Using cell-cell interactions to unlock new cancer treatments: Forcing neural crest tumors back onto the developmental path

Projektinformationen

KILL-OR-DIFFERENTIAT

ID Finanzhilfevereinbarung: 856529

DOI

10.3030/856529

EK-Unterschriftsdatum 27 Mai 2020

Startdatum 1 Oktober 2020

Enddatum 31 Januar 2027

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten

€ 9 377 151,00

EU-Beitrag

€ 9 377 151,00

Koordiniert durch

MEDIZINISCHE UNIVERSITAET WIEN
Austria

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Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (19)

Evolutionary switch in expression of key markers between mouse and human leads to mis-assignment of cell types in developing adrenal medulla.

Autoren: Kameneva P, V Artemov A, Kastriti, Sundström E, Kharchenko PV, Adameyko I.
Veröffentlicht in: Cancer Cell, 2021, ISSN 1535-6108
Herausgeber: Cell Press

scFates: a scalable python package for advanced pseudotime and bifurcation analysis from single-cell data

Autoren: Louis Faure, Ruslan Soldatov, Peter V Kharchenko, Igor Adameyko
Veröffentlicht in: Bioinformatics, 2023, ISSN 1367-4803
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/bioinformatics/btac746

Expression and activation of nuclear hormone receptors result in neuronal differentiation and favorable prognosis in neuroblastoma

Autoren: Lourdes Sainero-Alcolado, Muhammad Mushtaq, Judit Liaño-Pons, Aida Rodriguez-Garcia, Ye Yuan, Tong Liu, María Victoria Ruiz-Pérez, Susanne Schlisio, Oscar Bedoya-Reina, Marie Arsenian-Henriksson
Veröffentlicht in: Journal of Experimental & Clinical Cancer Research, Ausgabe 41, 2023, ISSN 1756-9966
Herausgeber: Nature Publishing House
DOI: 10.1186/s13046-022-02399-x

Boosting multiplexing capabilities for error-robust spatial transcriptomic methods using a set exchange approach

Autoren: Johan Boström, Michaɫ Zapaɫa, Igor Adameyko
Veröffentlicht in: Science Advances, Ausgabe 11, 2025, ISSN 2375-2548
Herausgeber: American Association for the Advancement of Science (AAAS)
DOI: 10.1126/sciadv.adr4026

Aberrant splicing in neuroblastoma generates RNA-fusion transcripts and provides vulnerability to spliceosome inhibitors.

Autoren: Shi Y, Yuan J, Rraklli V, Maxymovitz E, Cipullo M, Liu M, Li S, Westerlund I, Bedoya-Reina, Bullova P, Rorbach J, Juhlin CC, Stenman A, Larsson C, Kogner P, O'Sullivan MJ, Schlisio S, Holmberg J.
Veröffentlicht in: Nucleic Acids Research, 2022, ISSN 1362-4962
Herausgeber: Oxford Academic

Reversible transitions between noradrenergic and mesenchymal tumor identities define cell plasticity in neuroblastoma

Autoren: Cécile Thirant, Agathe Peltier, Simon Durand, Amira Kramdi, Caroline Louis-Brennetot, Cécile Pierre-Eugène, Margot Gautier, Ana Costa, Amandine Grelier, Sakina Zaïdi, Nadège Gruel, Irène Jimenez, Eve Lapouble, Gaëlle Pierron, Déborah Sitbon, Hervé J. Brisse, Arnaud Gauthier, Paul Fréneaux, Sandrine Grossetête, Laura G. Baudrin, Virginie Raynal, Sylvain Baulande, Angela Bellini, Jaydutt
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 14, 2023, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-38239-5

A pan-tissue survey of mosaic chromosomal alterations in 948 individuals

Autoren: Teng Gao, Maria Eleni Kastriti, Viktor Ljungström, Andreas Heinzel, Arthur S. Tischler, Rainer Oberbauer, Po-Ru Loh, Igor Adameyko, Peter J. Park & Peter V. Kharchenko
Veröffentlicht in: Nature Genetics, 2023, ISSN 1061-4036
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41588-023-01537-1

Schwann cell precursors represent a neural crest-like state with biased multipotency

Autoren: Maria Eleni Kastriti Louis Faure Dorothea Von Ahsen Thibault Gerald Bouderlique Johan Boström Tatiana Solovieva Cameron Jackson Marianne Bronner Dies Meijer Saida Hadjab Francois Lallemend Alek Erick
Veröffentlicht in: EMBO Journal, 2022, ISSN 0261-4189
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.15252/embj.2021108780

Chromaffin Cells with Sympathoblast Signature: Too Similar to Keep Apart?

Autoren: Bedoya-Reina, Schlisio S.
Veröffentlicht in: Cancer Cell, 2021, ISSN 1535-6108
Herausgeber: Cell Press

Serotonin limits generation of chromaffin cells during adrenal organ development

Autoren: Polina Kameneva, Victoria I. Melnikova, Maria Eleni Kastriti, Anastasia Kurtova, Emil Kryukov, Aliia Murtazina, Louis Faure, Irina Poverennaya, Artem V. Artemov, Tatiana S. Kalinina, Nikita V. Kudryashov, Michael Bader, Jan Skoda, Petr Chlapek, Lucie Curylova, Lukas Sourada, Jakub Neradil, Marketa Tesarova, Massimo Pasqualetti, Patricia Gaspar, Vasily D. Yakushov, Boris I. Sheftel, Tomas Zikmund,
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 20411723, 2022, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-022-30438-w

Theory of branching morphogenesis by local interactions and global guidance

Autoren: Uçar MC, Kamenev D, Sunadome K, Fachet D, Lallemend F, Adameyko, Hadjab S, Hannezo E.
Veröffentlicht in: Nature Communications, 2021, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group

The transcriptional portraits of the neural crest at the individual cell level.

Autoren: Erickson AG, Kameneva P, Adameyko
Veröffentlicht in: Seminars in Cell & Developmental Biology, 2022, ISSN 1084-9521
Herausgeber: Academic Press

Joint single-cell genetic and transcriptomic analysis reveal pre-malignant SCP-like subclones in human neuroblastoma

Autoren: Thale K. Olsen, Jörg Otte, Shenglin Mei, Bethel Tesfai Embaie, Polina Kameneva, Huaitao Cheng, Teng Gao, Vasilios Zachariadis, Ioanna Tsea, Åsa Björklund, Emil Kryukov, Ziyi Hou, Anna Johansson, Erik Sundström, Tommy Martinsson, Susanne Fransson, Jakob Stenman, Shahrzad Shirazi Fard, John Inge Johnsen, Per Kogner, Igor Adameyko, Martin Enge, Peter V. Kharchenko, Ninib Baryawno
Veröffentlicht in: Molecular Cancer, Ausgabe 23, 2024, ISSN 1476-4598
Herausgeber: BioMed Central
DOI: 10.1186/s12943-024-02091-y

Single-cell transcriptomics of human embryos identifies multiple sympathoblast lineages with potential implications for neuroblastoma origin.

Autoren: Kameneva P, Artemov AV, Kastriti, Faure L, Olsen TK, Otte J, Erickson A, Semsch B, Andersson ER, Ratz M, Frisén J, Tischler AS, de Krijger RR, Bouderlique T, Akkuratova N, Vorontsova M, Gusev O, Fried K, Sundström E, Mei S, Kogner P, Baryawno N, Kharchenko PV, Adameyko I.
Veröffentlicht in: Nature Genetics, 2021, ISSN 1061-4036
Herausgeber: Nature Publishing Group

Nerve-associated Schwann cell precursors contribute extracutaneous melanocytes to the heart, inner ear, supraorbital locations and brain meninges.

Autoren: Kaucka M, Szarowska B, Kavkova M, Kastriti, Kameneva P, Schmidt I, Peskova L, Joven Araus A, Simon A, Kaiser J, Adameyko I.
Veröffentlicht in: Cellular Molecular Life Sciences, 2021, ISSN 1420-682X
Herausgeber: Birkhauser Verlag

Motor innervation directs the correct development of the mouse sympathetic nervous system

Autoren: Alek G. Erickson, Alessia Motta, Maria Eleni Kastriti, Steven Edwards, Fanny Coulpier, Emy Théoulle, Aliia Murtazina, Irina Poverennaya, Daniel Wies, Jeremy Ganofsky, Giovanni Canu, Francois Lallemend, Piotr Topilko, Saida Hadjab, Kaj Fried, Christiana Ruhrberg, Quenten Schwarz, Valerie Castellani, Dario Bonanomi, Igor Adameyko
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 15, 2024, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-51290-0

Haplotype-aware analysis of somatic copy number variations from single-cell transcriptomes

Autoren: Teng Gao, Ruslan Soldatov, Hirak Sarkar, Adam Kurkiewicz, Evan Biederstedt, Po-Ru Loh, Peter V Kharchenko
Veröffentlicht in: Nature Biotechnology, Ausgabe 10870156, 2022, ISSN 1087-0156
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41587-022-01468-y

Human enteric nervous system progenitor transplantation improves functional responses in Hirschsprung disease patient-derived tissue

Autoren: Benjamin Jevans, Fay Cooper, Yuliia Fatieieva, Antigoni Gogolou, Yi-Ning Kang, Restuadi Restuadi, Dale Moulding, Pieter Vanden Berghe, Igor Adameyko, Nikhil Thapar, Peter W Andrews, Paolo De Coppi, Anestis Tsakiridis, Conor J McCann
Veröffentlicht in: Gut, Ausgabe 73, 2024, Seite(n) 1441-1453, ISSN 0017-5749
Herausgeber: BMJ Publishing Group
DOI: 10.1136/gutjnl-2023-331532

Single-nuclei transcriptomes from human adrenal gland reveal distinct cellular identities of low and high-risk neuroblastoma tumors.

Autoren: Bedoya-Reina OC, Li W, Arceo M, Plescher M, Bullova P, Pui H, Kaucka M, Kharchenko P, Martinsson T, Holmberg J, Adameyko, Deng Q, Larsson C, Juhlin CC, Kogner P, Schlisio S.
Veröffentlicht in: Nature Communications, 2021, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group

Non-peer reviewed articles (1)

Single-cell transcriptomics reveals shared immunosuppressive landscapes of mouse and human neuroblastoma

Autoren: Ana Costa, Cécile Thirant, Amira Kramdi, Cécile Pierre-Eugène, Caroline Louis-Brennetot, Orphée Blanchard, Didier Surdez, Nadege Gruel, Eve Lapouble, Gaëlle Pierron, Deborah Sitbon, Hervé Brisse
Veröffentlicht in: J Immunother Cancer, 2022, ISSN 2051-1426
Herausgeber: Society for Immunotherapy of Cancer
DOI: 10.1136/jitc-2022-004807