What makes a successfull pathogen? Understanding the impact of cell-to-cell heterogeneity in chromatin structure on infection and adaptation

Informations projet

Cell2Cell

N° de convention de subvention: 860675

DOI

10.3030/860675

Projet clôturé

Date de signature de la CE 11 Septembre 2019

Date de début 1 Novembre 2019

Date de fin 30 Avril 2024

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions

Coût total

€ 3 832 859,30

Contribution de l’UE

€ 3 832 859,30

Coordonné par

LUDWIG-MAXIMILIANS-UNIVERSITAET MUENCHEN
Germany

CORDIS fournit des liens vers les livrables publics et les publications des projets HORIZON.

Les liens vers les livrables et les publications des projets du 7e PC, ainsi que les liens vers certains types de résultats spécifiques tels que les jeux de données et les logiciels, sont récupérés dynamiquement sur OpenAIRE .

Livrables

Other (6)

Potential inputs for Policy feedback

Consortium should include any relevant information, results, activities who could contribute to any policy development in their domain. This information could then be used for policy feedback purposes.

Summer school (Spetses)

Summer school with invited speakers held

Information flyer complete

Flyer information and design completed

Network logo designed

Cooperate image designed

Public Engagement progress review

Public Engagement progress review completed

Final conference / Career Day (Munich)

Final conference with invited speakers, modules in imaging (module 4: Microfluidics), NGS (ATAC-seq & ChIP-seq), Data Analysis (module 5: review of key aspects) and Career Day

Websites, patent fillings, videos etc. (1)

Website online

Cell2Cell network website design completed and online

Publications

Peer reviewed articles (9)

The molecular grammar of protein disorder guiding genome-binding locations

Auteurs: Felix Jonas, Miri Carmi, Beniamin Krupkin, Joseph Steinberger, Sagie Brodsky, Tamar Jana, Naama Barkai
Publié dans: Nucleic Acids Research, Numéro Vol. 51, Numéro 10, 2023, Page(s) 4831-4844, ISSN 0305-1048
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkad184

Cell-to-Cell Heterogeneity in Trypanosomes

Auteurs: Vanessa Luzak, Lara López-Escobar, T. Nicolai Siegel, Luisa M. Figueiredo
Publié dans: Annual Review of Microbiology, Numéro 75/1, 2021, Page(s) 107-128, ISSN 0066-4227
Éditeur: Annual Reviews, Inc.
DOI: 10.1146/annurev-micro-040821-012953

The inner nuclear membrane protein Lem2 coordinates RNA degradation at the nuclear periphery

Auteurs: Lucía Martín Caballero, Matías Capella, Ramón Ramos Barrales, Nikolay Dobrev, Thomas van Emden, Yasuhiro Hirano, Vishnu N. Suma Sreechakram, Sabine Fischer-Burkart, Yasuha Kinugasa, Alicia Nevers, Mathieu Rougemaille, Irmgard Sinning, Tamás Fischer, Yasushi Hiraoka & Sigurd Braun
Publié dans: Nature Structural & Molecular Biology, Numéro Vol. 29, 2022, Page(s) 910-921, ISSN 1545-9993
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41594-022-00831-6

The 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1 is an essential upstream activator of protein kinase A in malaria parasites

Auteurs: Eva Hitz, Natalie Wiedemar, Armin Passecker, Beatriz A. S. Graça, Christian Scheurer, Sergio Wittlin, Nicolas M. B. Brancucci, Ioannis Vakonakis, Pascal Mäser, Till S. Voss
Publié dans: PLoS Biology, Numéro 19(12), 2021, ISSN 1545-7885
Éditeur: Plos
DOI: 10.1371/journal.pbio.3001483

A genome-wide map of DNA replication at single-molecule resolution in the malaria parasite Plasmodium falciparum

Auteurs: Francis Isidore Garcia Totañes, Jonas Gockel, Sarah E. Chapman, Richárd Bártfai, Michael A. Boemo, Catherine J. Merrick
Publié dans: Nucleic Acids Research, Numéro Volume 51, Numéro 6, 2023, Page(s) 2709-2724, ISSN 0305-1048
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkad093

m6A landscape is more pervasive when Trypanosoma brucei exits the cell cycle

Auteurs: Lúcia Serra, Sara Silva Pereira, Idálio J. Viegas, Henrique Machado, Lara López-Escobar, Luísa M. Figueiredo
Publié dans: Biomedical Journal, 2024, ISSN 0346-251X
Éditeur: Pergamon Press Ltd.
DOI: 10.1101/2024.02.23.581781

Continuous distribution of cancer cells in the cell cycle unveiled by AI-segmented imaging of 37,000 HeLa FUCCI cells

Auteurs: Hamid Cheraghi, Kinga Dóra Kovács, Inna Székács, Robert Horvath, Bálint Szabó
Publié dans: Heliyon, Numéro Volume 10, Numéro 9, 2024, ISSN 2405-8440
Éditeur: Londen: Elsevier Ltd.
DOI: 10.1016/j.heliyon.2024.e30239

The troubled puberty of malaria parasites

Auteurs: Jonas Gockel, Till S. Voss, Richárd Bártfai
Publié dans: Trends in Parasitology, Numéro Volume 39, Numéro 3, 2023, Page(s) 155-157, ISSN 1097-4172
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.pt.2023.01.006

Slow growing behavior in African trypanosomes during adipose tissue colonization

Auteurs: Sandra Trindade, Mariana de Niz, Mariana Costa-Sequeira, Tiago Bizarra-Rebelo, Fábio Bento, Mario Dejung, Marta Valido Narciso, Lara López-Escobar, João Ferreira, Falk Butter, Frédéric Bringaud, Erida Gjini, Luisa M. Figueiredo
Publié dans: Nature Communications, Numéro 13, Article number: 7548, 2022, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-022-34622-w

Other (2)

A systematic quantitative approach comprehensively defines domain-specific functional pathways linked to Schizosaccharomyces pombe heterochromatin regulation

Auteurs: Abubakar Muhammad, Zsuzsa Sarkadi, Thomas van Emden, Agnisrota Mazumder, Matias Capella, Gergely Fekete, Vishnu N. Suma Sreechakram, Bassem Al-Sady, Balázs Papp, Ramón Ramos Barrales, Sigurd Braun
Publié dans: bioRxiv, 2024
Éditeur: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2024.02.13.579970

High-resolution scRNA-seq reveals genomic determinants of antigen expression hierarchy in African Trypanosomes

Auteurs: Kirsty R McWilliam, Zhibek Keneskhanova, Raul O Cosentino, Atai Dobrynin, Jaclyn E Smith, Ines Subota, Monica R Mugnier, Maria Colome-Tatche, T Nicolai Siegel
Publié dans: bioRxiv, 2024
Éditeur: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2024.03.22.586247