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Nucleolar Responses to DNA Damage: rDNA, an emerging hub of genome instability

Projektbeschreibung

Spezifische Genombereiche als Hotspots der Krebszelltransformation

Die Desoxyribonukleinsäure, kurz DNS, ist ein Makromolekül, das unsere genetische Informationen enthält und das ständig angegriffen wird, woraus DNS-Schäden resultieren. Werden diese Schäden nicht repariert, sind zahlreiche Krankheiten die Folge, wobei Krebs die prominenteste sein dürfte. Bestimmte DNS-Merkmale, darunter Sequenzwiederholungen und die räumliche Organisation, können dazu führen, dass die DNS anfälliger für Schäden oder schwieriger zu reparieren ist. Die ribosomale DNS (rDNS) ist vor allem für die Kodierung der ribosomalen RNS bekannt, einem für die Proteinsynthese wichtigen Molekül. Durch spezielle Eigenschaften der rDNS einschließlich hoher rRNS-Erzeugungsraten, ihrer repetitiven Natur und Ausbreitung in verschiedene Chromosomen können rDNS-Repeats einen Hotspot der Krebszelltransformation darstellen. Das EU-finanzierte Projekt NUCDDR wendet diese Hypothese an und untersucht rDNS-Schäden, Reparaturmechanismen und die potenzielle Korrelation zwischen rDNS-Schäden und Krebs.

Ziel

DNA lesions can impose serious threats to genome integrity and cell viability. Whereas DNA damage may occur anywhere in the genome, it is increasingly recognized that certain genomic loci rich in repetitive sequences display increased susceptibility to damage and are linked to chromosomal rearrangements and malignancy. Clusters of ribosomal DNA gene (rDNA) repeats, present on five different chromosomes, constitute the most heavily transcribed area of the human genome and are organized in a nuclear membrane-less organelle, the nucleolus. So far, putative links between rDNA damage and malignant processes have not been rigorously assessed.
We will address the hypothesis that rDNA repeats represent a major hub of genomic instability contributing to malignant transformation. Using state-of-the-art experimental systems that allow enrichment for nucleolar DNA damage, we will explore: (i) hypothesis-driven and mass spectrometry-based approaches to define regulators of the rDNA damage response; (ii) live imaging and advanced molecular biology tools to uncover how histone epigenetic changes and formation of RNA:DNA hybrids impact on nucleolar chromatin, nucleolar organization, rDNA transcription and repair ; (iii) cell models that recapitulate malignant transformation caused by inducible oncogene expression or epigenetic inactivation of tumour suppressors, to assess replication stress in rDNA repeats as a primary source of genomic instability and pertinent to hallmarks of cancer.
The proposed research is expected to yield novel insights into the signaling networks and biological processes regulating rDNA damage and repair within the nuclear environment and define how these mechanisms are corrupted during neoplastic transformation. This knowledge could be directly applicable to the design of new diagnostic or therapeutic strategies for cancer.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

Schlüsselbegriffe

Programm/Programme

Thema/Themen

Finanzierungsplan

ERC-STG - Starting Grant

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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

(öffnet in neuem Fenster) ERC-2019-STG

Alle im Rahmen dieser Aufforderung zur Einreichung von Vorschlägen finanzierten Projekte anzeigen

Gastgebende Einrichtung

PANEPISTIMIO PATRON
Netto-EU-Beitrag
€ 1 499 525,00
Adresse
UNIVERSITY CAMPUS RIO PATRAS
265 04 RIO PATRAS
Griechenland
Region
Κεντρική Ελλάδα Δυτική Ελλάδα Αχαΐα
Aktivitätstyp
Higher or Secondary Education Establishments
Links
Gesamtkosten
€ 1 499 525,00

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