alcuni tipi di risultati specifici come dataset e software, sono recuperati dinamicamente da .OpenAIRE .

Pubblicazioni

Other (4)

Ultra-high sensitivity mass spectrometry quantifies single-cell proteome changes upon perturbation

Autori: Andreas-David Brunner, Marvin Thielert, Catherine G. Vasilopoulou, Constantin Ammar, Fabian Coscia, Andreas Mund, Ole B. Hoerning, Nicolai Bache, Amalia Apalategui, Markus Lubeck, Sabrina Richter, David S. Fischer, Oliver Raether, Melvin A. Park, Florian Meier, Fabian J. Theis, Matthias Mann
Pubblicato in: bioRxiv, 2020
Editore: bioRxiv
DOI: 10.1101/2020.12.22.423933

Large scale discovery of coronavirus-host factor protein interaction motifs reveals SARS-CoV-2 specific mechanisms and vulnerabilities

Autori: Thomas Kruse, Caroline Benz, Dimitriya H. Garvanska, Richard Lindqvist, Filip Mihalic, Fabian Coscia, Ravi Teja Inturi, Ahmed Sayadi, VLeandro Simonetti, Emma Nilsson, Muhammad Ali, Johanna Kliche, Ainhoa Moliner Morro, Andreas Mund, Eva Andersson, Gerald McInerney, Matthias Mann, Per Jemth, Norman E Davey, Anna K Överby, Jakob Nilsson, Ylva Ivarsson
Pubblicato in: bioRxiv, 2021
Editore: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2021.04.19.440086

Clinical Knowledge Graph Integrates Proteomics Data into Clinical Decision-Making

Autori: Philipp E. Geyer; Alberto Santos; Lars Juhl Jensen; Ana R. Colaço; Filip Mundt; Annelaura Bach Nielsen; Nicolai J. Wewer Albrechtsen; Fabian Coscia; Lili Niu; Matthias Mann
Pubblicato in: bioRxiv, Numero 1, 2020
Editore: bioRxiv
DOI: 10.1101/2020.05.09.084897

AI-driven Deep Visual Proteomics defines cell identity and heterogeneity

Autori: Andreas Mund, Fabian Coscia, Réka Hollandi, Ferenc Kovács, András Kriston, Andreas-David Brunner, Michael Bzorek, Soraya Naimy, Lise Mette Rahbek Gjerdrum, Beatrice Dyring-Andersen, Jutta Bulkescher, Claudia Lukas, Christian Gnann, Emma Lundberg, Peter Horvath, Matthias Mann
Pubblicato in: bioRxiv, 2021
Editore: bioRxiv
DOI: 10.1101/2021.01.25.427969

Peer reviewed articles (3)

Spatially and cell-type resolved quantitative proteomic atlas of healthy human skin

Autori: Beatrice Dyring-Andersen, Marianne Bengtson Løvendorf, Fabian Coscia, Alberto Santos, Line Bruun Pilgaard Møller, Ana R. Colaço, Lili Niu, Michael Bzorek, Sophia Doll, Jørgen Lock Andersen, Rachael A. Clark, Lone Skov, Marcel B. M. Teunissen, Matthias Mann
Pubblicato in: Nature Communications, Numero 11/1, 2020, ISSN 2041-1723
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-020-19383-8

A streamlined mass spectrometry–based proteomics workflow for large‐scale FFPE tissue analysis

Autori: Fabian Coscia, Sophia Doll, Jacob Mathias Bech, Lisa Schweizer, Andreas Mund, Ernst Lengyel, Jan Lindebjerg, Gunvor Iben Madsen, José MA Moreira, Matthias Mann
Pubblicato in: The Journal of Pathology, Numero 251/1, 2020, Pagina/e 100-112, ISSN 0022-3417
Editore: John Wiley & Sons Inc.
DOI: 10.1002/path.5420

Homology-directed repair protects the replicating genome from metabolic assaults

Autori: Somyajit, Kumar; Spies, Julian; Coscia, Fabian; Kirik, Ufuk; Rask, Maj-Britt; Lee, Ji-Hoon; Neelsen, Kai John; Mund, Andreas; Jensen, Lars Juhl; Paull, Tanya T; Mann, Matthias; Lukas, Jiri.
Pubblicato in: Developmental Cell, 2021, ISSN 1534-5807
Editore: Cell Press
DOI: 10.1016/j.devcel.2021.01.011