Opis projektu
Określone obszary genomu punktami transformacji nowotworowej
DNA to makrocząsteczka zawierająca nasze informacje genetyczne, będąca obiektem ciągłych ataków, skutkujących jej uszkodzeniem. Nienaprawienie uszkodzenia wiąże się z licznymi chorobami, z których najpoważniejszą jest nowotwór. Niektóre cechy DNA, w tym powtarzanie sekwencji i organizacja przestrzenna, sprawiają, że jest ono bardziej podatne na uszkodzenia lub trudniejsze do naprawy. DNA rybosomalne (rDNA) jest znane głównie z kodowania rybosomalnego RNA, cząsteczki niezbędnej dla syntezy białka. Specjalne cechy rDNA, w tym wysoki współczynnik generowania rRNA, powtarzalny charakter oraz podział na różne chromosomy, mogą sprawić, że powtarzalne sekwencje rDNA staną się punktami transformacji nowotworowej. Celem finansowanego ze środków UE projektu NUCDDR jest zbadanie tej hipotezy, a także przeanalizowanie uszkodzenia rDNA, mechanizmów naprawy oraz potencjalnych korelacji pomiędzy uszkodzeniem rDNA a nowotworem.
Cel
DNA lesions can impose serious threats to genome integrity and cell viability. Whereas DNA damage may occur anywhere in the genome, it is increasingly recognized that certain genomic loci rich in repetitive sequences display increased susceptibility to damage and are linked to chromosomal rearrangements and malignancy. Clusters of ribosomal DNA gene (rDNA) repeats, present on five different chromosomes, constitute the most heavily transcribed area of the human genome and are organized in a nuclear membrane-less organelle, the nucleolus. So far, putative links between rDNA damage and malignant processes have not been rigorously assessed.
We will address the hypothesis that rDNA repeats represent a major hub of genomic instability contributing to malignant transformation. Using state-of-the-art experimental systems that allow enrichment for nucleolar DNA damage, we will explore: (i) hypothesis-driven and mass spectrometry-based approaches to define regulators of the rDNA damage response; (ii) live imaging and advanced molecular biology tools to uncover how histone epigenetic changes and formation of RNA:DNA hybrids impact on nucleolar chromatin, nucleolar organization, rDNA transcription and repair ; (iii) cell models that recapitulate malignant transformation caused by inducible oncogene expression or epigenetic inactivation of tumour suppressors, to assess replication stress in rDNA repeats as a primary source of genomic instability and pertinent to hallmarks of cancer.
The proposed research is expected to yield novel insights into the signaling networks and biological processes regulating rDNA damage and repair within the nuclear environment and define how these mechanisms are corrupted during neoplastic transformation. This knowledge could be directly applicable to the design of new diagnostic or therapeutic strategies for cancer.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego.
- nauki przyrodniczenauki biologicznegenetykaDNA
- medycyna i nauki o zdrowiumedycyna klinicznaonkologia
- nauki przyrodniczenauki biologicznegenetykachromosomy
- nauki przyrodniczenauki biologicznegenetykagenom
- nauki przyrodniczenauki biologicznebiologia molekularna
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Słowa kluczowe
Program(-y)
Temat(-y)
System finansowania
ERC-STG - Starting GrantInstytucja przyjmująca
265 04 Rio Patras
Grecja